RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 VTI1BQ9UEU0 232 aa4.69□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 PARP2Q9UGN5 583 aa4.69□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 PRKAB1Q9Y478 270 aa4.69□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 PHF20L1A8MW92 1017 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 PRMT3O60678 531 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 PPFIA4O75335 1185 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 ARHGAP4P98171 946 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 USP4Q13107 963 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 PSMD2Q13200 908 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 PDE3BQ13370 1112 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 TMTC2Q8N394 836 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 EHBP1Q8NDI1 1231 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 SLC10A4Q96EP9 437 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 SGSM3Q96HU1 749 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 HINFPQ9BQA5 517 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 OCSTAMPQ9BR26 566 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 RBCK1Q9BYM8 510 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 PRDM10Q9NQV6 1147 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 ENPP3O14638 875 aa4.67□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 PRC1O43663 620 aa4.67□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 LDHBP07195 334 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 FURINP09958 794 aa4.67□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 TBX4P57082 545 aa4.67□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 RHBDL3P58872 404 aa4.67□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 DAB2P98082 770 aa4.67□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 ECM1Q16610 540 aa4.67□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa4.67□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 FMNL3Q8IVF7 1028 aa4.67□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 ZNF654Q8IZM8 581 aa4.67□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 NME8Q8N427 588 aa4.67□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 FRMD6Q96NE9 622 aa4.67□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa4.67□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa4.67□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 TREHO43280 583 aa4.66□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 TIMP2P16035 220 aa4.66□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 PAX3P23760 479 aa4.66□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 GTF2IP78347 998 aa4.66□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 ATP2B2Q01814 1243 aa4.66□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 PLCB3Q01970 1234 aa4.66□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 ARID5BQ14865 1188 aa4.66□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 ERFEQ4G0M1 354 aa4.66□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 C4orf46Q504U0 113 aa4.66□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 TMC7Q7Z402 723 aa4.66□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 CKAP2LQ8IYA6 745 aa4.66□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 ZNF511Q8NB15 262 aa4.66□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 PRIMPOLQ96LW4 560 aa4.66□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 FAM161BQ96MY7 647 aa4.66□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 RPS6KC1Q96S38 1066 aa4.66□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 MAF1Q9H063 256 aa4.66□□□□□ -1.66
CS-232ENST00000552331 NDUFB5O43674 189 aa4.65□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 LGR5O75473 907 aa4.65□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 MYCP01106 439 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 MAPK8P45983 427 aa4.65□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 SEC13P55735 322 aa4.65□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 CLDN10P78369 228 aa4.65□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP4.65□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 OCLNQ16625 522 aa4.65□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 NBPF20Q3BBV1 942 aa4.65□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 NBPF6Q5VWK0 638 aa4.65□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 CCDC102BQ68D86 513 aa4.65□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 TMC1Q8TDI8 760 aa4.65□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 JDP2Q8WYK2 163 aa4.65□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 MKL1Q969V6 931 aa4.65□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 EVI5LQ96CN4 794 aa4.65□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 NBPF4Q96M43 638 aa4.65□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP4.65□□□□□ -1.675e-7■□□□□ 10.2
CS-232ENST00000552331 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 PNMA2Q9UL42 364 aa4.65□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 PRR12Q9ULL5 1215 aa4.65□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 SFI1A8K8P3 1242 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 FAM13AO94988 1023 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 ADH1CP00326 375 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 PDGFRBP09619 1106 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 SH3BP2P78314 561 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 MAP3K10Q02779 954 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 LYPD4Q6UWN0 246 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 MCF2L2Q86YR7 1114 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 TPCN2Q8NHX9 752 aa4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms