RNA–Protein interactions for RNA: YMR088C

VBA1, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA1	YMR088C	UBP15	P50101	1230 aa		5.87	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	APP1	P53933	587 aa		5.87	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	COG6	P53959	839 aa		5.87	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	5.87	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	RRN5	Q02983	363 aa		5.87	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.87	□□□□□ -1.47	not detected
VBA1	YMR088C	TSC13	Q99190	310 aa		5.87	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	SSN2	P38931	1420 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	RPC53	P25441	422 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	MEI4	P29467	408 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	SLA2	P33338	968 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	YBR242W	P38331	238 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	SIP3	P38717	1229 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	IES5	P40060	125 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	SAP185	P40856	1058 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	DAK2	P43550	591 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	SAE2	P46946	345 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	JJJ2	P46997	583 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	ALT1	P52893	592 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	FYV6	P53913	173 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	MUB1	Q03162	620 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	SPO20	Q04359	397 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	GAD1	Q04792	585 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	OPY2	Q06810	360 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	MLH2	Q07980	695 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	YOR378W	Q08902	515 aa		5.86	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	PEP1	P32319	1579 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	ADH4	P10127	382 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	MIP1	P15801	1254 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	REC107	P21651	314 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	RIB7	P33312	244 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	GEM1	P39722	662 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	SYG1	P40528	902 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	MMM1	P41800	426 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	ROM1	P53046	1155 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	SYO1	Q07395	620 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	REC8	Q12188	680 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	HAT1	Q12341	374 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	ATP4	P05626	244 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	YML002W	P0CF17	737 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	IFA38	P38286	347 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	MSR1	P38714	643 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	ZRG8	P40021	1076 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	YJL055W	P47044	245 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	SAP4	P53036	818 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	YGR266W	P53326	701 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	BET4	Q00618	327 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	DML1	Q03652	475 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	HDA3	Q06623	655 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	ESC8	Q08119	714 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	GAS4	Q08271	471 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	PHM7	Q12252	991 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	SMC6	Q12749	1114 aa		5.85	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	UFD4	P33202	1483 aa		5.84	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		5.84	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	FUS1	P11710	512 aa		5.84	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	CKA2	P19454	339 aa		5.84	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	MRPL8	P22353	238 aa		5.84	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	AMS1	P22855	1083 aa		5.84	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	MRC1	P25588	1096 aa		5.84	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	DOM34	P33309	386 aa		5.84	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	TFC4	P33339	1025 aa		5.84	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	TOK1	P40310	691 aa		5.84	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	YGL242C	P53066	181 aa		5.84	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	SSL2	Q00578	843 aa		5.84	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	DYN3	Q04949	312 aa		5.84	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	ADY3	Q07732	790 aa		5.84	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		5.84	□□□□□ -1.47
VBA1	YMR088C	BUD4	P47136	1447 aa		5.84	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	TRM3	Q07527	1436 aa		5.84	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	PIF1	P07271	859 aa		5.83	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	PET122	P10355	254 aa		5.83	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	SRB4	P32569	687 aa		5.83	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 41.4 ms