RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262643.7

CCNE1-201, Transcript of cyclin E1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNE1, Length 2,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1-201ENST00000262643 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
CCNE1-201ENST00000262643 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
CCNE1-201ENST00000262643 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
CCNE1-201ENST00000262643 BBOX1O75936 387 aa27.02■■□□□ 1.92
CCNE1-201ENST00000262643 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa27.02■■□□□ 1.92
CCNE1-201ENST00000262643 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
CCNE1-201ENST00000262643 SNED1Q8TER0 1413 aa27.01■■□□□ 1.91
CCNE1-201ENST00000262643 LINS1Q8NG48 757 aa27.01■■□□□ 1.91
CCNE1-201ENST00000262643 PDE8AO60658 829 aa27■■□□□ 1.91
CCNE1-201ENST00000262643 RRP1P56182 461 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
CCNE1-201ENST00000262643 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
CCNE1-201ENST00000262643 BCL2L13Q9BXK5 485 aa27■■□□□ 1.91
CCNE1-201ENST00000262643 NMRK2Q9NPI5 230 aa27■■□□□ 1.91
CCNE1-201ENST00000262643 GCKRQ14397 625 aa27■■□□□ 1.91
CCNE1-201ENST00000262643 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa27■■□□□ 1.91
CCNE1-201ENST00000262643 SSH1Q8WYL5 1049 aa27■■□□□ 1.91
CCNE1-201ENST00000262643 KDM2BQ8NHM5 1336 aa27■■□□□ 1.91
CCNE1-201ENST00000262643 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
CCNE1-201ENST00000262643 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
CCNE1-201ENST00000262643 PSMD1Q99460 953 aa26.99■■□□□ 1.91
CCNE1-201ENST00000262643 CDHR2Q9BYE9 1310 aa26.99■■□□□ 1.91
CCNE1-201ENST00000262643 GRIPAP1Q4V328 841 aa26.97■■□□□ 1.91
CCNE1-201ENST00000262643 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.97■■□□□ 1.91
CCNE1-201ENST00000262643 SP8Q8IXZ3 490 aa26.97■■□□□ 1.91
CCNE1-201ENST00000262643 SEC31BQ9NQW1 1179 aa26.97■■□□□ 1.91
CCNE1-201ENST00000262643 H7C1W4 665 aa26.97■■□□□ 1.91
CCNE1-201ENST00000262643 IARSP41252 1262 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
CCNE1-201ENST00000262643 CCDC152Q4G0S7 254 aa26.97■■□□□ 1.91
CCNE1-201ENST00000262643 COL4A1P02462 1669 aa26.96■■□□□ 1.91
CCNE1-201ENST00000262643 GLTPD2A6NH11 291 aa26.96■■□□□ 1.91
CCNE1-201ENST00000262643 BEND3Q5T5X7 828 aa26.96■■□□□ 1.91
CCNE1-201ENST00000262643 KIF3CO14782 793 aa26.95■■□□□ 1.91
CCNE1-201ENST00000262643 CTSWP56202 376 aa26.95■■□□□ 1.9
CCNE1-201ENST00000262643 DPY19L2Q6NUT2 758 aa26.95■■□□□ 1.9
CCNE1-201ENST00000262643 PLIN1O60240 522 aa26.94■■□□□ 1.9
CCNE1-201ENST00000262643 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.94■■□□□ 1.9
CCNE1-201ENST00000262643 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.94■■□□□ 1.9
CCNE1-201ENST00000262643 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
CCNE1-201ENST00000262643 TMC4Q7Z404 712 aa26.94■■□□□ 1.9
CCNE1-201ENST00000262643 MPNDQ8N594 471 aa26.94■■□□□ 1.9
CCNE1-201ENST00000262643 RRAGCQ9HB90 399 aa26.94■■□□□ 1.9
CCNE1-201ENST00000262643 C1QTNF8P60827 252 aa26.93■■□□□ 1.9
CCNE1-201ENST00000262643 RPS8P62241 208 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
CCNE1-201ENST00000262643 MYH3P11055 1940 aa26.93■■□□□ 1.9
CCNE1-201ENST00000262643 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.92■■□□□ 1.9
CCNE1-201ENST00000262643 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
CCNE1-201ENST00000262643 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.91■■□□□ 1.9
CCNE1-201ENST00000262643 TTLL11Q8NHH1 800 aa26.91■■□□□ 1.9
