RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619023.4

AKAP9-216, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, human

TSL 5 BASIC

Gene AKAP9, Length 6,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP9-216	ENST00000619023	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	SNRK	Q9NRH2	765 aa		13.24	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	ZPR1	O75312	459 aa		13.23	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	HAND2	P61296	217 aa		13.23	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	NCOA7	Q8NI08	942 aa		13.23	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		13.23	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		13.23	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		13.23	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	SBNO1	A3KN83	1393 aa		13.23	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	MYOM2	P54296	1465 aa		13.23	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	13.23	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	KLHL34	Q8N239	644 aa		13.23	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	USP16	Q9Y5T5	823 aa		13.23	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		13.22	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	PTPN14	Q15678	1187 aa		13.22	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	ERVK-7	P63135	1459 aa		13.22	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		13.22	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		13.22	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	F13A1	P00488	732 aa		13.22	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	MCM5	P33992	734 aa		13.22	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		13.22	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023		Q6ZUG5	572 aa		13.22	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	G2E3	Q7L622	706 aa		13.22	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	EXOC5	O00471	708 aa		13.22	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	13.22	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	CHML	P26374	656 aa		13.22	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	13.22	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		13.22	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		13.21	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		13.21	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	CNNM3	Q8NE01	707 aa		13.21	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		13.21	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		13.21	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		13.21	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		13.21	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	MYO6	Q9UM54	1294 aa		13.21	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		13.21	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		13.21	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	CASQ1	P31415	396 aa		13.21	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	AK2	P54819	239 aa		13.21	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC181	Q5TID7	509 aa		13.21	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		13.21	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		13.21	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	NEO1	Q92859	1461 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	PPFIA3	O75145	1194 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	ODF2	Q5BJF6	829 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	IP6K1	Q92551	441 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	BRF1	Q92994	677 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	ARHGEF10	O15013	1369 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	ZSCAN12	O43309	604 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	IQCA1	Q86XH1	822 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC66	A2RUB6	948 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	ERLIN1	O75477	346 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	ADAMTS2	O95450	1211 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	SYCP1	Q15431	976 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	RUFY3	Q7L099	469 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	PANK2	Q9BZ23	570 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	13.19	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	KIAA1328	Q86T90	577 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	NEMF	O60524	1076 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	TFCP2	Q12800	502 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		13.18	□□□□□ -0.3

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