RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528920.5

TSTA3-208, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 964 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-208ENST00000528920 KLHL15Q96M94 604 aa13.15□□□□□ -0.3
TSTA3-208ENST00000528920 TM9SF2Q99805 663 aa13.15□□□□□ -0.3
TSTA3-208ENST00000528920 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
TSTA3-208ENST00000528920 PINK1Q9BXM7 581 aa13.15□□□□□ -0.3
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF175Q9Y473 711 aa13.15□□□□□ -0.3
TSTA3-208ENST00000528920 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
TSTA3-208ENST00000528920 MPDZO75970 2070 aa13.14□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 PRORSD1PA6NEY8 169 aa13.14□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 SLC22A20A6NK97 555 aa13.14□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 GJE1A6NN92 205 aa13.14□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 SERPINB7O75635 380 aa13.14□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 DCTN3O75935 186 aa13.14□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 RCBTB2O95199 551 aa13.14□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 TGM6O95932 706 aa13.14□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 GKN3PP0CG01 181 aa13.14□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 SFTPDP35247 375 aa13.14□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 HACD2Q6Y1H2 254 aa13.14□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF550Q7Z398 422 aa13.14□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 GRINAQ7Z429 371 aa13.14□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 ARPINQ7Z6K5 226 aa13.14□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 CCDC197Q8NCU1 140 aa13.14□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 OR10D3Q8NH80 312 aa13.14□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 OR2V1Q8NHB1 315 aa13.14□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 FIG4Q92562 907 aa13.14□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF583Q96ND8 569 aa13.14□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 ZFP3Q96NJ6 502 aa13.14□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 LRRC37BQ96QE4 947 aa13.14□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 PIF1Q9H611 641 aa13.14□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 SERINC1Q9NRX5 453 aa13.14□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 TNFSF11O14788 317 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 CXCL13O43927 109 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 TPST1O60507 370 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 MFN2O95140 757 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 PRG2P13727 222 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 HTR1EP28566 365 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 SLC1A3P43003 542 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 HTR3AP46098 478 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF136P52737 540 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 SGCBQ16585 318 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 PDSS1Q5T2R2 415 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 FAM91A1Q658Y4 838 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 HBMQ6B0K9 141 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 C3orf33Q6P1S2 294 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 ERICH5Q6P6B1 374 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 POMZP3Q6PJE2 187 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 ARMC8Q8IUR7 673 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 LIX1LQ8IVB5 337 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 FNDC9Q8TBE3 224 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 OSTF1Q92882 214 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 CTPS2Q9NRF8 586 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 AP3M1Q9Y2T2 418 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 CELSR2Q9HCU4 2923 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 FAM90A27PA6NNH2 459 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 PRSS44E7EML9 344 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 M0QX08 132 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 FRS3O43559 492 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 IL18BPO95998 194 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 CTSSP25774 331 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 NUDT2P50583 147 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 DMTNQ08495 405 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 VEZF1Q14119 521 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 PON3Q15166 354 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 OR2A2Q6IF42 318 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 CCDC80Q76M96 950 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 P4HA3Q7Z4N8 544 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 COMTD1Q86VU5 262 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 ADGRG3Q86Y34 549 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 SLC15A3Q8IY34 581 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 UCK2Q9BZX2 261 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 ADAM19Q9H013 955 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 COQ10BQ9H8M1 238 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 KCNJ16Q9NPI9 418 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 CMTM6Q9NX76 183 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 CHRNA9Q9UGM1 479 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 OSGIN1Q9UJX0 560 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 USP22Q9UPT9 525 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-208ENST00000528920 ABCA12Q86UK0 2595 aa13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms