RNA–Protein interactions for RNA: YGR215W

RSM27, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene RSM27, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RSM27	YGR215W	MPH2	P0CD99	609 aa		5.3	□□□□□ -1.56
RSM27	YGR215W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
RSM27	YGR215W	PPM2	Q08282	695 aa		5.3	□□□□□ -1.56
RSM27	YGR215W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
RSM27	YGR215W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	5.29	□□□□□ -1.56
RSM27	YGR215W	CTS1	P29029	562 aa		5.29	□□□□□ -1.56
RSM27	YGR215W	SCT1	P32784	759 aa		5.29	□□□□□ -1.56
RSM27	YGR215W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
RSM27	YGR215W	GYP8	P43570	497 aa		5.29	□□□□□ -1.56
RSM27	YGR215W	ALG2	P43636	503 aa		5.29	□□□□□ -1.56
RSM27	YGR215W	NIT3	P49954	291 aa		5.29	□□□□□ -1.56
RSM27	YGR215W	NPC2	Q12408	173 aa		5.29	□□□□□ -1.56
RSM27	YGR215W	YTA7	P40340	1379 aa		5.29	□□□□□ -1.56
RSM27	YGR215W	YCR015C	P25616	317 aa		5.28	□□□□□ -1.56
RSM27	YGR215W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
RSM27	YGR215W	ATG19	P35193	415 aa		5.28	□□□□□ -1.56
RSM27	YGR215W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
RSM27	YGR215W	CHA4	P43634	648 aa		5.28	□□□□□ -1.56
RSM27	YGR215W	PUS2	P53167	370 aa		5.28	□□□□□ -1.56
RSM27	YGR215W	HDA1	P53973	706 aa		5.28	□□□□□ -1.56
RSM27	YGR215W	YKR011C	Q02209	353 aa		5.28	□□□□□ -1.56
RSM27	YGR215W	KCS1	Q12494	1050 aa		5.28	□□□□□ -1.56
RSM27	YGR215W	DAL7	P21826	554 aa		5.27	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	SED4	P25365	1065 aa		5.27	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	NUP82	P40368	713 aa		5.27	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	BUD6	P41697	788 aa		5.27	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	NCS6	P53088	359 aa		5.27	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	UPC2	Q12151	913 aa		5.27	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	CIT2	P08679	460 aa		5.26	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	TAD1	P53065	400 aa		5.26	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	STE11	P23561	717 aa		5.25	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	YCL002C	P25565	263 aa		5.25	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	EMC3	P36039	253 aa		5.25	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.25	□□□□□ -1.57	not detected
RSM27	YGR215W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	RAD53	P22216	821 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	PER1	P25625	357 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	SAP190	P36123	1033 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	GDH3	P39708	457 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	PHO23	P50947	330 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	DAM1	P53267	343 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	YOR022C	Q12204	715 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	PRC1	P00729	532 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	PHO8	P11491	566 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	HCM1	P25364	564 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	SPC29	P33419	253 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	YDR514C	Q04408	483 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	MET7	Q08645	548 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	YLR125W	Q12138	136 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	HAL9	Q12180	1030 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	KAR4	P25583	335 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	THI4	P32318	326 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	STE14	P32584	239 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	SDP1	P40479	209 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	EXG2	P52911	562 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RSM27	YGR215W	OSW7	P43611	510 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	MAL11	P53048	616 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	FBP1	P09201	348 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	YHR078W	P38799	552 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	MSS4	P38994	779 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	DSS1	P39112	969 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	SHR5	P41912	237 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	REH1	Q06709	432 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	CTF8	P38877	133 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	LAS17	Q12446	633 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	DCG1	P32460	244 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	PPG1	P32838	368 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	TY4A-J	P47023	414 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	ATP25	Q03153	612 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	CRR1	Q05790	422 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	RSC3	Q06639	885 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	PEX19	Q07418	342 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	NTO1	Q12311	748 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	SWM1	Q12379	170 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	MEF1	P25039	761 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	SSY5	P47002	699 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	ALY2	P47029	1046 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	RNH70	P53331	553 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	TRM2	P33753	639 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	SAK1	P38990	1142 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	VHR1	P40522	640 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	GUP2	Q08929	609 aa		5.16	□□□□□ -1.58

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