RNA–Protein interactions for RNA: YMR196W

YMR196W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR196W, Length 3,267 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR196WYMR196W HMI1Q12039 706 aa5.08□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W PGK1P00560 416 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W CLN3P13365 580 aa5.08□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W SEC23P15303 768 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W VAB2P40003 282 aa5.08□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W VFA1P40080 203 aa5.08□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W HST2P53686 357 aa5.08□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W SEC5P89102 971 aa5.08□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W SPO71Q03868 1245 aa5.08□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W ARR1Q06596 294 aa5.08□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W YCG1Q06680 1035 aa5.08□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W RKM4Q12504 494 aa5.08□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W SRD1P09007 221 aa5.08□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W LAM1P38851 1228 aa5.08□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W FYV8P46949 817 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W NET1P47035 1189 aa5.08□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W HUL5P53119 910 aa5.08□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W CNM67P53865 581 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W ARK1P53974 638 aa5.08□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W ATG9Q12142 997 aa5.08□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W DBP10Q12389 995 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W DAL7P21826 554 aa5.07□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W YEL1P34225 687 aa5.07□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data5.07□□□□□ -1.6not detected
YMR196WYMR196W FIS1P40515 155 aa5.07□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W ERG5P54781 538 aa5.07□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W SPO75Q07798 868 aa5.07□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W SWI6P09959 803 aa5.07□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W RRP43P25359 394 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W CLB5P30283 435 aa5.07□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W EFM2P38347 419 aa5.07□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W TIM54P47045 478 aa5.07□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W ALF1P53904 254 aa5.07□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W VMA2P16140 517 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data5.06□□□□□ -1.6not detected
YMR196WYMR196W GPB2P39717 880 aa5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W ATG3P40344 310 aa5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W YFL034WP43564 1073 aa5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W UME1Q03010 460 aa5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W VPS38Q05919 439 aa5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W ATG26Q06321 1198 aa5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W YPL277CQ08989 487 aa5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W ERP3Q12403 225 aa5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W KEX2P13134 814 aa5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W TUP1P16649 713 aa5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W SPO12P17123 173 aa5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W RPC53P25441 422 aa5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W HEM3P28789 327 aa5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W DSN1P40568 576 aa5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W NNF1P47149 201 aa5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W YLR287CQ05881 355 aa5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W CRD1Q07560 283 aa5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W RRP6Q12149 733 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W PPR1P07272 904 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W CDC60P26637 1090 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W MCD4P36051 919 aa5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W YKR018CP36114 725 aa5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W FUI1P38196 639 aa5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W VPS29P38759 282 aa5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W PEX21P50091 288 aa5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W TOF1P53840 1238 aa5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W ORM2Q06144 216 aa5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W FAL1Q12099 399 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W MED1Q12321 566 aa5.06□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data5.05□□□□□ -1.6 RIP-Chip
YMR196WYMR196W PCK1P10963 549 aa5.05□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W TKL1P23254 680 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W IXR1P33417 597 aa5.05□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W DBP7P36120 742 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W TAD1P53065 400 aa5.05□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W YGR125WP53273 1036 aa5.05□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W HOS3Q02959 697 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W CUR1Q06469 252 aa5.05□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W TCP1P12612 559 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W EUG1P32474 517 aa5.05□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W NIP100P33420 868 aa5.05□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W STO1P34160 861 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W ATG19P35193 415 aa5.05□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W RPN3P40016 523 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W HMG1P12683 1054 aa5.05□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W PKC1P24583 1151 aa5.05□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W APL1P27351 700 aa5.05□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W REG2P38232 338 aa5.05□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W LCB2P40970 561 aa5.05□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W ZPR1P53303 486 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W NCS2P53923 493 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W YMR321CQ04898 105 aa5.05□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W NCR1Q12200 1170 aa5.05□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W CDC19P00549 500 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W HVG1P0CE11 249 aa5.04□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W PDC6P26263 563 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W ERC1P38767 581 aa5.04□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W EFM4P40516 257 aa5.04□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W RAD17P48581 401 aa5.04□□□□□ -1.6
YMR196WYMR196W DUS4Q06063 367 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 76.2 ms