RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313766.5

FAM20C-201, Transcript of FAM20C, golgi associated secretory pathway kinase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM20C, Length 2,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20C-201ENST00000313766 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.82■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 SPTLC3Q9NUV7 552 aa24.82■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 COPS6Q7L5N1 327 aa24.81■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 FAM200AQ8TCP9 573 aa24.81■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 BCL2L12Q9HB09 334 aa24.81■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 MAP7D2Q96T17 732 aa24.81■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 TFCP2Q12800 502 aa24.8■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 TAF5LO75529 589 aa24.8■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 PSMA5P28066 241 aa24.8■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 BRF1Q92994 677 aa24.8■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 SPDYE4A6NLX3 237 aa24.79■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 KIF3AQ9Y496 699 aa24.79■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 TRIM5Q9C035 493 aa24.79■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 LTN1O94822 1766 aa24.79■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 Q6ZUG5 572 aa24.78■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.78■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 PRIMPOLQ96LW4 560 aa24.78■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 CHST3Q7LGC8 479 aa24.77■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 ATP2B3Q16720 1220 aa24.77■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa24.77■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 RNF20Q5VTR2 975 aa24.77■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.77■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 DBNDD2Q9BQY9 259 aa24.77■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.76■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 GUCY1B3Q02153 619 aa24.76■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 ARID5BQ14865 1188 aa24.76■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.76■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 TAOK2Q9UL54 1235 aa24.76■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 USP16Q9Y5T5 823 aa24.76■■□□□ 1.56
FAM20C-201ENST00000313766 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.76■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 FGD1P98174 961 aa24.75■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 GCKRQ14397 625 aa24.75■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 MED23Q9ULK4 1368 aa24.75■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.75■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 CYP21A2P08686 494 aa24.75■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 CCT2P78371 535 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 H3BQV1 296 aa24.74■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 IFFO2Q5TF58 517 aa24.74■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.74■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.74■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.74■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 PDCP20941 246 aa24.73■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 ZNF165P49910 485 aa24.73■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 CCDC144BQ3MJ40 725 aa24.73■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa24.73■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 NEK1Q96PY6 1258 aa24.73■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 ZNF790Q6PG37 636 aa24.73■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 STOX1Q6ZVD7 989 aa24.73■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 HIP1O00291 1037 aa24.72■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 SCRN1Q12765 414 aa24.72■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.72■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 NFAT5O94916 1531 aa24.72■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 KDM3BQ7LBC6 1761 aa24.72■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 SLIT1O75093 1534 aa24.72■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 PRDM4Q9UKN5 801 aa24.72■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.71■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 GTF3C6Q969F1 213 aa24.71■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 TNNI3KQ59H18 835 aa24.71■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 CLSTN2Q9H4D0 955 aa24.71■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa24.71■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 IGSF3O75054 1194 aa24.71■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.71■■□□□ 1.55
FAM20C-201ENST00000313766 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.7■■□□□ 1.54
FAM20C-201ENST00000313766 APOBRQ0VD83 1088 aa24.7■■□□□ 1.54
FAM20C-201ENST00000313766 ANKRD1Q15327 319 aa24.7■■□□□ 1.54
FAM20C-201ENST00000313766 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.7■■□□□ 1.54
FAM20C-201ENST00000313766 ZNF609O15014 1411 aa24.7■■□□□ 1.54
FAM20C-201ENST00000313766 ELP1O95163 1332 aa24.7■■□□□ 1.54
FAM20C-201ENST00000313766 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
FAM20C-201ENST00000313766 ZNF75DP51815 510 aa24.7■■□□□ 1.54
FAM20C-201ENST00000313766 RESTQ13127 1097 aa24.7■■□□□ 1.54
FAM20C-201ENST00000313766 NEUROD6Q96NK8 337 aa24.7■■□□□ 1.54
FAM20C-201ENST00000313766 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa24.69■■□□□ 1.54
FAM20C-201ENST00000313766 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP24.69■■□□□ 1.543e-6■■■■□ 22.8
FAM20C-201ENST00000313766 ZNF592Q92610 1267 aa24.69■■□□□ 1.54
FAM20C-201ENST00000313766 HEG1Q9ULI3 1381 aa24.69■■□□□ 1.54
FAM20C-201ENST00000313766 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
FAM20C-201ENST00000313766 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa24.68■■□□□ 1.54
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