RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320857.7

SSR4-201, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SSR4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-201ENST00000320857 CCDC87Q9NVE4 849 aa20.57■□□□□ 0.88
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SSR4-201ENST00000320857 EYA2O00167 538 aa20.56■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 EIF5P55010 431 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 FBXO3Q9UK99 471 aa20.56■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.56■□□□□ 0.88
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SSR4-201ENST00000320857 ITPK1Q13572 414 aa20.55■□□□□ 0.88
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SSR4-201ENST00000320857 CCDC57Q2TAC2 916 aa20.55■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.55■□□□□ 0.88
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SSR4-201ENST00000320857 PALD1Q9ULE6 856 aa20.55■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SSR4-201ENST00000320857 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
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SSR4-201ENST00000320857 FAM89AQ96GI7 184 aa20.54■□□□□ 0.88
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SSR4-201ENST00000320857 MYH3P11055 1940 aa20.42■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
SSR4-201ENST00000320857 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.42■□□□□ 0.86
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