RNA–Protein interactions for RNA: YJL114W

YJL114W, Transcript of Retrotransposon TYA Gag gene co-transcribed with TYB Pol, yeastyeast

Gene YJL114W, Length 681 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL114WYJL114W STE13P33894 931 aa4.6□□□□□ -1.67
YJL114WYJL114W YRO2P38079 344 aa4.6□□□□□ -1.67
YJL114WYJL114W NAN1Q02931 896 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
YJL114WYJL114W TMN2Q04562 672 aa4.6□□□□□ -1.67
YJL114WYJL114W PEX19Q07418 342 aa4.6□□□□□ -1.67
YJL114WYJL114W ALG7P07286 448 aa4.59□□□□□ -1.67
YJL114WYJL114W RAD4P14736 754 aa4.59□□□□□ -1.67
YJL114WYJL114W RFA1P22336 621 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
YJL114WYJL114W MRP8P35719 219 aa4.59□□□□□ -1.67
YJL114WYJL114W YBR238CP38330 731 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
YJL114WYJL114W YKE2P52553 114 aa4.59□□□□□ -1.67
YJL114WYJL114W HUL5P53119 910 aa4.59□□□□□ -1.67
YJL114WYJL114W NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data4.59□□□□□ -1.67not detected
YJL114WYJL114W SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
YJL114WYJL114W BDF2Q07442 638 aa4.59□□□□□ -1.67
YJL114WYJL114W CDC53Q12018 815 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
YJL114WYJL114W PPR1P07272 904 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W NPP1P25353 742 aa4.58□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W YBR184WP38299 523 aa4.58□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W SWM1Q12379 170 aa4.58□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W YOR131CQ12486 218 aa4.58□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W SCT1P32784 759 aa4.57□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W STE5P32917 917 aa4.57□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W PBY1P38254 753 aa4.57□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W YIL108WP40483 696 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W CCM1P48237 864 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W RPN4Q03465 531 aa4.57□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W MET3P08536 511 aa4.56□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W CIT2P08679 460 aa4.56□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W SEC21P32074 935 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W SDP1P40479 209 aa4.56□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W IRR1P40541 1150 aa4.56□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W CEP3P40969 608 aa4.56□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W QRI1P43123 477 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W OSW7P43611 510 aa4.56□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W TIM54P47045 478 aa4.56□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W RNH70P53331 553 aa4.56□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W SLU7Q02775 382 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W SPO75Q07798 868 aa4.56□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W IRC10Q08118 586 aa4.56□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W RPD3P32561 433 aa4.55□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W TYE7P33122 291 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W NMD2P38798 1089 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W SIT1P39980 628 aa4.55□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W BUD6P41697 788 aa4.55□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W DLT1Q04216 342 aa4.55□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W TRM11Q12463 433 aa4.55□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W FBP1P09201 348 aa4.54□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W PRP9P19736 530 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W RPL8BP29453 256 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W AFR1P33304 620 aa4.54□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data4.54□□□□□ -1.68not detected
YJL114WYJL114W ERG5P54781 538 aa4.54□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W MUK1Q02866 612 aa4.54□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W LCD1Q04377 747 aa4.54□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W FMP25Q08023 583 aa4.54□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W FRE5Q08908 694 aa4.54□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W TRM13Q12383 476 aa4.54□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W OSH2Q12451 1283 aa4.54□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W RPS9AO13516 197 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W MTH1P35198 433 aa4.53□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W CTF13P35203 478 aa4.53□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W SPC42P36094 363 aa4.53□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W YHR020WP38708 688 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W ATF1P40353 525 aa4.53□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W DAS1P47005 663 aa4.53□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W YKR011CQ02209 353 aa4.53□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W FLC1Q08967 793 aa4.53□□□□□ -1.68
YJL114WYJL114W PPG1P32838 368 aa4.52□□□□□ -1.69
YJL114WYJL114W REC104P33323 182 aa4.52□□□□□ -1.69
YJL114WYJL114W CTF8P38877 133 aa4.52□□□□□ -1.69
YJL114WYJL114W RSP5P39940 809 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
YJL114WYJL114W YGR125WP53273 1036 aa4.52□□□□□ -1.69
YJL114WYJL114W UTP8P53276 713 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
YJL114WYJL114W GND2P53319 492 aa4.52□□□□□ -1.69
YJL114WYJL114W CIT1P00890 479 aa4.51□□□□□ -1.69
YJL114WYJL114W CAF20P12962 161 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
YJL114WYJL114W HSP60P19882 572 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
YJL114WYJL114W CDC11P32458 415 aa4.51□□□□□ -1.69
YJL114WYJL114W BRN1P38170 754 aa4.51□□□□□ -1.69
YJL114WYJL114W CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
YJL114WYJL114W ELO3P40319 345 aa4.51□□□□□ -1.69
YJL114WYJL114W PFD1P46988 109 aa4.51□□□□□ -1.69
YJL114WYJL114W PUS2P53167 370 aa4.51□□□□□ -1.69
YJL114WYJL114W EAF1Q06337 982 aa4.51□□□□□ -1.69
YJL114WYJL114W ARE1P25628 610 aa4.5□□□□□ -1.69
YJL114WYJL114W URA1P28272 314 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
YJL114WYJL114W CUE2P36075 443 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
YJL114WYJL114W PPS1P38148 807 aa4.5□□□□□ -1.69
YJL114WYJL114W YHL017WP38745 532 aa4.5□□□□□ -1.69
YJL114WYJL114W RPP1P38786 293 aa4.5□□□□□ -1.69
YJL114WYJL114W YHR078WP38799 552 aa4.5□□□□□ -1.69
YJL114WYJL114W GGA2P38817 585 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
YJL114WYJL114W TOK1P40310 691 aa4.5□□□□□ -1.69
YJL114WYJL114W NUP82P40368 713 aa4.5□□□□□ -1.69
YJL114WYJL114W ERP6P53198 216 aa4.5□□□□□ -1.69
YJL114WYJL114W LGE1Q02796 332 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
YJL114WYJL114W RRP14P36080 434 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
YJL114WYJL114W JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data4.49□□□□□ -1.69not detected
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