RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329276.9

NOP56-201, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOP56, Length 2,400 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-201ENST00000329276 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
NOP56-201ENST00000329276 USP16Q9Y5T5 823 aa22.66■■□□□ 1.22
NOP56-201ENST00000329276 FHOD1Q9Y613 1164 aa22.66■■□□□ 1.22
NOP56-201ENST00000329276 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.65■■□□□ 1.22
NOP56-201ENST00000329276 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
NOP56-201ENST00000329276 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
NOP56-201ENST00000329276 RESTQ13127 1097 aa22.65■■□□□ 1.22
NOP56-201ENST00000329276 CCDC93Q567U6 631 aa22.65■■□□□ 1.22
NOP56-201ENST00000329276 TEX35Q5T0J7 233 aa22.65■■□□□ 1.22
NOP56-201ENST00000329276 CAPN2P17655 700 aa22.64■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.64■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 ADCY9O60503 1353 aa22.64■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.63■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 MTX1Q13505 466 aa22.63■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.63■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 NECTIN2Q92692 538 aa22.63■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 ST7Q9NRC1 585 aa22.63■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 NRDCO43847 1150 aa22.62■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.62■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.62■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.62■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.62■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.62■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 CLCN6P51797 869 aa22.62■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa22.62■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 FLT4P35916 1363 aa22.62■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 TPM4P67936 248 aa22.61■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.61■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.61■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.61■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 ATP8B1O43520 1251 aa22.61■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 SBNO1A3KN83 1393 aa22.61■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.214e-8■■■□□ 18.6
NOP56-201ENST00000329276 CCP110O43303 1012 aa22.6■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 ATL3Q6DD88 541 aa22.6■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.6■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 GTF3C6Q969F1 213 aa22.6■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 H3BQV1 296 aa22.59■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.216e-9■□□□□ 9.3
NOP56-201ENST00000329276 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 IFFO2Q5TF58 517 aa22.59■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.59■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 TXLNBQ8N3L3 684 aa22.59■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa22.59■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 TNRQ92752 1358 aa22.59■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 KINO60870 393 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 KRT32Q14532 448 aa22.59■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.59■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 USP6P35125 1406 aa22.59■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 METP08581 1390 aa22.58■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 JCADQ9P266 1359 aa22.58■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 TMCO3Q6UWJ1 677 aa22.58■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 BRF1Q92994 677 aa22.58■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.58■■□□□ 1.21
NOP56-201ENST00000329276 TPM1P09493 284 aa22.58■■□□□ 1.2
NOP56-201ENST00000329276 PLA2G4AP47712 749 aa22.58■■□□□ 1.2
NOP56-201ENST00000329276 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
NOP56-201ENST00000329276 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa22.58■■□□□ 1.2
NOP56-201ENST00000329276 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.58■■□□□ 1.2
NOP56-201ENST00000329276 BEND3Q5T5X7 828 aa22.58■■□□□ 1.2
NOP56-201ENST00000329276 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
NOP56-201ENST00000329276 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
NOP56-201ENST00000329276 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.58■■□□□ 1.2
NOP56-201ENST00000329276 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
NOP56-201ENST00000329276 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.57■■□□□ 1.2
NOP56-201ENST00000329276 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.57■■□□□ 1.2
NOP56-201ENST00000329276 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.56■■□□□ 1.2
NOP56-201ENST00000329276 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.56■■□□□ 1.2
NOP56-201ENST00000329276 SYT10Q6XYQ8 523 aa22.56■■□□□ 1.2
NOP56-201ENST00000329276 NBPF11Q86T75 865 aa22.56■■□□□ 1.2
NOP56-201ENST00000329276 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.56■■□□□ 1.2
NOP56-201ENST00000329276 FAM227BQ96M60 508 aa22.56■■□□□ 1.2
NOP56-201ENST00000329276 MED23Q9ULK4 1368 aa22.56■■□□□ 1.2
NOP56-201ENST00000329276 NPHP1O15259 732 aa22.56■■□□□ 1.2
NOP56-201ENST00000329276 UBXN4Q92575 508 aa22.56■■□□□ 1.2
NOP56-201ENST00000329276 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.56■■□□□ 1.2
NOP56-201ENST00000329276 ACEP12821 1306 aa22.55■■□□□ 1.2
NOP56-201ENST00000329276 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
NOP56-201ENST00000329276 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
NOP56-201ENST00000329276 EYA1Q99502 592 aa22.55■■□□□ 1.2
NOP56-201ENST00000329276 AOPEPQ8N6M6 819 aa22.55■■□□□ 1.2
NOP56-201ENST00000329276 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
NOP56-201ENST00000329276 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
NOP56-201ENST00000329276 HOXB7P09629 217 aa22.54■■□□□ 1.2
NOP56-201ENST00000329276 STK3Q13188 491 aa22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms