RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP31.22■■■□□ 2.59
ACER3-211ENST00000531461 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP31.22■■■□□ 2.59
ACER3-211ENST00000531461 MPNDQ8N594 471 aa31.22■■■□□ 2.59
ACER3-211ENST00000531461 MBIPQ9NS73 344 aa31.22■■■□□ 2.59
ACER3-211ENST00000531461 ZNRF3Q9ULT6 936 aa31.22■■■□□ 2.59
ACER3-211ENST00000531461 KIAA2012Q0VF49 1180 aa31.2■■■□□ 2.59
ACER3-211ENST00000531461 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
ACER3-211ENST00000531461 TNS4Q8IZW8 715 aa31.2■■■□□ 2.59
ACER3-211ENST00000531461 RASSF10A6NK89 507 aa31.19■■■□□ 2.58
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ACER3-211ENST00000531461 IFT57Q9NWB7 429 aa31.19■■■□□ 2.58
ACER3-211ENST00000531461 VEGFBP49765 207 aa31.18■■■□□ 2.58
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ACER3-211ENST00000531461 GPRC5DQ9NZD1 345 aa31.18■■■□□ 2.58
ACER3-211ENST00000531461 TRPM7Q96QT4 1865 aa31.17■■■□□ 2.58
ACER3-211ENST00000531461 CDHR2Q9BYE9 1310 aa31.17■■■□□ 2.58
ACER3-211ENST00000531461 DUOX1Q9NRD9 1551 aa31.17■■■□□ 2.58
ACER3-211ENST00000531461 APAF1O14727 1248 aa31.16■■■□□ 2.58
ACER3-211ENST00000531461 GNAI1P63096 354 aa31.16■■■□□ 2.58
ACER3-211ENST00000531461 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
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ACER3-211ENST00000531461 DEFB115Q30KQ5 88 aa31.14■■■□□ 2.58
ACER3-211ENST00000531461 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa31.13■■■□□ 2.57
ACER3-211ENST00000531461 CIAPIN1Q6FI81 312 aa31.13■■■□□ 2.57
ACER3-211ENST00000531461 TNIP1Q15025 636 aa31.11■■■□□ 2.57
ACER3-211ENST00000531461 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
ACER3-211ENST00000531461 FOXN1O15353 648 aa31.09■■■□□ 2.57
ACER3-211ENST00000531461 GOLGA2Q08379 1002 aa31.09■■■□□ 2.57
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ACER3-211ENST00000531461 CHMP4AQ9BY43 222 aa31.09■■■□□ 2.57
ACER3-211ENST00000531461 WBP1LQ9NX94 342 aa31.09■■■□□ 2.57
ACER3-211ENST00000531461 PGAP2Q9UHJ9 254 aa31.09■■■□□ 2.57
ACER3-211ENST00000531461 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
ACER3-211ENST00000531461 RIC3Q7Z5B4 369 aa31.08■■■□□ 2.57
ACER3-211ENST00000531461 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
ACER3-211ENST00000531461 ZNF428Q96B54 188 aa31.08■■■□□ 2.57
ACER3-211ENST00000531461 PRDM10Q9NQV6 1147 aa31.08■■■□□ 2.57
ACER3-211ENST00000531461 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
ACER3-211ENST00000531461 YDJCA8MPS7 323 aa31.07■■■□□ 2.56
ACER3-211ENST00000531461 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
ACER3-211ENST00000531461 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
ACER3-211ENST00000531461 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
ACER3-211ENST00000531461 AIDAQ96BJ3 306 aa31.06■■■□□ 2.56
ACER3-211ENST00000531461 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
ACER3-211ENST00000531461 THSD7BQ9C0I4 1608 aa31.06■■■□□ 2.56
ACER3-211ENST00000531461 RAD17O75943 681 aa31.05■■■□□ 2.56
ACER3-211ENST00000531461 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
ACER3-211ENST00000531461 CST9Q5W186 159 aa31.05■■■□□ 2.56
ACER3-211ENST00000531461 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
