RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W MAS2P11914 482 aa3.28□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W PDR1P12383 1068 aa3.28□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W DAL82P21705 255 aa3.28□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W GEM1P39722 662 aa3.28□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W MGS1P40151 587 aa3.28□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W RRN11Q04712 507 aa3.28□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W CIN8P27895 1000 aa3.28□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W BEM1P29366 551 aa3.28□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W MRPL40P36534 297 aa3.28□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W CDC27P38042 758 aa3.28□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W VAC8P39968 578 aa3.28□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W VID28P40547 921 aa3.28□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W MRK1P50873 501 aa3.28□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W HST2P53686 357 aa3.28□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W APC1P53886 1748 aa3.28□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W HOS3Q02959 697 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W CSC1Q06538 782 aa3.28□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W YPL260WQ08977 551 aa3.28□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W RAD50P12753 1312 aa3.28□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W LAM5P43560 674 aa3.28□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W NMA2P53204 395 aa3.28□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W YNR065CP53751 1116 aa3.28□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W PUF6Q04373 656 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W SWC3P31376 625 aa3.28□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W MKK1P32490 508 aa3.28□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W YHL044WP38727 235 aa3.28□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W TUB4P53378 473 aa3.28□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W ALG12P53730 551 aa3.28□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W IGO1P53897 168 aa3.28□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W FLC1Q08967 793 aa3.28□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W SPT15P13393 240 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W TPM1P17536 199 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W MIH1P23748 554 aa3.27□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W PET127P32606 800 aa3.27□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W ATO2P32907 282 aa3.27□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W MED6P38782 295 aa3.27□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W RPT2P40327 437 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W MET6P05694 767 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W NPL4P33755 580 aa3.27□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W YKL023WP36103 277 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W EDS1P38073 919 aa3.27□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W MAL11P53048 616 aa3.27□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W TBF1Q02457 562 aa3.27□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W DUS4Q06063 367 aa3.27□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W OPI10Q08202 246 aa3.27□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W ERP2P39704 215 aa3.27□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W ENO2P00925 437 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W PYC1P11154 1178 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W MCM1P11746 286 aa3.26□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W LDB16P25587 256 aa3.26□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W MRD1Q06106 887 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W HAP2P06774 265 aa3.26□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W SUP45P12385 437 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W ESS1P22696 170 aa3.26□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W AIM9P40053 627 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W YFR018CP43599 363 aa3.26□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W LAP2Q10740 671 aa3.26□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W TFB4Q12004 338 aa3.26□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W RIM20Q12033 661 aa3.26□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W VAS1P07806 1104 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W PDE1P22434 369 aa3.26□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W CCL1P37366 393 aa3.26□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W COP1P53622 1201 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W MTC5Q03897 1148 aa3.26□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W NCB2Q92317 146 aa3.26□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W YRF1-3P0CX14 1859 aa3.26□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W YRF1-7P0CX15 1859 aa3.26□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W YRF1-6P53819 1859 aa3.26□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W GSC2P40989 1895 aa3.26□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W PMT3P47190 753 aa3.26□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W GCV2P49095 1034 aa3.26□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W DSD1P53095 428 aa3.26□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W CWC21Q03375 135 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W PSH1Q12161 406 aa3.26□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W YDR061WQ12298 539 aa3.26□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W TRP5P00931 707 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W AI4P03878 556 aa3.25□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W TEC1P18412 486 aa3.25□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W LST4P34239 828 aa3.25□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W GIC1P38785 314 aa3.25□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W XDJ1P39102 459 aa3.25□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W VPS27P40343 622 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W SMC5Q08204 1093 aa3.25□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W NOT3P06102 836 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W ILS1P09436 1072 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W VAN1P23642 535 aa3.25□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W YKL151CP36059 337 aa3.25□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W APM3P38153 483 aa3.25□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W PUN1Q06991 263 aa3.25□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W RTT109Q07794 436 aa3.25□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W OXR1Q08952 273 aa3.25□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W YDR215CQ12240 137 aa3.25□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W JNM1P36224 373 aa3.25□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W SAF1P38352 637 aa3.25□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W MNN1P39106 762 aa3.25□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W COQ5P49017 307 aa3.25□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W UBP15P50101 1230 aa3.25□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W NAF1P53919 492 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
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