RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551483.5

CNOT2-231, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 2 BASIC

Gene CNOT2, Length 4,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-231	ENST00000551483	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	FGA	P02671	866 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	MAGEA8	P43361	318 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483		Q3C1V9	767 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	EXOC1	Q9NV70	894 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	CFAP45	Q9UL16	551 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	PPP2R5C	Q13362	524 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	TEX19	Q8NA77	164 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	NEK9	Q8TD19	979 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	TOMM22	Q9NS69	142 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483		A0A1W2PRQ8	180 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	MYO1B	O43795	1136 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	NUCB1	Q02818	461 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	PTPN14	Q15678	1187 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	ANO1	Q5XXA6	986 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM87B	Q96K49	555 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	MAP3K14	Q99558	947 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	NACA2	Q9H009	215 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	DEF6	Q9H4E7	631 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	KRT38	O76015	456 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	CDC27	P30260	824 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	KIF5B	P33176	963 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	SERPINB4	P48594	390 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	DDX12P	Q92771	950 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	GPSM2	P81274	684 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	KRT77	Q7Z794	578 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	MME	P08473	750 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	MYL3	P08590	195 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	TRDN	Q13061	729 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	PARP10	Q53GL7	1025 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	GINM1	Q9NU53	330 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	CCDC159	P0C7I6	412 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	SMARCA1	P28370	1054 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	KIF11	P52732	1056 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	PTK7	Q13308	1070 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	CCDC102A	Q96A19	550 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	VEZT	Q9HBM0	779 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	DAAM2	Q86T65	1068 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	USP48	Q86UV5	1035 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	PLPP6	Q8IY26	295 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	NELL1	Q92832	810 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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