RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495879.1

PTPRG-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRG, Length 3,011 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-207ENST00000495879 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 NPHP1O15259 732 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 PDCP20941 246 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 GUCY1B3Q02153 619 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 MYL6BP14649 208 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 USP16Q9Y5T5 823 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 EID1Q9Y6B2 187 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 NWD1Q149M9 1564 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 FGD1P98174 961 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 KSR2Q6VAB6 950 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 Q6ZUG5 572 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 GRM8O00222 908 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 MTX1Q13505 466 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 RNF20Q5VTR2 975 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 ELP1O95163 1332 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 KCNA6P17658 529 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 SLC39A6Q13433 755 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 AGLP35573 1532 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 TAF5LO75529 589 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 COL15A1P39059 1388 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 LRRC37A3O60309 1634 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 PIK3C2AO00443 1686 aa22.02■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 A0A0G2JLW4 131 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 RESTQ13127 1097 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 CHST3Q7LGC8 479 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 ANKRD1Q15327 319 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 NEK1Q96PY6 1258 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 DIP2BQ9P265 1576 aa22■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 SMTNL1A8MU46 457 aa22■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 GTF3C6Q969F1 213 aa22■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 CEP135Q66GS9 1140 aa22■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 ALDH1L1O75891 902 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 IGKV5-2P06315 115 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 SCRN1Q12765 414 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 RNMTO43148 476 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 CYP21A2P08686 494 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 BECN2A8MW95 431 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 HIP1O00291 1037 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 SKILP12757 684 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 IP6K1Q92551 441 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 APOBRQ0VD83 1088 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 TFCP2Q12800 502 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 LRRC8AQ8IWT6 810 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 LINS1Q8NG48 757 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 IQCB1Q15051 598 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 MYD88Q99836 296 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 MED23Q9ULK4 1368 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 STOX1Q6ZVD7 989 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 USP28Q96RU2 1077 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 HOXB7P09629 217 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 DBNDD2Q9BQY9 259 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRG-207ENST00000495879 CCDC69A6NI79 296 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 AOPEPQ8N6M6 819 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 DIP2AQ14689 1571 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 ME1P48163 572 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 ADD1P35611 737 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms