RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 TRPM4Q8TD43 1214 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 TTC9Q92623 222 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 ZFATQ9P243 1243 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 MICAL2O94851 1124 aa8.88□□□□□ -0.99
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PTPRK-202ENST00000368205 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.88□□□□□ -0.99
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PTPRK-202ENST00000368205 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
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PTPRK-202ENST00000368205 IREB2P48200 963 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
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PTPRK-202ENST00000368205 COL26A1Q96A83 441 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 PLD4Q96BZ4 506 aa8.76□□□□□ -1.01
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PTPRK-202ENST00000368205 MEGF10Q96KG7 1140 aa8.74□□□□□ -1.01
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PTPRK-202ENST00000368205 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa8.73□□□□□ -1.01
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PTPRK-202ENST00000368205 NLRP13Q86W25 1043 aa8.72□□□□□ -1.01
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PTPRK-202ENST00000368205 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 DCAF11Q8TEB1 546 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 RBSNQ9H1K0 784 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-202ENST00000368205 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 NBPF11Q86T75 865 aa8.71□□□□□ -1.02
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