RNA–Protein interactions for RNA: YGR088W

CTT1, Transcript of Cytosolic catalase T, yeast

Gene CTT1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CTT1	YGR088W	ATG23	Q06671	453 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	VAC14	Q06708	880 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	GRC3	Q07845	632 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	YPR204W	Q08995	1032 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	DCS2	Q12123	353 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	LAM4	P38800	1345 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	RGP1	P16664	663 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	PTR2	P32901	601 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	RXT2	P38255	430 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	MXR1	P40029	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	EPL1	P43572	832 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	SHE10	P53075	577 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	FUS2	Q05670	677 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	RTP1	Q12751	981 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	FOB1	O13329	566 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	SIT4	P20604	311 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	AAD3	P25612	363 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	SEC65	P29478	273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	CNS1	P33313	385 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
CTT1	YGR088W	SPC72	P39723	622 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	EFM4	P40516	257 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	GCD10	P41814	478 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	SPR3	P41901	512 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	ACF4	P47129	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	YGR016W	P53209	190 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	HPC2	Q01448	625 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	YRM1	Q12340	786 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	SPS1	P08458	490 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
CTT1	YGR088W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	YET1	P35723	206 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	RRN3	P36070	627 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	RRF1	P38771	230 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	CTM1	P38818	585 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	SPT8	P38915	602 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	YJR079W	P47126	109 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	YNL193W	P53870	558 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	YNL115C	P53925	644 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	TFB3	Q03290	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	RMT2	Q03305	412 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	RRN11	Q04712	507 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	STE23	Q06010	1027 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	ARR2	Q06597	130 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	SSP2	Q08646	371 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	AFT2	Q08957	416 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	NUR1	Q12066	484 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	TAH18	Q12181	623 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	RMP1	Q12530	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	RSF2	P46974	1380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	SPO11	P23179	398 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	DAL80	P26343	269 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	YKL100C	P34248	587 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	GRX7	P38068	203 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	YSW1	P38280	609 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	HSM3	P38348	480 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	BCD1	P38772	366 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	SMF1	P38925	575 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	MIC19	P43594	170 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	INP52	P50942	1183 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	ERG5	P54781	538 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	UBP16	Q02863	499 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	RRI2	Q12348	645 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTT1	YGR088W	PBS2	P08018	668 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTT1	YGR088W	CDC6	P09119	513 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTT1	YGR088W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 98 ms