RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 LTBP1Q14766 1721 aa31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-216ENST00000628306 RIC1Q4ADV7 1423 aa31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-216ENST00000628306 VEGFBP49765 207 aa31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-216ENST00000628306 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM88BA6NKF7 163 aa31.67■■■□□ 2.66
CAPNS1-216ENST00000628306 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
CAPNS1-216ENST00000628306 NGEFQ8N5V2 710 aa31.66■■■□□ 2.66
CAPNS1-216ENST00000628306 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-216ENST00000628306 GPC2Q8N158 579 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-216ENST00000628306 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-216ENST00000628306 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-216ENST00000628306 NYXQ9GZU5 481 aa31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-216ENST00000628306 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-216ENST00000628306 SUSD4Q5VX71 490 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-216ENST00000628306 C3orf67Q6ZVT6 689 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-216ENST00000628306 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP31.61■■■□□ 2.65
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF34Q8IZ26 560 aa31.61■■■□□ 2.65
CAPNS1-216ENST00000628306 CNTROBQ8N137 903 aa31.61■■■□□ 2.65
CAPNS1-216ENST00000628306 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
CAPNS1-216ENST00000628306 RASSF10A6NK89 507 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-216ENST00000628306 LRP10Q7Z4F1 713 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-216ENST00000628306 PRDM10Q9NQV6 1147 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-216ENST00000628306 GPTP24298 496 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-216ENST00000628306 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-216ENST00000628306 WBP1LQ9NX94 342 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-216ENST00000628306 CLEC11AQ9Y240 323 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-216ENST00000628306 NTSR2O95665 410 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-216ENST00000628306 NFE2L2Q16236 605 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB3Q9H5J0 574 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-216ENST00000628306 MYL6BP14649 208 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-216ENST00000628306 SCNN1DP51172 638 aa31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-216ENST00000628306 JDP2Q8WYK2 163 aa31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-216ENST00000628306 CRAMP1Q96RY5 1269 aa31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF6Q6ZMV9 814 aa31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-216ENST00000628306 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-216ENST00000628306 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-216ENST00000628306 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP31.54■■■□□ 2.645e-6■■■■□ 22.9
CAPNS1-216ENST00000628306 PDIA6Q15084 440 aa31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-216ENST00000628306 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-216ENST00000628306 EPS15P42566 896 aa31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM9BQ8IZU0 186 aa31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-216ENST00000628306 GJA3Q9Y6H8 435 aa31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-216ENST00000628306 ERBB4Q15303 1308 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-216ENST00000628306 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF6P56537 245 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-216ENST00000628306 DEFB115Q30KQ5 88 aa31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-216ENST00000628306 GRIPAP1Q4V328 841 aa31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-216ENST00000628306 THSD7BQ9C0I4 1608 aa31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-216ENST00000628306 PROSER3Q2NL68 480 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-216ENST00000628306 LARGE2Q8N3Y3 721 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-216ENST00000628306 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-216ENST00000628306 LBX1P52954 281 aa31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-216ENST00000628306 AIDAQ96BJ3 306 aa31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-216ENST00000628306 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-216ENST00000628306 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC10A5Q5PT55 438 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-216ENST00000628306 NEFMP07197 916 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-216ENST00000628306 PARP10Q53GL7 1025 aa31.45■■■□□ 2.63
CAPNS1-216ENST00000628306 CST9Q5W186 159 aa31.44■■■□□ 2.62
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa31.44■■■□□ 2.62
CAPNS1-216ENST00000628306 LAMB2P55268 1798 aa31.44■■■□□ 2.62
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCC4O15439 1325 aa31.44■■■□□ 2.62
CAPNS1-216ENST00000628306 ANXA1P04083 346 aa31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-216ENST00000628306 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-216ENST00000628306 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAF5O00463 557 aa31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-216ENST00000628306 AOC3Q16853 763 aa31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-216ENST00000628306 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-216ENST00000628306 TSPYL4Q9UJ04 414 aa31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-216ENST00000628306 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-216ENST00000628306 TRPM7Q96QT4 1865 aa31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-216ENST00000628306 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-216ENST00000628306 NIM1KQ8IY84 436 aa31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-216ENST00000628306 NLRP3Q96P20 1036 aa31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-216ENST00000628306 PPIP5K2O43314 1243 aa31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-216ENST00000628306 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-216ENST00000628306 CXCL9Q07325 125 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-216ENST00000628306 VPS33BQ9H267 617 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-216ENST00000628306 GPRC5DQ9NZD1 345 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-216ENST00000628306 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-216ENST00000628306 CAPNS2Q96L46 248 aa31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP4F22Q6NT55 531 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-216ENST00000628306 NLRP10Q86W26 655 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-216ENST00000628306 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-216ENST00000628306 BABAM1Q9NWV8 329 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNRF3Q9ULT6 936 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-216ENST00000628306 TLL2Q9Y6L7 1015 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBED9Q6R2W3 1325 aa31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-216ENST00000628306 RIPK4P57078 832 aa31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-216ENST00000628306 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-216ENST00000628306 DUOX1Q9NRD9 1551 aa31.35■■■□□ 2.61
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