RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365172.1

SNORD49B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 49B, humanhuman

BASIC

Gene SNORD49B, Length 72 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD49B-201ENST00000365172 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 AGBL5Q8NDL9 886 aa0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 CXorf38Q8TB03 319 aa0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 NLRP7Q8WX94 980 aa0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 FAM168AQ92567 244 aa0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 TNFRSF25Q93038 417 aa0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 VWCEQ96DN2 955 aa0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 SLC10A4Q96EP9 437 aa0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 SLC4A9Q96Q91 983 aa0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 PPP1R16BQ96T49 567 aa0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 PHOX2BQ99453 314 aa0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 DBNDD2Q9BQY9 259 aa0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 RUBCNLQ9H714 662 aa0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 C7orf69Q9H7B7 122 aa0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 GPAMQ9HCL2 828 aa0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 SRRDQ9UH36 339 aa0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 PCDHGC3Q9UN70 934 aa0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 MYO9AB2RTY4 2548 aa0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 FBN2P35556 2912 aa0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 LAMA3Q16787 3333 aa0.26□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 DNAH12Q6ZR08 3092 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 RGS12O14924 1447 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 A0A1W2PRU2 124 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 SPDYE5A6NIY4 337 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 CCDC85CA6NKD9 419 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 ESPNB1AK53 854 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 F8W735 103 aaPredicted RBP0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 C6orf229H3BNL8 230 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 ERVH48-1M5A8F1 160 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 MEN1O00255 615 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 GPR37O15354 613 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 EFSO43281 561 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 LILRB5O75023 590 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 KRTAP5-8O75690 187 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 MED14OSP0DP75 135 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 FDX1P10109 184 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 CHGAP10645 457 aaKnown RBP0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 SKIP12755 728 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 FOSL1P15407 271 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 ATP4AP20648 1035 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 MSX1P28360 303 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 CTHP32929 405 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 ADH7P40394 386 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 TNP2Q05952 138 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 CLN3Q13286 438 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 MTMR2Q13614 643 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 HIC1Q14526 733 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 E2F4Q16254 413 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 GRIK5Q16478 980 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 UVSSAQ2YD98 709 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 NBPF20Q3BBV1 942 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 ZNF792Q3KQV3 632 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 SPATS1Q496A3 300 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 C4orf17Q53FE4 359 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 SLC27A3Q5K4L6 730 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 TRAPPC3LQ5T215 181 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 SAMD5Q5TGI4 173 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 RNF43Q68DV7 783 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 IGF2-ASQ6U949 168 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 PRR23BQ6ZRT6 265 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 SYT9Q86SS6 491 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 NLRP8Q86W28 1048 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 FBXO11Q86XK2 927 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 ANKLE2Q86XL3 938 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 TP53INP2Q8IXH6 220 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 ARMC10Q8N2F6 343 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 PGBD3Q8N328 593 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 TMEM130Q8N3G9 435 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 SLC16A11Q8NCK7 471 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 GLIS3Q8NEA6 775 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 ARMC2Q8NEN0 867 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 FLCNQ8NFG4 579 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 PRR7Q8TB68 274 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 SHKBP1Q8TBC3 707 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 PIK3R5Q8WYR1 880 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP0.25□□□□□ -2.37
SNORD49B-201ENST00000365172 GCC1Q96CN9 775 aa0.25□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms