RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 ERC1Q8IUD2 1116 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-207ENST00000589146 RHPN1Q8TCX5 695 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM196AQ6ZSG2 479 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-207ENST00000589146 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-207ENST00000589146 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-207ENST00000589146 TTC22Q5TAA0 569 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-207ENST00000589146 NLRP10Q86W26 655 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF34Q8IZ26 560 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-207ENST00000589146 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-207ENST00000589146 PLA2G12BQ9BX93 195 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-207ENST00000589146 COPRSQ9NQ92 184 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-207ENST00000589146 STAP2Q9UGK3 403 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-207ENST00000589146 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-207ENST00000589146 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-207ENST00000589146 CDHR2Q9BYE9 1310 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-207ENST00000589146 CAMTA2O94983 1202 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-207ENST00000589146 AOX1Q06278 1338 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-207ENST00000589146 PDE1AP54750 535 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-207ENST00000589146 ARXQ96QS3 562 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-207ENST00000589146 BCORQ6W2J9 1755 aa28.09■■■□□ 2.09
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CAPNS1-207ENST00000589146 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
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CAPNS1-207ENST00000589146 TAF1LQ8IZX4 1826 aa28.08■■■□□ 2.09
CAPNS1-207ENST00000589146 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP28.07■■■□□ 2.081e-7■■■■■ 27.3
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CAPNS1-207ENST00000589146 RPS6KA4O75676 772 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-207ENST00000589146 MX1P20591 662 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-207ENST00000589146 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-207ENST00000589146 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
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CAPNS1-207ENST00000589146 CLEC4GQ6UXB4 293 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-207ENST00000589146 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-207ENST00000589146 SASH1O94885 1247 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-207ENST00000589146 PARP10Q53GL7 1025 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-207ENST00000589146 UBN2Q6ZU65 1347 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-207ENST00000589146 SEC24BO95487 1268 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-207ENST00000589146 CSF1RP07333 972 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-207ENST00000589146 GPTP24298 496 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-207ENST00000589146 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-207ENST00000589146 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-207ENST00000589146 AK7Q96M32 723 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF652Q9Y2D9 606 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNQ4P56696 695 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM89AQ96GI7 184 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-207ENST00000589146 SCN7AQ01118 1682 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-207ENST00000589146 CDC45O75419 566 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-207ENST00000589146 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
CAPNS1-207ENST00000589146 C4BP0C0L5 1744 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-207ENST00000589146 RXRBP28702 533 aa27.99■■■□□ 2.07
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CAPNS1-207ENST00000589146 TTC41PQ6P2S7 1318 aa27.98■■■□□ 2.07
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CAPNS1-207ENST00000589146 SLC27A3Q5K4L6 730 aa27.98■■■□□ 2.07
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CAPNS1-207ENST00000589146 SUSD4Q5VX71 490 aa27.97■■■□□ 2.07
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CAPNS1-207ENST00000589146 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-207ENST00000589146 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-207ENST00000589146 SIL1Q9H173 461 aa27.96■■■□□ 2.07
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CAPNS1-207ENST00000589146 MYH3P11055 1940 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 PDE8AO60658 829 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 PI4K2BQ8TCG2 481 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 BCL11AQ9H165 835 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 SH3TC1Q8TE82 1336 aa27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 GNPATO15228 680 aa27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM37O94972 964 aa27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 CTSWP56202 376 aa27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 SYNE4Q8N205 404 aa27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC4BQ9NT99 713 aa27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 CHMP3Q9Y3E7 222 aa27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 EYA2O00167 538 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
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CAPNS1-207ENST00000589146 IL15P40933 162 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 ATG9AQ7Z3C6 839 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 TTLL11Q8NHH1 800 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 BCL2L12Q9HB09 334 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 GPR108Q9NPR9 543 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 LAMB2P55268 1798 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 NTSR2O95665 410 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC57Q2TAC2 916 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 AACSQ86V21 672 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 GPATCH3Q96I76 525 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 ADRA2BP18089 450 aa27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 TSHZ3Q63HK5 1081 aa27.91■■■□□ 2.06
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