RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 RGPD5Q99666 1765 aa18.13■□□□□ 0.49
CTIF-205ENST00000587860 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
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CTIF-205ENST00000587860 TMEM63CQ9P1W3 806 aa18.12■□□□□ 0.49
CTIF-205ENST00000587860 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP18.12■□□□□ 0.49
CTIF-205ENST00000587860 PPFIA3O75145 1194 aa18.12■□□□□ 0.49
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CTIF-205ENST00000587860 DMTNQ08495 405 aa18.12■□□□□ 0.49
CTIF-205ENST00000587860 NEURL1BA8MQ27 555 aa18.11■□□□□ 0.49
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CTIF-205ENST00000587860 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa18.09■□□□□ 0.49
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CTIF-205ENST00000587860 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
CTIF-205ENST00000587860 TFCP2Q12800 502 aa18.08■□□□□ 0.49
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CTIF-205ENST00000587860 KAT6BQ8WYB5 2073 aa18.08■□□□□ 0.48
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CTIF-205ENST00000587860 FAM173BQ6P4H8 233 aa18.07■□□□□ 0.48
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CTIF-205ENST00000587860 HEG1Q9ULI3 1381 aa18.05■□□□□ 0.48
CTIF-205ENST00000587860 ANAPC15P60006 121 aa18.05■□□□□ 0.48
CTIF-205ENST00000587860 MTX1Q13505 466 aa18.05■□□□□ 0.48
CTIF-205ENST00000587860 LMBR1LQ6UX01 489 aa18.05■□□□□ 0.48
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CTIF-205ENST00000587860 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
CTIF-205ENST00000587860 NBPF26B4DH59 902 aa18.04■□□□□ 0.48
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CTIF-205ENST00000587860 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
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CTIF-205ENST00000587860 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
CTIF-205ENST00000587860 FOSBP53539 338 aa18.04■□□□□ 0.48
CTIF-205ENST00000587860 TIMM10P62072 90 aa18.04■□□□□ 0.48
CTIF-205ENST00000587860 CBX1P83916 185 aa18.04■□□□□ 0.48
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CTIF-205ENST00000587860 TTC14Q96N46 770 aa18.03■□□□□ 0.48
CTIF-205ENST00000587860 FMNL2Q96PY5 1086 aa18.03■□□□□ 0.48
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CTIF-205ENST00000587860 AOX1Q06278 1338 aa18.02■□□□□ 0.48
CTIF-205ENST00000587860 TTC41PQ6P2S7 1318 aa18.02■□□□□ 0.48
CTIF-205ENST00000587860 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
CTIF-205ENST00000587860 SMC3Q9UQE7 1217 aa18.02■□□□□ 0.48
CTIF-205ENST00000587860 KDM3BQ7LBC6 1761 aa18.02■□□□□ 0.48
CTIF-205ENST00000587860 CACNA1FO60840 1977 aa18.02■□□□□ 0.47
CTIF-205ENST00000587860 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
CTIF-205ENST00000587860 ME3Q16798 604 aa18.02■□□□□ 0.47
CTIF-205ENST00000587860 EVI5LQ96CN4 794 aa18.02■□□□□ 0.47
CTIF-205ENST00000587860 DCAF5Q96JK2 942 aa18.02■□□□□ 0.47
CTIF-205ENST00000587860 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa18.02■□□□□ 0.47
CTIF-205ENST00000587860 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
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