RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 TPTE2Q6XPS3 522 aa7.36□□□□□ -1.23
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SETX-201ENST00000224140 DDB1Q16531 1140 aa7.36□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa7.36□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.36□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 C8orf76Q96K31 380 aa7.36□□□□□ -1.23
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SETX-201ENST00000224140 MNS1Q8NEH6 495 aa7.34□□□□□ -1.23
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SETX-201ENST00000224140 DCCP43146 1447 aa7.34□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 ODF2Q5BJF6 829 aa7.34□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 ZSCAN30Q86W11 494 aa7.34□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 RTL9Q8NET4 1388 aa7.34□□□□□ -1.23
SETX-201ENST00000224140 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
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SETX-201ENST00000224140 KDM2BQ8NHM5 1336 aa7.33□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 RFC4P35249 363 aa7.33□□□□□ -1.24
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SETX-201ENST00000224140 IARSP41252 1262 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 GRIPAP1Q4V328 841 aa7.33□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 CAGE1Q8TC20 777 aa7.33□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 HOOK2Q96ED9 719 aa7.33□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 DENND2AQ9ULE3 1009 aa7.33□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa7.33□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 VSIG10Q8N0Z9 540 aa7.33□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 SERPINC1P01008 464 aa7.33□□□□□ -1.24
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