RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518564.1

PPP2CB-204, Transcript of protein phosphatase 2 catalytic subunit beta, human

TSL 3 BASIC

Gene PPP2CB, Length 691 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP2CB-204	ENST00000518564	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	40.36	■■■■■ 4.05
PPP2CB-204	ENST00000518564	TMC4	Q7Z404	712 aa		40.36	■■■■■ 4.05
PPP2CB-204	ENST00000518564	SP8	Q8IXZ3	490 aa		40.35	■■■■■ 4.05
PPP2CB-204	ENST00000518564	FSTL1	Q12841	308 aa		40.34	■■■■■ 4.05
PPP2CB-204	ENST00000518564	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	40.34	■■■■■ 4.05
PPP2CB-204	ENST00000518564	ZNF521	Q96K83	1311 aa		40.34	■■■■■ 4.05
PPP2CB-204	ENST00000518564	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		40.33	■■■■■ 4.05
PPP2CB-204	ENST00000518564	CCER2	I3L3R5	266 aa		40.33	■■■■■ 4.05
PPP2CB-204	ENST00000518564	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		40.33	■■■■■ 4.05
PPP2CB-204	ENST00000518564	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		40.33	■■■■■ 4.05
PPP2CB-204	ENST00000518564	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		40.33	■■■■■ 4.05
PPP2CB-204	ENST00000518564	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	40.32	■■■■■ 4.05
PPP2CB-204	ENST00000518564	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		40.31	■■■■■ 4.04
PPP2CB-204	ENST00000518564	FZD9	O00144	591 aa		40.3	■■■■■ 4.04
PPP2CB-204	ENST00000518564	MPND	Q8N594	471 aa		40.3	■■■■■ 4.04
PPP2CB-204	ENST00000518564	POTEC	B2RU33	542 aa		40.29	■■■■■ 4.04
PPP2CB-204	ENST00000518564	PPIP5K2	O43314	1243 aa		40.29	■■■■■ 4.04
PPP2CB-204	ENST00000518564	IGKV5-2	P06315	115 aa		40.29	■■■■■ 4.04
PPP2CB-204	ENST00000518564	COL4A5	P29400	1685 aa		40.29	■■■■■ 4.04
PPP2CB-204	ENST00000518564	SCN4A	P35499	1836 aa		40.29	■■■■■ 4.04
PPP2CB-204	ENST00000518564	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		40.28	■■■■■ 4.04
PPP2CB-204	ENST00000518564	PDE8A	O60658	829 aa		40.28	■■■■■ 4.04
PPP2CB-204	ENST00000518564	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	40.28	■■■■■ 4.04
PPP2CB-204	ENST00000518564	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		40.27	■■■■■ 4.04
PPP2CB-204	ENST00000518564	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	40.27	■■■■■ 4.04
PPP2CB-204	ENST00000518564	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	40.27	■■■■■ 4.04
PPP2CB-204	ENST00000518564	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		40.27	■■■■■ 4.04
PPP2CB-204	ENST00000518564	NIM1K	Q8IY84	436 aa		40.27	■■■■■ 4.04
PPP2CB-204	ENST00000518564	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	40.27	■■■■■ 4.04
PPP2CB-204	ENST00000518564	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	40.27	■■■■■ 4.04
PPP2CB-204	ENST00000518564	VPS33B	Q9H267	617 aa		40.27	■■■■■ 4.04
PPP2CB-204	ENST00000518564	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		40.26	■■■■■ 4.04
PPP2CB-204	ENST00000518564	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	40.26	■■■■■ 4.04
PPP2CB-204	ENST00000518564	AOC3	Q16853	763 aa		40.25	■■■■■ 4.03
PPP2CB-204	ENST00000518564	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		40.25	■■■■■ 4.03
PPP2CB-204	ENST00000518564	APLP1	P51693	650 aa		40.24	■■■■■ 4.03
PPP2CB-204	ENST00000518564	MYH3	P11055	1940 aa		40.24	■■■■■ 4.03
PPP2CB-204	ENST00000518564	GPC2	Q8N158	579 aa		40.23	■■■■■ 4.03
PPP2CB-204	ENST00000518564	COL4A1	P02462	1669 aa		40.22	■■■■■ 4.03
PPP2CB-204	ENST00000518564		E9PSI1	815 aa		40.21	■■■■■ 4.03
PPP2CB-204	ENST00000518564	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		40.21	■■■■■ 4.03
PPP2CB-204	ENST00000518564	CEP350	Q5VT06	3117 aa		40.2	■■■■■ 4.03
PPP2CB-204	ENST00000518564	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	40.2	■■■■■ 4.03
PPP2CB-204	ENST00000518564	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	40.19	■■■■■ 4.02
PPP2CB-204	ENST00000518564	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		40.19	■■■■■ 4.02
PPP2CB-204	ENST00000518564	CTSW	P56202	376 aa		40.18	■■■■■ 4.02
PPP2CB-204	ENST00000518564	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		40.18	■■■■■ 4.02
PPP2CB-204	ENST00000518564	LINS1	Q8NG48	757 aa		40.18	■■■■■ 4.02
