RNA–Protein interactions for RNA: YKR011C

YKR011C, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YKR011C, Length 1,062 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR011C	YKR011C	OCA5	P38738	679 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	VPS30	Q02948	557 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	UPC2	Q12151	913 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	CAN1	P04817	590 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	BET3	P36149	193 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	EXG2	P52911	562 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	HDA1	P53973	706 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	ENV7	Q12003	364 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	FBP1	P09201	348 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	MPH2	P0CD99	609 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	GAL11	P19659	1081 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	SED4	P25365	1065 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	STE14	P32584	239 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	RTA1	P53047	317 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	NTO1	Q12311	748 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	RPD3	P32561	433 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	CEP3	P40969	608 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	PHO23	P50947	330 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	GUP2	Q08929	609 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	YOR131C	Q12486	218 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	TRM2	P33753	639 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
YKR011C	YKR011C	NIT3	P49954	291 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	PPM2	Q08282	695 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	ENB1	Q08299	606 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	KAR4	P25583	335 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	EMC3	P36039	253 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	CTF8	P38877	133 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	SDP1	P40479	209 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	GYP8	P43570	497 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	ALG2	P43636	503 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	RPN4	Q03465	531 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	DAM1	P53267	343 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	PUS9	Q12069	462 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	LAS17	Q12446	633 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	MSE1	P48525	536 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	DAL7	P21826	554 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
YKR011C	YKR011C	BUD6	P41697	788 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	TAD1	P53065	400 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	PUS2	P53167	370 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKR011C	YKR011C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.52	□□□□□ -1.69	not detected
YKR011C	YKR011C	YHR078W	P38799	552 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	MSS4	P38994	779 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	ATP25	Q03153	612 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	YDR514C	Q04408	483 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	REH1	Q06709	432 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	ERR1	P0CX10	437 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	ERR2	P0CX11	437 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	SPC29	P33419	253 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	GDH3	P39708	457 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	AIM21	P40563	679 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	BUL1	P48524	976 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	SUN4	P53616	420 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	PEX19	Q07418	342 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	AIM39	Q08223	395 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	MET7	Q08645	548 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	YCL002C	P25565	263 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	TIM23	P32897	222 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	YPT53	P36019	220 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	NUP82	P40368	713 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	SWM1	Q12379	170 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	PRC1	P00729	532 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	RAD53	P22216	821 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	MAL11	P53048	616 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	ERG5	P54781	538 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	KIN4	Q01919	800 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YKR011C	YKR011C	CTF13	P35203	478 aa		4.48	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 51.4 ms