RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540665.5

TTC28-AS1-221, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NPR1P16066 1061 aa20.84■□□□□ 0.93
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 CRY2Q49AN0 593 aa20.84■□□□□ 0.93
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.83■□□□□ 0.93
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 C9orf131Q5VYM1 1079 aa20.74■□□□□ 0.91
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF428Q96B54 188 aa20.67■□□□□ 0.9
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CDHR2Q9BYE9 1310 aa20.67■□□□□ 0.9
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 WDR90Q96KV7 1748 aa20.65■□□□□ 0.9
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NEURL1BA8MQ27 555 aa20.65■□□□□ 0.9
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PSMD1Q99460 953 aa20.65■□□□□ 0.9
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SPEF2Q9C093 1822 aa20.64■□□□□ 0.9
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GRAPQ13588 217 aa20.64■□□□□ 0.89
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMC4Q7Z404 712 aa20.64■□□□□ 0.89
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.64■□□□□ 0.89
TTC28-AS1-221ENST00000540665 COL4A1P02462 1669 aa20.64■□□□□ 0.89
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.63■□□□□ 0.89
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BBOX1O75936 387 aa20.63■□□□□ 0.89
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
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