RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 OFD1O75665 1012 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 CHGBP05060 677 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 DBNDD2Q9BQY9 259 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 MRC1P22897 1456 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 LMBR1LQ6UX01 489 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 CDC37L1Q7L3B6 337 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 HMG20BQ9P0W2 317 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 GIMAP6Q6P9H5 292 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 COL18A1P39060 1754 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 USP25Q9UHP3 1055 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 COL15A1P39059 1388 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 FAM173BQ6P4H8 233 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 TNS3Q68CZ2 1445 aa20.14■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 PDCP20941 246 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 MPNDQ8N594 471 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 CASP7P55210 303 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 KRT85P78386 507 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 UVSSAQ2YD98 709 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 JCADQ9P266 1359 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 NBPF26B4DH59 902 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 MCM5P33992 734 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 KRT32Q14532 448 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 TSGA10IPQ3SY00 556 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 NBPF14Q5TI25 921 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 NBPF15Q8N660 670 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 HAUS7Q99871 368 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 USPL1Q5W0Q7 1092 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 CADPS2Q86UW7 1296 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 NEK1Q96PY6 1258 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 ZNF609O15014 1411 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 TPM2P07951 284 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 FOXO4P98177 505 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 PLCB2Q00722 1185 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 TTC6Q86TZ1 520 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 ADCY5O95622 1261 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 A1BGP04217 495 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 Q6ZUG5 572 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 GOLIM4O00461 696 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 TIMM10P62072 90 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.816e-21■■■□□ 14.8
ACTB-207ENST00000462494 ABCC6O95255 1503 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 PKD1L3Q7Z443 1732 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 H7C1W4 665 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 JAK2O60674 1132 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 CYP21A2P08686 494 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 FGD1P98174 961 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 SLFNL1Q499Z3 407 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 LRRC2Q9BYS8 371 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 KBTBD3Q8NAB2 608 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 FUCA2Q9BTY2 467 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-207ENST00000462494 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.08■□□□□ 0.8
ACTB-207ENST00000462494 PRDM11Q9NQV5 511 aa20.08■□□□□ 0.8
ACTB-207ENST00000462494 DCCP43146 1447 aa20.08■□□□□ 0.8
ACTB-207ENST00000462494 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-207ENST00000462494 CAMK4Q16566 473 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-207ENST00000462494 GTF3C6Q969F1 213 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-207ENST00000462494 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
ACTB-207ENST00000462494 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
ACTB-207ENST00000462494 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-207ENST00000462494 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-207ENST00000462494 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-207ENST00000462494 RFX7Q2KHR2 1363 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-207ENST00000462494 SPATA32Q96LK8 384 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-207ENST00000462494 STRCP1A6NGW2 1772 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-207ENST00000462494 KDM4AO75164 1064 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-207ENST00000462494 LIG1P18858 919 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-207ENST00000462494 LRRC24Q50LG9 513 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-207ENST00000462494 BRF1Q92994 677 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-207ENST00000462494 DDX11Q96FC9 970 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-207ENST00000462494 CPDO75976 1380 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-207ENST00000462494 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-207ENST00000462494 CCDC192P0DO97 292 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-207ENST00000462494 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.05■□□□□ 0.8
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