RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-208ENST00000392449 TSPYL6Q8N831 410 aa21.49■■□□□ 1.03
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PTPRK-208ENST00000392449 CREBZFQ9NS37 354 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRK-208ENST00000392449 EPS15P42566 896 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRK-208ENST00000392449 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PTPRK-208ENST00000392449 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRK-208ENST00000392449 SP8Q8IXZ3 490 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRK-208ENST00000392449 LRRC37AA6NMS7 1700 aa21.48■■□□□ 1.03
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PTPRK-208ENST00000392449 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
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PTPRK-208ENST00000392449 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.03
PTPRK-208ENST00000392449 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.03
PTPRK-208ENST00000392449 MYD88Q99836 296 aa21.45■■□□□ 1.03
PTPRK-208ENST00000392449 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-208ENST00000392449 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
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PTPRK-208ENST00000392449 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-208ENST00000392449 CNTROBQ8N137 903 aa21.45■■□□□ 1.02
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PTPRK-208ENST00000392449 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PTPRK-208ENST00000392449 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
PTPRK-208ENST00000392449 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PTPRK-208ENST00000392449 SUPT20HQ8NEM7 779 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRK-208ENST00000392449 ZNRF3Q9ULT6 936 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRK-208ENST00000392449 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.43■■□□□ 1.02
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PTPRK-208ENST00000392449 RAD17O75943 681 aa21.42■■□□□ 1.02
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PTPRK-208ENST00000392449 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.41■■□□□ 1.02
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PTPRK-208ENST00000392449 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRK-208ENST00000392449 VPS33BQ9H267 617 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRK-208ENST00000392449 MRS2Q9HD23 443 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRK-208ENST00000392449 CNTNAP1P78357 1384 aa21.41■■□□□ 1.02
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PTPRK-208ENST00000392449 GPRC5DQ9NZD1 345 aa21.4■■□□□ 1.02
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PTPRK-208ENST00000392449 GPSM2P81274 684 aa21.39■■□□□ 1.02
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PTPRK-208ENST00000392449 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa21.39■■□□□ 1.02
PTPRK-208ENST00000392449 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
PTPRK-208ENST00000392449 SHTN1A0MZ66 631 aa21.39■■□□□ 1.01
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PTPRK-208ENST00000392449 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
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PTPRK-208ENST00000392449 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PTPRK-208ENST00000392449 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa21.36■■□□□ 1.01
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PTPRK-208ENST00000392449 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
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PTPRK-208ENST00000392449 KCNQ5Q9NR82 932 aa21.34■■□□□ 1.01
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PTPRK-208ENST00000392449 TBC1D16Q8TBP0 767 aa21.33■■□□□ 1.01
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PTPRK-208ENST00000392449 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
PTPRK-208ENST00000392449 TNIP1Q15025 636 aa21.32■■□□□ 1
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PTPRK-208ENST00000392449 PSMD14O00487 310 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-208ENST00000392449 SLC4A2P04920 1241 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-208ENST00000392449 CCDC152Q4G0S7 254 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-208ENST00000392449 CST9Q5W186 159 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-208ENST00000392449 RTL9Q8NET4 1388 aa21.31■■□□□ 1
PTPRK-208ENST00000392449 IL16Q14005 1332 aa21.31■■□□□ 1
PTPRK-208ENST00000392449 RASSF10A6NK89 507 aa21.31■■□□□ 1
PTPRK-208ENST00000392449 ECE2O60344 883 aa21.31■■□□□ 1
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