RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 NFKB1P19838 968 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 TARSP26639 723 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 EHHADHQ08426 723 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 PDE3BQ13370 1112 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF438Q7Z4V0 828 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 DMRTB1Q96MA1 342 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 PNMA5Q96PV4 448 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 NIF3L1Q9GZT8 377 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 MBIPQ9NS73 344 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 ZFATQ9P243 1243 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 TREHO43280 583 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 RARAP10276 462 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 NLRP13Q86W25 1043 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 NPAS4Q8IUM7 802 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 RGS22Q8NE09 1264 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 ELP3Q9H9T3 547 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 C11orf16Q9NQ32 467 aa5.71□□□□□ -1.5
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RABGGTB-211ENST00000489450 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 TNFRSF21O75509 655 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 ORC1Q13415 861 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 DSC3Q14574 896 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 XKR5Q6UX68 686 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
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RABGGTB-211ENST00000489450 PRR12Q9ULL5 1215 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 ADAMTS8Q9UP79 889 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 IGF1RP08069 1367 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 MMP20O60882 483 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 P4HBP07237 508 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 PLCB3Q01970 1234 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 RASSF7Q02833 373 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 SYT9Q86SS6 491 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM151AQ8N4L1 468 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 C1orf127Q8N9H9 656 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 SNX29Q8TEQ0 813 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 CHRDQ9H2X0 955 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 CNTN3Q9P232 1028 aa5.69□□□□□ -1.5
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RABGGTB-211ENST00000489450 GDF11O95390 407 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 ERCC3P19447 782 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 MAPK8P45983 427 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 MAP2K3P46734 347 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 NEUROD1Q13562 356 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 KLF15Q9UIH9 416 aa5.68□□□□□ -1.5
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RABGGTB-211ENST00000489450 EREGO14944 169 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 ARAFP10398 606 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 USPL1Q5W0Q7 1092 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 OR13H1Q8NG92 308 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 CSRNP1Q96S65 589 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 SETDB2Q96T68 719 aa5.67□□□□□ -1.5
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RABGGTB-211ENST00000489450 IGFLR1Q9H665 355 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 EFCC1Q9HA90 598 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 KANSL3Q9P2N6 904 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 NEURL1BA8MQ27 555 aa5.66□□□□□ -1.5
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RABGGTB-211ENST00000489450 SIN3BO75182 1162 aa5.66□□□□□ -1.5
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RABGGTB-211ENST00000489450 ADAMTS2O95450 1211 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 PSAPP07602 524 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 CES1P23141 567 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 ADH6P28332 368 aa5.66□□□□□ -1.5
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RABGGTB-211ENST00000489450 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
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RABGGTB-211ENST00000489450 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 FBXO33Q7Z6M2 555 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 FCHSD1Q86WN1 690 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 WHAMMQ8TF30 809 aa5.66□□□□□ -1.5
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RABGGTB-211ENST00000489450 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 GGA1Q9UJY5 639 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 WWC3Q9ULE0 1092 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 PHF20L1A8MW92 1017 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 ZBTB42B2RXF5 422 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 ARHGEF15O94989 841 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 NEFLP07196 543 aa5.65□□□□□ -1.5
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