ACER3-211ENST00000531461 COL4A1P02462 1669 aa31.05■■■□□ 2.56
ACER3-211ENST00000531461 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP31.04■■■□□ 2.56
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ACER3-211ENST00000531461 CCDC191Q8NCU4 936 aa31.04■■■□□ 2.56
ACER3-211ENST00000531461 BCL2L13Q9BXK5 485 aa31.04■■■□□ 2.56
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ACER3-211ENST00000531461 C8orf58Q8NAV2 365 aa31.03■■■□□ 2.56
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ACER3-211ENST00000531461 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
ACER3-211ENST00000531461 DPF2Q92785 391 aa31.02■■■□□ 2.56
ACER3-211ENST00000531461 POLLQ9UGP5 575 aa31.02■■■□□ 2.56
ACER3-211ENST00000531461 CCDC30Q5VVM6 783 aa31.01■■■□□ 2.55
ACER3-211ENST00000531461 TLL2Q9Y6L7 1015 aa31.01■■■□□ 2.55
ACER3-211ENST00000531461 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
ACER3-211ENST00000531461 ECE1P42892 770 aa31■■■□□ 2.55
ACER3-211ENST00000531461 GPSM2P81274 684 aa31■■■□□ 2.55
ACER3-211ENST00000531461 EYA3Q99504 573 aa31■■■□□ 2.55
ACER3-211ENST00000531461 MYD88Q99836 296 aa31■■■□□ 2.55
ACER3-211ENST00000531461 PODXL2Q9NZ53 605 aa31■■■□□ 2.55
ACER3-211ENST00000531461 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
ACER3-211ENST00000531461 DDX58O95786 925 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
ACER3-211ENST00000531461 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
ACER3-211ENST00000531461 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
ACER3-211ENST00000531461 C6orf229H3BNL8 230 aa30.98■■■□□ 2.55
ACER3-211ENST00000531461 H7C1D1 291 aa30.98■■■□□ 2.55
ACER3-211ENST00000531461 CCDC27Q2M243 656 aa30.98■■■□□ 2.55
ACER3-211ENST00000531461 CAPNS2Q96L46 248 aa30.98■■■□□ 2.55
ACER3-211ENST00000531461 TBC1D16Q8TBP0 767 aa30.97■■■□□ 2.55
ACER3-211ENST00000531461 TRPM4Q8TD43 1214 aa30.97■■■□□ 2.55
ACER3-211ENST00000531461 DBNDD1Q9H9R9 158 aa30.97■■■□□ 2.55
ACER3-211ENST00000531461 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
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ACER3-211ENST00000531461 PDE8AO60658 829 aa30.96■■■□□ 2.55
ACER3-211ENST00000531461 CAPN15O75808 1086 aa30.96■■■□□ 2.55
ACER3-211ENST00000531461 RPS12P25398 132 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
ACER3-211ENST00000531461 CCDC152Q4G0S7 254 aa30.96■■■□□ 2.55
ACER3-211ENST00000531461 CDC37L1Q7L3B6 337 aa30.96■■■□□ 2.55
ACER3-211ENST00000531461 MICALL2Q8IY33 904 aa30.96■■■□□ 2.55
ACER3-211ENST00000531461 HHIPL1Q96JK4 782 aa30.96■■■□□ 2.55
ACER3-211ENST00000531461 SAPCD2Q86UD0 394 aa30.95■■■□□ 2.55
ACER3-211ENST00000531461 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
ACER3-211ENST00000531461 RIMBP2O15034 1052 aa30.94■■■□□ 2.54
ACER3-211ENST00000531461 ECE2O60344 883 aa30.94■■■□□ 2.54
ACER3-211ENST00000531461 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
ACER3-211ENST00000531461 TSPYL6Q8N831 410 aa30.94■■■□□ 2.54
ACER3-211ENST00000531461 SEC31BQ9NQW1 1179 aa30.94■■■□□ 2.54
ACER3-211ENST00000531461 CELF2O95319 508 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
ACER3-211ENST00000531461 CYP4F22Q6NT55 531 aa30.93■■■□□ 2.54
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