CCNE1-201ENST00000262643 JDP2Q8WYK2 163 aa26.91■■□□□ 1.9
CCNE1-201ENST00000262643 CASP7P55210 303 aa26.9■■□□□ 1.9
CCNE1-201ENST00000262643 PTPRCP08575 1304 aa26.9■■□□□ 1.9
CCNE1-201ENST00000262643 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.9■■□□□ 1.9
CCNE1-201ENST00000262643 PPIP5K2O43314 1243 aa26.89■■□□□ 1.9
CCNE1-201ENST00000262643 DDNO94850 711 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
CCNE1-201ENST00000262643 AOC3Q16853 763 aa26.89■■□□□ 1.9
CCNE1-201ENST00000262643 GREM2Q9H772 168 aa26.89■■□□□ 1.9
CCNE1-201ENST00000262643 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
CCNE1-201ENST00000262643 LRRC37AA6NMS7 1700 aa26.89■■□□□ 1.9
CCNE1-201ENST00000262643 SUPT20HQ8NEM7 779 aa26.89■■□□□ 1.89
CCNE1-201ENST00000262643 COL4A5P29400 1685 aa26.88■■□□□ 1.89
CCNE1-201ENST00000262643 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
CCNE1-201ENST00000262643 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.88■■□□□ 1.89
CCNE1-201ENST00000262643 BCAR3O75815 825 aa26.87■■□□□ 1.89
CCNE1-201ENST00000262643 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa26.87■■□□□ 1.89
CCNE1-201ENST00000262643 PLA2G12BQ9BX93 195 aa26.87■■□□□ 1.89
CCNE1-201ENST00000262643 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
CCNE1-201ENST00000262643 GRM8O00222 908 aa26.87■■□□□ 1.89
CCNE1-201ENST00000262643 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
CCNE1-201ENST00000262643 ALDH1L1O75891 902 aa26.86■■□□□ 1.89
CCNE1-201ENST00000262643 GPSM2P81274 684 aa26.86■■□□□ 1.89
CCNE1-201ENST00000262643 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
CCNE1-201ENST00000262643 FZD9O00144 591 aa26.85■■□□□ 1.89
CCNE1-201ENST00000262643 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
CCNE1-201ENST00000262643 NIM1KQ8IY84 436 aa26.85■■□□□ 1.89
CCNE1-201ENST00000262643 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.85■■□□□ 1.89
CCNE1-201ENST00000262643 FAM161AQ3B820 660 aa26.84■■□□□ 1.89
CCNE1-201ENST00000262643 DUOX1Q9NRD9 1551 aa26.84■■□□□ 1.89
CCNE1-201ENST00000262643 RARSP54136 660 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
CCNE1-201ENST00000262643 C6orf229H3BNL8 230 aa26.83■■□□□ 1.89
CCNE1-201ENST00000262643 TOMM70O94826 608 aa26.83■■□□□ 1.89
CCNE1-201ENST00000262643 VPS33BQ9H267 617 aa26.83■■□□□ 1.89
CCNE1-201ENST00000262643 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa26.83■■□□□ 1.89
CCNE1-201ENST00000262643 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
CCNE1-201ENST00000262643 WDR90Q96KV7 1748 aa26.82■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 POTECB2RU33 542 aa26.82■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 ITGA6P23229 1130 aa26.82■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 EIF6P56537 245 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 RTL9Q8NET4 1388 aa26.82■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 SPEF2Q9C093 1822 aa26.82■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 CSF1RP07333 972 aa26.82■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 POLLQ9UGP5 575 aa26.82■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.82■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 FOXO4P98177 505 aa26.81■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.81■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.8■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 WASHC4Q2M389 1173 aa26.8■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.8■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.8■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms