RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)K

tW(CCA)K, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)K, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)KtW(CCA)K TRS130Q03660 1102 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K VPS20Q04272 221 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K IRC10Q08118 586 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K PSK2Q08217 1101 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K ELG1Q12050 791 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K OSH2Q12451 1283 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K RRD2Q12461 358 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K HXK1P04806 485 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K APE1P14904 514 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K ISY1P21374 235 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K SPO11P23179 398 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K RPC53P25441 422 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K PUP3P25451 205 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K CDC15P27636 974 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K DPH2P32461 534 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K VPS35P34110 944 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K YEL1P34225 687 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K COY1P34237 679 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K SEG2P34250 1132 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K MAL33P38157 468 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K YAP1801P38856 637 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K YFL034WP43564 1073 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K VTC2P43585 828 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data2.89□□□□□ -1.95not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K YGR153WP48238 217 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K HSH155P49955 971 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K RCR2Q03446 210 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K HCR1Q05775 265 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K CDD1Q06549 142 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K FMP25Q08023 583 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K TLG2Q08144 397 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K YPL216WQ08964 1102 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K PLP2Q12017 286 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K MYO1P08964 1928 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K HIS4P00815 799 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K CAN1P04817 590 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K HAP2P06774 265 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K ALG1P16661 449 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K KGD2P19262 463 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K PGS1P25578 521 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K RDS1P25611 832 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K URA1P28272 314 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K ASF1P32447 279 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K CBF2P32504 956 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K RAD54P32863 898 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K RPT1P33299 467 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K PRX1P34227 261 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K MAP2P38174 421 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K SIP5P40210 489 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K ULI1P43604 169 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K FAA4P47912 694 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K CCM1P48237 864 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K ISM1P48526 1002 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K SPC98P53540 846 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K STP1Q00947 519 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K TBF1Q02457 562 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K PML39Q03760 334 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K SNU56Q03782 492 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K VMS1Q04311 632 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K COG8Q04632 607 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K FUS2Q05670 677 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K ECM7Q06200 448 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K YDL057WQ07379 328 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K SAM3Q08986 587 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K UBR2Q07963 1872 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K FOB1O13329 566 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K RPS14AP06367 137 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K ASP3-2P0CX77 362 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K ASP3-3P0CX78 362 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K ASP3-4P0CX79 362 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K ASP3-1P0CZ17 362 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K CKA2P19454 339 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K IME1P21190 360 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K VPS3P23643 1011 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K SGF29P25554 259 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K PEX34P25584 144 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K SAC6P32599 642 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K MUD1P32605 298 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K YSC83P32792 385 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data2.87□□□□□ -1.95not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K MNN4P36044 1178 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K YBR056WP38081 501 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K TBS1P38114 1094 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K MMS4P38257 691 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K SIF2P38262 535 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K HXT5P38695 592 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K MED6P38782 295 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K RPS14BP39516 138 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K UBP5P39944 805 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K YEL023CP39992 682 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K NUP82P40368 713 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K ROG3P43602 733 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K POL31P46957 487 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K NPA3P47122 385 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K ASN1P49089 572 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K SFB2P53953 876 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K YHM2Q04013 314 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)KtW(CCA)K YPL277CQ08989 487 aa2.87□□□□□ -1.95
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