RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490444.2

PUM3-204, Transcript of pumilio RNA binding family member 3, human

TSL 5

Gene PUM3, Length 340 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM3-204	ENST00000490444	CEP41	Q9BYV8	373 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM3-204	ENST00000490444	COG6	Q9Y2V7	657 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUM3-204	ENST00000490444	HMX2	A2RU54	273 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM3-204	ENST00000490444	MAP3K6	O95382	1288 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM3-204	ENST00000490444	PRNP	P04156	253 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM3-204	ENST00000490444	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PUM3-204	ENST00000490444	EPHA4	P54764	986 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM3-204	ENST00000490444	CCIN	Q13939	588 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM3-204	ENST00000490444	ZNF124	Q15973	351 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM3-204	ENST00000490444	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM3-204	ENST00000490444	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	5.03	□□□□□ -1.6
PUM3-204	ENST00000490444	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM3-204	ENST00000490444	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM3-204	ENST00000490444	SUSD3	Q96L08	255 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM3-204	ENST00000490444	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUM3-204	ENST00000490444	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	NFKB1	P19838	968 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	IRF5	Q13568	498 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	POTEA	Q6S8J7	498 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444		A6NJR5	290 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	VAC14	Q08AM6	782 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	MYRFL	Q96LU7	910 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	PIM2	Q9P1W9	311 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		5	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	ABL2	P42684	1182 aa		5	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	GPLD1	P80108	840 aa		5	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	SEMA3F	Q13275	785 aa		5	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	SETDB1	Q15047	1291 aa		5	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	PKN1	Q16512	942 aa		5	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	HIF1A	Q16665	826 aa		5	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	MSMP	Q1L6U9	139 aa		5	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	WASHC4	Q2M389	1173 aa		5	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	LILRA6	Q6PI73	481 aa		5	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		5	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		5	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		5	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		5	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	ZNF358	Q9NW07	568 aa		5	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444		B8ZZF3	427 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	COL19A1	Q14993	1142 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	PAPLN	O95428	1278 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	SOX11	P35716	441 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	ZMYND15	Q9H091	742 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	WDR64	B1ANS9	1081 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	IER5	Q5VY09	327 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	C14orf37	Q86TY3	774 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUM3-204	ENST00000490444	FOSL1	P15407	271 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	NRL	P54845	237 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	EML3	Q32P44	896 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	BEND4	Q6ZU67	534 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	TNS4	Q8IZW8	715 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	MUC3B	Q9H195	1237 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	POM121C	A8CG34	1229 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	BIN1	O00499	593 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	RAD21	O60216	631 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	ACAD11	Q709F0	780 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	KSR1	Q8IVT5	923 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	ATG3	Q9NT62	314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	ZFAT	Q9P243	1243 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	NOD1	Q9Y239	953 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	WISP1	O95388	367 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	SKI	P12755	728 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	EPB42	P16452	691 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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