RNA–Protein interactions for RNA: YHR128W

FUR1, Transcript of Uracil phosphoribosyltransferase, yeast

Gene FUR1, Length 651 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FUR1	YHR128W	VPS4	P52917	437 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FUR1	YHR128W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
FUR1	YHR128W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FUR1	YHR128W	GIP4	P39732	760 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FUR1	YHR128W	GSM1	P42950	618 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FUR1	YHR128W	RIM8	P53179	542 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FUR1	YHR128W	YGR117C	P53270	476 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FUR1	YHR128W	SNO2	P53823	222 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FUR1	YHR128W	IRC4	Q03036	179 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FUR1	YHR128W	RSC58	Q07979	502 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FUR1	YHR128W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FUR1	YHR128W	ADR1	P07248	1323 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	DAL5	P15365	543 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	KIP1	P28742	1111 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	HEM3	P28789	327 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	GPB2	P39717	880 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	PTC5	Q12511	572 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	SPS1	P08458	490 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	FLR1	P38124	548 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	YIL089W	P40500	205 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	MTC3	P53077	123 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	TIM50	Q02776	476 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	TOD6	P34219	525 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	ALG3	P38179	458 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	UBX2	Q04228	584 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	SOD2	P00447	233 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	ASF1	P32447	279 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	CCZ1	P38273	704 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	PNT1	P38969	423 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	PEA2	P40091	420 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	MRPS18	P42847	217 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	TNA1	P53322	534 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	HDA2	Q06629	674 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	MCD1	Q12158	566 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	POM152	P39685	1337 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	TAF13	P11747	167 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	CRF1	Q04930	467 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	RSB1	Q08417	382 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	CBP1	P07252	654 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	ENV11	P53246	860 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	SPO1	P53541	631 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	YNL193W	P53870	558 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	ROD1	Q02805	837 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	YOR352W	Q08816	343 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	SPO21	Q12411	609 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FUR1	YHR128W	RAD2	P07276	1031 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FUR1	YHR128W	SNF3	P10870	884 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FUR1	YHR128W	BAP2	P38084	609 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FUR1	YHR128W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
FUR1	YHR128W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
FUR1	YHR128W	YIR042C	P40586	236 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FUR1	YHR128W	YFH7	P43591	353 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FUR1	YHR128W	POL32	P47110	350 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FUR1	YHR128W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FUR1	YHR128W	SNF5	P18480	905 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FUR1	YHR128W	MKK2	P32491	506 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FUR1	YHR128W	PIK1	P39104	1066 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FUR1	YHR128W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FUR1	YHR128W	INM2	Q05533	292 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FUR1	YHR128W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FUR1	YHR128W	FLO1	P32768	1537 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FUR1	YHR128W	CYC8	P14922	966 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FUR1	YHR128W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
FUR1	YHR128W	SEC8	P32855	1065 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FUR1	YHR128W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FUR1	YHR128W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FUR1	YHR128W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FUR1	YHR128W	SIW14	P53965	281 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FUR1	YHR128W	SGD1	Q06132	899 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FUR1	YHR128W	MRL1	Q06815	381 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FUR1	YHR128W	CSR2	Q12734	1121 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FUR1	YHR128W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FUR1	YHR128W	MCM2	P29469	868 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FUR1	YHR128W	GRX7	P38068	203 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FUR1	YHR128W	MGE1	P38523	228 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FUR1	YHR128W	SPT20	P50875	604 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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