RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.72■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 LIG1P18858 919 aa21.72■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT85P78386 507 aa21.72■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 MAP4K1Q92918 833 aa21.72■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 TAF6LQ9Y6J9 622 aa21.72■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC186Q7Z3E2 898 aa21.71■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 LUZP1Q86V48 1076 aa21.71■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 ERC1Q8IUD2 1116 aa21.71■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.71■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.71■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC27A2O14975 620 aa21.7■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 SYCP1Q15431 976 aa21.7■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.7■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.7■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 LMO7Q8WWI1 1683 aa21.69■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A0D9SFI3 127 aa21.69■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 SASH1O94885 1247 aa21.69■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 SMTNL1A8MU46 457 aa21.69■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 RNMTO43148 476 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 LRMPQ12912 555 aa21.69■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.69■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 CKAP2LQ8IYA6 745 aa21.69■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 OGFRQ9NZT2 677 aa21.69■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa21.69■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 ALDH1L1O75891 902 aa21.68■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 KSR2Q6VAB6 950 aa21.68■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.68■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 CBX8Q9HC52 389 aa21.68■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 ELP1O95163 1332 aa21.68■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 KAZALD1Q96I82 304 aa21.68■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 SUCLG2Q96I99 432 aa21.68■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 BOLA2Q9H3K6 86 aa21.67■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 DACT1Q9NYF0 836 aa21.67■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 NRBP1Q9UHY1 535 aa21.67■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 PSMA5P28066 241 aa21.67■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 ANO6Q4KMQ2 910 aa21.67■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 DRC7Q8IY82 874 aa21.67■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 SIL1Q9H173 461 aa21.67■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 SLAIN2Q9P270 581 aa21.67■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 COL18A1P39060 1754 aa21.66■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 STK3Q13188 491 aa21.66■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.66■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 PLA2G4DQ86XP0 818 aa21.66■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 FSD1Q9BTV5 496 aa21.66■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.66■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF75DP51815 510 aa21.66■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.66■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 TNMDQ9H2S6 317 aa21.66■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.66■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 PDCP20941 246 aa21.65■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 GRM8O00222 908 aa21.65■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 HIP1O00291 1037 aa21.65■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 IGSF3O75054 1194 aa21.65■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 TNNT1P13805 278 aa21.65■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.65■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.65■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 SPATA32Q96LK8 384 aa21.65■■□□□ 1.06
RALGPS1-208ENST00000424082 RPS6KB1P23443 525 aa21.64■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM5Q9C035 493 aa21.64■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.63■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF20Q5VTR2 975 aa21.63■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.63■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 SNRKQ9NRH2 765 aa21.63■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa21.63■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 MEGF6O75095 1541 aa21.62■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 MED23Q9ULK4 1368 aa21.62■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD1Q15327 319 aa21.62■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 LINS1Q8NG48 757 aa21.62■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 CLSTN2Q9H4D0 955 aa21.61■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.61■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 NR1I2O75469 434 aa21.6■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC112Q8NEF3 446 aa21.6■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 JAK2O60674 1132 aa21.6■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
RALGPS1-208ENST00000424082 TATP17735 454 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 205 ms