RNA–Protein interactions for RNA: YPR003C

YPR003C, Transcript of Putative sulfate permease, yeast

Gene YPR003C, Length 2,265 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YPR003C	YPR003C	MCD1	Q12158	566 aa		4.09	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	FOB1	O13329	566 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	HOM3	P10869	527 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	RED1	P14291	827 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	DAL7	P21826	554 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	ITR1	P30605	584 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	SLX1	P38324	304 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	IPL1	P38991	367 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	TIM54	P47045	478 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	ACF4	P47129	309 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	SSN8	P47821	323 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	UBA2	P52488	636 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	ZDS2	P54786	942 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	ULP1	Q02724	621 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	INP2	Q03824	705 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	ECM11	Q04110	302 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	DON1	Q05610	365 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	RIM20	Q12033	661 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	GRX4	P32642	244 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	HCS1	P34243	683 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	MRP8	P35719	219 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	RRM3	P38766	723 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	SAK1	P38990	1142 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	PEX14	P53112	341 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	ALF1	P53904	254 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	UBP2	Q01476	1272 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	YML108W	Q03759	105 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	MGR3	Q04472	501 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	SWA2	Q06677	668 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	BUG1	Q12191	341 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	SWI1	P09547	1314 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	COQ4	O13525	335 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	JIP3	O13555	125 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	CLB3	P24870	427 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	GSY2	P27472	705 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	BIO2	P32451	375 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	SFA1	P32771	386 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	TFC4	P33339	1025 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	TFC3	P34111	1160 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	MAL33	P38157	468 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	PSY4	P38193	441 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	ATG32	P40458	529 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	SNX4	P47057	423 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	YGR266W	P53326	701 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	TUB4	P53378	473 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	MUB1	Q03162	620 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	VPS36	Q06696	566 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	TMA16	Q08687	178 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	YOR223W	Q12015	292 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	ADH4	P10127	382 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	DIT1	P21623	536 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	VAN1	P23642	535 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	RSC6	P25632	483 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	DUR3	P33413	735 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	PHB1	P40961	287 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	APS3	P47064	194 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	SHE10	P53075	577 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	PIB2	P53191	635 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	MRPS35	P53292	345 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	ASI1	P54074	624 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	MET7	Q08645	548 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	HEL1	P36113	551 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	RTS1	P38903	757 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	CAJ1	P39101	391 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	TBF1	Q02457	562 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	ACE2	P21192	770 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPR003C	YPR003C	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76

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