RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 CAMTA2O94983 1202 aa31.73■■■□□ 2.67
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP31.73■■■□□ 2.67
CAPNS1-204ENST00000587718 CARMIL3Q8ND23 1372 aa31.71■■■□□ 2.67
CAPNS1-204ENST00000587718 SCN7AQ01118 1682 aa31.7■■■□□ 2.67
CAPNS1-204ENST00000587718 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.67
CAPNS1-204ENST00000587718 MIS18AQ9NYP9 233 aa31.7■■■□□ 2.67
CAPNS1-204ENST00000587718 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
CAPNS1-204ENST00000587718 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-204ENST00000587718 NBPF26B4DH59 902 aa31.67■■■□□ 2.66
CAPNS1-204ENST00000587718 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
CAPNS1-204ENST00000587718 CHD1LQ86WJ1 897 aa31.67■■■□□ 2.66
CAPNS1-204ENST00000587718 NBPF15Q8N660 670 aa31.67■■■□□ 2.66
CAPNS1-204ENST00000587718 TSPYL4Q9UJ04 414 aa31.66■■■□□ 2.66
CAPNS1-204ENST00000587718 KIF3CO14782 793 aa31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-204ENST00000587718 C9orf131Q5VYM1 1079 aa31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-204ENST00000587718 PRR5LQ6MZQ0 368 aa31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-204ENST00000587718 C2CD5Q86YS7 1000 aa31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-204ENST00000587718 TBC1D32Q96NH3 1257 aa31.64■■■□□ 2.65
CAPNS1-204ENST00000587718 CHMP4AQ9BY43 222 aa31.64■■■□□ 2.65
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-204ENST00000587718 SETDB2Q96T68 719 aa31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-204ENST00000587718 BRIP1Q9BX63 1249 aa31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-204ENST00000587718 H0YIN7 160 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-204ENST00000587718 BECN1Q14457 450 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-204ENST00000587718 CLEC4GQ6UXB4 293 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-204ENST00000587718 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-204ENST00000587718 TTLL6Q8N841 843 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-204ENST00000587718 CACNA1FO60840 1977 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-204ENST00000587718 DLEC1Q9Y238 1755 aa31.61■■■□□ 2.65
CAPNS1-204ENST00000587718 BCORQ6W2J9 1755 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
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CAPNS1-204ENST00000587718 BMP2KLQ5H9B9 411 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-204ENST00000587718 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-204ENST00000587718 RGL2O15211 777 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-204ENST00000587718 PDE6BP35913 854 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-204ENST00000587718 KDM3BQ7LBC6 1761 aa31.57■■■□□ 2.65
CAPNS1-204ENST00000587718 SEC24BO95487 1268 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-204ENST00000587718 CCT4P50991 539 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD44Q8N8A2 993 aa31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-204ENST00000587718 CNBD1Q8NA66 436 aa31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-204ENST00000587718 SIRT2Q8IXJ6 389 aa31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF181Q9P0P0 153 aa31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC30Q5VVM6 783 aa31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-204ENST00000587718 DCTPP1Q9H773 170 aa31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-204ENST00000587718 PRELPP51888 382 aa31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-204ENST00000587718 STK31Q9BXU1 1019 aa31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC4A2P04920 1241 aa31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF652Q9Y2D9 606 aa31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-204ENST00000587718 RASSF7Q02833 373 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-204ENST00000587718 KRT24Q2M2I5 525 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-204ENST00000587718 NMRK2Q9NPI5 230 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-204ENST00000587718 HOXB7P09629 217 aa31.51■■■□□ 2.64
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP31.51■■■□□ 2.64
CAPNS1-204ENST00000587718 LAMB4A4D0S4 1761 aa31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-204ENST00000587718 SBF1O95248 1867 aa31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-204ENST00000587718 HLFQ16534 295 aa31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-204ENST00000587718 ST5P78524 1137 aa31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD45Q5TZF3 282 aa31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-204ENST00000587718 LNPKQ9C0E8 428 aa31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-204ENST00000587718 NFKBIEO00221 500 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-204ENST00000587718 SRGNP10124 158 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-204ENST00000587718 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-204ENST00000587718 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-204ENST00000587718 LMNB1P20700 586 aa31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-204ENST00000587718 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-204ENST00000587718 NPHP1O15259 732 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-204ENST00000587718 HSPA6P17066 643 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-204ENST00000587718 STYK1Q6J9G0 422 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-204ENST00000587718 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-204ENST00000587718 HMMRO75330 724 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-204ENST00000587718 TOMM70O94826 608 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-204ENST00000587718 C1orf115Q9H7X2 142 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-204ENST00000587718 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-204ENST00000587718 ERVV-1B6SEH8 477 aa31.45■■■□□ 2.63
CAPNS1-204ENST00000587718 NBR1Q14596 966 aa31.45■■■□□ 2.63
CAPNS1-204ENST00000587718 TPTE2Q6XPS3 522 aa31.45■■■□□ 2.63
CAPNS1-204ENST00000587718 C21orf2O43822 256 aa31.44■■■□□ 2.62
CAPNS1-204ENST00000587718 CEP85Q6P2H3 762 aa31.44■■■□□ 2.62
CAPNS1-204ENST00000587718 CNKSR1Q969H4 720 aa31.44■■■□□ 2.62
CAPNS1-204ENST00000587718 MASTLQ96GX5 879 aa31.44■■■□□ 2.62
CAPNS1-204ENST00000587718 C22orf23Q9BZE7 217 aa31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-204ENST00000587718 CEP350Q5VT06 3117 aa31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-204ENST00000587718 TTLL7Q6ZT98 887 aa31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-204ENST00000587718 ERBB4Q15303 1308 aa31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-204ENST00000587718 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-204ENST00000587718 MYL6BP14649 208 aa31.4■■■□□ 2.62
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CAPNS1-204ENST00000587718 LRP10Q7Z4F1 713 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-204ENST00000587718 GNAI3P08754 354 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-204ENST00000587718 FLIIQ13045 1269 aa31.39■■■□□ 2.61
CAPNS1-204ENST00000587718 PDIA6Q15084 440 aa31.39■■■□□ 2.61
CAPNS1-204ENST00000587718 C7orf43Q8WVR3 580 aa31.39■■■□□ 2.61
CAPNS1-204ENST00000587718 RRAGCQ9HB90 399 aa31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-204ENST00000587718 SLX4Q8IY92 1834 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-204ENST00000587718 LTBP3Q9NS15 1303 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM177BA6PVY3 158 aa31.37■■■□□ 2.61
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