PPP2CB-204	ENST00000518564	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		40.18	■■■■■ 4.02
PPP2CB-204	ENST00000518564	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	40.18	■■■■■ 4.02
PPP2CB-204	ENST00000518564	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		40.17	■■■■■ 4.02
PPP2CB-204	ENST00000518564	HACL1	Q9UJ83	578 aa		40.17	■■■■■ 4.02
PPP2CB-204	ENST00000518564	GCKR	Q14397	625 aa		40.16	■■■■■ 4.02
PPP2CB-204	ENST00000518564	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	40.15	■■■■■ 4.02
PPP2CB-204	ENST00000518564		H7C1W4	665 aa		40.13	■■■■■ 4.01
PPP2CB-204	ENST00000518564	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		40.13	■■■■■ 4.01
PPP2CB-204	ENST00000518564	LTBP1	Q14766	1721 aa		40.13	■■■■■ 4.01
PPP2CB-204	ENST00000518564		F6X3S4	739 aa		40.12	■■■■■ 4.01
PPP2CB-204	ENST00000518564	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		40.12	■■■■■ 4.01
PPP2CB-204	ENST00000518564	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	40.11	■■■■■ 4.01
PPP2CB-204	ENST00000518564	GPSM2	P81274	684 aa		40.11	■■■■■ 4.01
PPP2CB-204	ENST00000518564	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	40.11	■■■■■ 4.01
PPP2CB-204	ENST00000518564	C6orf229	H3BNL8	230 aa		40.1	■■■■■ 4.01
PPP2CB-204	ENST00000518564	EPHX2	P34913	555 aa		40.1	■■■■■ 4.01
PPP2CB-204	ENST00000518564	CHADL	Q6NUI6	762 aa		40.1	■■■■■ 4.01
PPP2CB-204	ENST00000518564	SLFN5	Q08AF3	891 aa		40.09	■■■■■ 4.01
PPP2CB-204	ENST00000518564	WASHC4	Q2M389	1173 aa		40.09	■■■■■ 4.01
PPP2CB-204	ENST00000518564	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	40.09	■■■■■ 4.01
PPP2CB-204	ENST00000518564	LDHD	Q86WU2	507 aa		40.09	■■■■■ 4.01
PPP2CB-204	ENST00000518564	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		40.09	■■■■■ 4.01
PPP2CB-204	ENST00000518564	SPEF2	Q9C093	1822 aa		40.08	■■■■■ 4.01
PPP2CB-204	ENST00000518564	POTEI	P0CG38	1075 aa		40.08	■■■■■ 4.01
PPP2CB-204	ENST00000518564	POTEJ	P0CG39	1038 aa		40.08	■■■■■ 4.01
PPP2CB-204	ENST00000518564	EYA3	Q99504	573 aa		40.08	■■■■■ 4.01
PPP2CB-204	ENST00000518564	RTL9	Q8NET4	1388 aa		40.08	■■■■■ 4.01
PPP2CB-204	ENST00000518564	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	40.07	■■■■■ 4.01
PPP2CB-204	ENST00000518564	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		40.07	■■■■■ 4.01
PPP2CB-204	ENST00000518564	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	40.06	■■■■■ 4
PPP2CB-204	ENST00000518564	GREM2	Q9H772	168 aa		40.06	■■■■■ 4
PPP2CB-204	ENST00000518564	BEND3	Q5T5X7	828 aa		40.05	■■■■■ 4
PPP2CB-204	ENST00000518564	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		40.05	■■■■■ 4
PPP2CB-204	ENST00000518564	POLL	Q9UGP5	575 aa		40.05	■■■■■ 4
PPP2CB-204	ENST00000518564	CXCL9	Q07325	125 aa		40.04	■■■■■ 4
PPP2CB-204	ENST00000518564	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		40.04	■■■■■ 4
PPP2CB-204	ENST00000518564	CASP7	P55210	303 aa		40.03	■■■■■ 4
PPP2CB-204	ENST00000518564	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		40.03	■■■■■ 4
PPP2CB-204	ENST00000518564	RIMBP2	O15034	1052 aa		40.02	■■■■■ 4
PPP2CB-204	ENST00000518564	UFL1	O94874	794 aa		40.02	■■■■■ 4
PPP2CB-204	ENST00000518564	SCNN1D	P51172	638 aa		40.02	■■■■■ 4
PPP2CB-204	ENST00000518564	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		40.02	■■■■■ 4
PPP2CB-204	ENST00000518564	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		40.02	■■■■■ 4
PPP2CB-204	ENST00000518564	GGA1	Q9UJY5	639 aa		40.02	■■■■■ 4
PPP2CB-204	ENST00000518564	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		40.02	■■■■■ 4
PPP2CB-204	ENST00000518564	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		40.02	■■■■■ 4
PPP2CB-204	ENST00000518564	TNIP1	Q15025	636 aa		40.01	■■■■■ 4
PPP2CB-204	ENST00000518564	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		40.01	■■■■■ 4
PPP2CB-204	ENST00000518564	XDH	P47989	1333 aa		40	■■■■□ 3.99
PPP2CB-204	ENST00000518564	RAD17	O75943	681 aa		39.99	■■■■□ 3.99
PPP2CB-204	ENST00000518564	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		39.99	■■■■□ 3.99
PPP2CB-204	ENST00000518564	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	39.98	■■■■□ 3.99

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