RNA–Protein interactions for RNA: YKR093W

PTR2, Transcript of Integral membrane peptide transporter, yeastyeast

Gene PTR2, Length 1,806 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PTR2YKR093W YSC84P32793 468 aa6.6□□□□□ -1.35
PTR2YKR093W PTH2P34222 208 aa6.6□□□□□ -1.35
PTR2YKR093W DOT6P40059 670 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTR2YKR093W TNA1P53322 534 aa6.6□□□□□ -1.35
PTR2YKR093W NBA1Q08229 501 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTR2YKR093W ENA1P13587 1091 aa6.6□□□□□ -1.35
PTR2YKR093W KTR4P38131 464 aa6.6□□□□□ -1.35
PTR2YKR093W TDA3P38758 523 aa6.6□□□□□ -1.35
PTR2YKR093W RPN10P38886 268 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTR2YKR093W HXT6P39003 570 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTR2YKR093W HXT7P39004 570 aa6.6□□□□□ -1.35
PTR2YKR093W ALY2P47029 1046 aa6.6□□□□□ -1.35
PTR2YKR093W UBC9P50623 157 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTR2YKR093W SFB2P53953 876 aa6.6□□□□□ -1.35
PTR2YKR093W ENA2Q01896 1091 aa6.6□□□□□ -1.35
PTR2YKR093W ENA5Q12691 1091 aa6.6□□□□□ -1.35
PTR2YKR093W COX11P19516 300 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTR2YKR093W DAL7P21826 554 aa6.59□□□□□ -1.35
PTR2YKR093W DSE4P53753 1117 aa6.59□□□□□ -1.35
PTR2YKR093W URN1Q06525 465 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTR2YKR093W RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTR2YKR093W RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W RPN12P32496 274 aa6.58□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W SER1P33330 395 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W MPE1P35728 441 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W GPT2P36148 743 aa6.58□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W HSL7P38274 827 aa6.58□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W HIS6P40545 261 aa6.58□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W SKY1Q03656 742 aa6.58□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W TPP1Q03796 238 aa6.58□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W LRS4Q04087 347 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W PUS7Q08647 676 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W YCL002CP25565 263 aa6.57□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W DBF20P32328 564 aa6.57□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W NOC2P39744 710 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W EMP65P40085 556 aa6.57□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W VPS27P40343 622 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W PAP2P53632 584 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W PSR2Q07949 397 aa6.57□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W FUN30P31380 1131 aa6.57□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W YIR007WP40566 764 aa6.57□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W ALT1P52893 592 aa6.57□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W SLD3P53135 668 aa6.57□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W GCR2Q01722 534 aa6.57□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W PEX15Q08215 383 aa6.57□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W YPR027CQ12079 277 aa6.57□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W YBR182C-AQ8TGU6 64 aa6.57□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W MSS18P08593 268 aa6.56□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W SSH4P32343 579 aa6.56□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W RLP7P40693 322 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W TAN1P53072 289 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W NOG2P53742 486 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W HFI1Q12060 488 aa6.56□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W YML131WQ03102 365 aa6.55□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W APM4Q99186 491 aa6.55□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W NHA1Q99271 985 aa6.55□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W COQ4O13525 335 aa6.55□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W PIK1P39104 1066 aa6.55□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W ACA1P39970 489 aa6.55□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W RRT14P40470 206 aa6.55□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W AIM21P40563 679 aa6.55□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W SAP185P40856 1058 aa6.55□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W YHM2Q04013 314 aa6.55□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W ENT2Q05785 613 aa6.55□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W YPR196WQ06595 470 aa6.55□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W ACE2P21192 770 aa6.54□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W URA1P28272 314 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W OAF3P36023 863 aa6.54□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W ENV11P53246 860 aa6.54□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W PFK1P16861 987 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W YKU70P32807 602 aa6.53□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W YKR051WP36142 418 aa6.53□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W QRI7P43122 407 aa6.53□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W EAR1Q03212 550 aa6.53□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W DIF1O13577 133 aa6.53□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W RFA1P22336 621 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W HFM1P51979 1187 aa6.53□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W MDG1P53885 366 aa6.53□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W RRI2Q12348 645 aa6.53□□□□□ -1.36
PTR2YKR093W FAT1P38225 669 aa6.52□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W RRM3P38766 723 aa6.52□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W ACO2P39533 789 aa6.52□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W NPY1P53164 384 aa6.52□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W CNM67P53865 581 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W HDA1P53973 706 aa6.52□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W MET22P32179 357 aa6.51□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W RPC82P32349 654 aa6.51□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W CCZ1P38273 704 aa6.51□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W CEG1Q01159 459 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W YDR444WQ04093 687 aa6.51□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W XYL2Q07993 356 aa6.51□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W DCS2Q12123 353 aa6.51□□□□□ -1.37
PTR2YKR093W RPT2P40327 437 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 36.4 ms