RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053729.13

Pdss1-201, Transcript of Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdss1, Length 1,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Cyp2c40P56657 491 aa29.9■■■□□ 2.38
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Atp8a2P98200 1148 aa29.9■■■□□ 2.38
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Dok7Q18PE0 504 aa29.9■■■□□ 2.38
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Jarid2Q62315 1234 aa29.9■■■□□ 2.38
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Cd248Q91V98 765 aa29.9■■■□□ 2.38
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Fbxo3Q9DC63 480 aa29.9■■■□□ 2.38
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa29.9■■■□□ 2.38
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Bin2D3Z6Q9 489 aa29.89■■■□□ 2.38
Pdss1-201ENSMUST00000053729 EgfrQ01279 1210 aa29.89■■■□□ 2.38
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Slc39a11Q8BWY7 342 aa29.89■■■□□ 2.38
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Lgr5Q9Z1P4 907 aa29.89■■■□□ 2.38
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Nedd4P46935 887 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.37
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Il15P48346 162 aa29.89■■■□□ 2.37
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Tmem143Q8VD26 458 aa29.89■■■□□ 2.37
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Plbd2Q3TCN2 594 aa29.88■■■□□ 2.37
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Calr4Q3TQS0 420 aa29.87■■■□□ 2.37
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Mcmdc2E9Q956 681 aa29.86■■■□□ 2.37
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Trim27Q62158 513 aa29.86■■■□□ 2.37
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Hs1bp3Q3TC93 395 aa29.85■■■□□ 2.37
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Pcsk7Q61139 770 aa29.85■■■□□ 2.37
Pdss1-201ENSMUST00000053729 FktnQ8R507 461 aa29.85■■■□□ 2.37
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Slfn1Q9Z0I7 337 aa29.85■■■□□ 2.37
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Abcc4E9Q236 1325 aa29.85■■■□□ 2.37
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Ncoa5Q91W39 579 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Zbtb3Q91X45 518 aa29.85■■■□□ 2.37
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Bend4P86174 541 aa29.84■■■□□ 2.37
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Atg9aQ68FE2 551 aa29.84■■■□□ 2.37
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Best3Q6H1V1 669 aa29.84■■■□□ 2.37
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Vsig10D3YX43 558 aa29.83■■■□□ 2.37
Pdss1-201ENSMUST00000053729 D830030K20RikE9PYQ5 218 aa29.83■■■□□ 2.37
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Gm3043K7N693 218 aa29.83■■■□□ 2.37
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Gm16440K7N6G6 218 aa29.83■■■□□ 2.37
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Gm2244L7N2A3 218 aa29.83■■■□□ 2.37
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Gm3278L7N2D2 218 aa29.83■■■□□ 2.37
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Gm8271L7N2E2 218 aa29.83■■■□□ 2.37
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Anxa1P10107 346 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Nlrp1aQ2LKU9 1182 aa29.83■■■□□ 2.37
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Tmc2Q8R4P4 888 aa29.83■■■□□ 2.37
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Phrf1A6H619 1682 aa29.83■■■□□ 2.37
Pdss1-201ENSMUST00000053729 NfixP70257 488 aa29.82■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Wwc1Q5SXA9 1104 aa29.82■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Ptcd1Q8C2E4 695 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Pde3aQ9Z0X4 1141 aa29.82■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Csrnp3P59055 597 aa29.82■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 ArsiQ32KI9 573 aa29.82■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Znf692Q3U381 531 aa29.82■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Cluap1Q8R3P7 413 aa29.82■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 CpvlQ9D3S9 478 aa29.82■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 LratQ9JI60 231 aa29.82■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Mtcl1Q3UHU5 1945 aa29.81■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Tpx2A2APB8 745 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 IntuQ059U7 942 aa29.81■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Dhx38Q80X98 1228 aa29.81■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 HlfQ8BW74 295 aa29.81■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Rlbp1Q9Z275 317 aa29.81■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Thrap3Q569Z6 951 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Znf496Q5SXI5 585 aa29.8■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Unc5clQ6R653 518 aa29.8■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Zkscan8Q8BSL0 588 aa29.8■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Popdc2Q9ES82 367 aa29.8■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Flt1P35969 1333 aa29.79■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Celf1P28659 486 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Rrs1Q9CYH6 365 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Pde8bE9Q4S1 865 aa29.78■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Insm1Q63ZV0 521 aa29.78■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Dis3l2Q8CI75 870 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Cfap44E9Q5M6 1843 aa29.78■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 GabrdP22933 449 aa29.78■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Gsdma2Q32M21 443 aa29.78■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Sgip1Q8VD37 806 aa29.78■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Klrk1O54709 232 aa29.77■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 B4galnt4Q766D5 1034 aa29.77■■■□□ 2.36
Pdss1-201ENSMUST00000053729 AU019823E9PUQ3 292 aa29.76■■■□□ 2.35
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Speer4dL7N216 212 aa29.76■■■□□ 2.35
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Kcnh8P59111 1102 aa29.76■■■□□ 2.35
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Plekhf1Q3TB82 279 aa29.76■■■□□ 2.35
Pdss1-201ENSMUST00000053729 NfkbibQ60778 359 aa29.76■■■□□ 2.35
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Dpf2Q61103 391 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Kcna3P16390 528 aa29.75■■■□□ 2.35
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Slc14a2Q8R4T9 930 aa29.75■■■□□ 2.35
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Ets1P27577 440 aa29.74■■■□□ 2.35
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Rab3gap1Q80UJ7 981 aa29.74■■■□□ 2.35
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Spire2Q8K1S6 718 aa29.74■■■□□ 2.35
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Sh3bp5Q9Z131 463 aa29.74■■■□□ 2.35
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Hoxa7P02830 229 aa29.74■■■□□ 2.35
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Mctp2Q5RJH2 878 aa29.74■■■□□ 2.35
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Col5a2Q3U962 1497 aa29.73■■■□□ 2.35
Pdss1-201ENSMUST00000053729 EvplQ9D952 2035 aa29.73■■■□□ 2.35
Pdss1-201ENSMUST00000053729 WdpcpQ8C456 722 aa29.73■■■□□ 2.35
Pdss1-201ENSMUST00000053729 CarsQ9ER72 831 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Ptf1aQ9QX98 324 aa29.73■■■□□ 2.35
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Gdf11Q9Z1W4 405 aa29.73■■■□□ 2.35
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Btaf1E9QAE3 1848 aa29.73■■■□□ 2.35
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Atp6v1aP50516 617 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Fam102bQ8BQS4 339 aa29.72■■■□□ 2.35
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Neurod6P48986 337 aa29.71■■■□□ 2.35
Pdss1-201ENSMUST00000053729 SkilQ60665 675 aa29.71■■■□□ 2.35
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Kiaa0753Q6A000 959 aa29.71■■■□□ 2.35
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Znfx1Q8R151 1909 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.7 ms