RNA–Protein interactions for RNA: YHR157W

REC104, Transcript of Protein involved in early stages of meiotic recombination, yeast

Gene REC104, Length 549 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
REC104	YHR157W	SPO11	P23179	398 aa		4.19	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	CNS1	P33313	385 aa		4.19	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	SPL2	P38839	148 aa		4.19	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	VID27	P40157	782 aa		4.19	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	SKP1	P52286	194 aa		4.19	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	LSB1	P53281	241 aa		4.19	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	RET3	P53600	189 aa		4.19	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	SML1	Q04964	104 aa		4.19	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	PSR2	Q07949	397 aa		4.19	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	TLG2	Q08144	397 aa		4.19	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	GRX6	Q12438	231 aa		4.19	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.19	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.19	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	MTF2	P10849	440 aa		4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	SNF3	P10870	884 aa		4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	MCM1	P11746	286 aa		4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	RPO26	P20435	155 aa		4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	RPC53	P25441	422 aa		4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	SEC65	P29478	273 aa		4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	DEP1	P31385	405 aa		4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	SWE1	P32944	819 aa		4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	YET1	P35723	206 aa		4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	UGA2	P38067	497 aa		4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	PCH2	P38126	564 aa		4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	GIP4	P39732	760 aa		4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	YGR237C	P50089	785 aa		4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	UBA2	P52488	636 aa		4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	ERG5	P54781	538 aa		4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	ERO1	Q03103	563 aa		4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	TRS120	Q04183	1289 aa		4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	VAC14	Q06708	880 aa		4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	APL4	Q12028	832 aa		4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	REC8	Q12188	680 aa		4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	PTC5	Q12511	572 aa		4.18	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	CDC8	P00572	216 aa		4.17	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	CKI1	P20485	582 aa		4.17	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	CLB1	P24868	471 aa		4.17	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	PXL1	P36166	706 aa		4.17	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	YHL050C	P38721	697 aa		4.17	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	VPS45	P38932	577 aa		4.17	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	VFA1	P40080	203 aa		4.17	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	NIT1	P40447	199 aa		4.17	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	CSM2	P40465	213 aa		4.17	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	MAD1	P40957	749 aa		4.17	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	THI6	P41835	540 aa		4.17	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	FOL1	P53848	824 aa		4.17	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	HDA1	P53973	706 aa		4.17	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	SEC5	P89102	971 aa		4.17	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	MDM1	Q01846	1127 aa		4.17	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	VPS30	Q02948	557 aa		4.17	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	YLH47	Q06493	454 aa		4.17	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	OMS1	Q06668	471 aa		4.17	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	ATG23	Q06671	453 aa		4.17	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	DSE3	Q08729	430 aa		4.17	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	SMC6	Q12749	1114 aa		4.17	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.16	□□□□□ -1.74	not detected
REC104	YHR157W	SRM1	P21827	482 aa		4.16	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	PRE8	P23639	250 aa		4.16	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	RTT107	P38850	1070 aa		4.16	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	ATG3	P40344	310 aa		4.16	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	LYS14	P40971	790 aa		4.16	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	PXA1	P41909	870 aa		4.16	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
REC104	YHR157W	COS5	P47187	383 aa		4.16	□□□□□ -1.74

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