RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529957.5

GNPTG-208, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, human

TSL 5

Gene GNPTG, Length 922 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNPTG-208	ENST00000529957	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
GNPTG-208	ENST00000529957	NEUROD2	Q15784	382 aa		28.95	■■■□□ 2.22
GNPTG-208	ENST00000529957	CHADL	Q6NUI6	762 aa		28.95	■■■□□ 2.22
GNPTG-208	ENST00000529957	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
GNPTG-208	ENST00000529957	KRT24	Q2M2I5	525 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GNPTG-208	ENST00000529957	NECTIN2	Q92692	538 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GNPTG-208	ENST00000529957	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GNPTG-208	ENST00000529957	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		28.93	■■■□□ 2.22
GNPTG-208	ENST00000529957	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	28.93	■■■□□ 2.22
GNPTG-208	ENST00000529957	FZD9	O00144	591 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GNPTG-208	ENST00000529957	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
GNPTG-208	ENST00000529957	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GNPTG-208	ENST00000529957	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GNPTG-208	ENST00000529957	PSMD1	Q99460	953 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GNPTG-208	ENST00000529957	LAMB2	P55268	1798 aa		28.9	■■■□□ 2.22
GNPTG-208	ENST00000529957	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		28.9	■■■□□ 2.22
GNPTG-208	ENST00000529957	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		28.89	■■■□□ 2.22
GNPTG-208	ENST00000529957	CHL1	O00533	1208 aa		28.89	■■■□□ 2.22
GNPTG-208	ENST00000529957	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
GNPTG-208	ENST00000529957	PARP10	Q53GL7	1025 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GNPTG-208	ENST00000529957	COPS6	Q7L5N1	327 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GNPTG-208	ENST00000529957	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GNPTG-208	ENST00000529957	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GNPTG-208	ENST00000529957	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
GNPTG-208	ENST00000529957	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
GNPTG-208	ENST00000529957	LDHD	Q86WU2	507 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GNPTG-208	ENST00000529957	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GNPTG-208	ENST00000529957	RUNDC1	Q96C34	613 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GNPTG-208	ENST00000529957	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
GNPTG-208	ENST00000529957	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GNPTG-208	ENST00000529957	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GNPTG-208	ENST00000529957	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GNPTG-208	ENST00000529957	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GNPTG-208	ENST00000529957	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
GNPTG-208	ENST00000529957	TAF1	P21675	1872 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GNPTG-208	ENST00000529957	PASK	Q96RG2	1323 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GNPTG-208	ENST00000529957	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
GNPTG-208	ENST00000529957	HACL1	Q9UJ83	578 aa		28.85	■■■□□ 2.21
GNPTG-208	ENST00000529957	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
GNPTG-208	ENST00000529957	LTBP1	Q14766	1721 aa		28.85	■■■□□ 2.21
GNPTG-208	ENST00000529957	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
GNPTG-208	ENST00000529957	NLRP3	Q96P20	1036 aa		28.84	■■■□□ 2.21
GNPTG-208	ENST00000529957	CREBZF	Q9NS37	354 aa		28.84	■■■□□ 2.21
GNPTG-208	ENST00000529957	EPHX2	P34913	555 aa		28.83	■■■□□ 2.21
GNPTG-208	ENST00000529957	ZNF428	Q96B54	188 aa		28.83	■■■□□ 2.21
GNPTG-208	ENST00000529957	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
GNPTG-208	ENST00000529957	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	28.82	■■■□□ 2.2	7e-6	■■■■■ 27.3
GNPTG-208	ENST00000529957	NLRP10	Q86W26	655 aa		28.82	■■■□□ 2.2
GNPTG-208	ENST00000529957	GPC2	Q8N158	579 aa		28.82	■■■□□ 2.2
GNPTG-208	ENST00000529957	JDP2	Q8WYK2	163 aa		28.82	■■■□□ 2.2
GNPTG-208	ENST00000529957	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	28.82	■■■□□ 2.2
GNPTG-208	ENST00000529957	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
GNPTG-208	ENST00000529957	ABCC4	O15439	1325 aa		28.81	■■■□□ 2.2
GNPTG-208	ENST00000529957	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		28.81	■■■□□ 2.2
GNPTG-208	ENST00000529957	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
GNPTG-208	ENST00000529957	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
GNPTG-208	ENST00000529957	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
GNPTG-208	ENST00000529957	TCIRG1	Q13488	830 aa		28.8	■■■□□ 2.2
GNPTG-208	ENST00000529957	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		28.79	■■■□□ 2.2
GNPTG-208	ENST00000529957	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
GNPTG-208	ENST00000529957	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		28.78	■■■□□ 2.2
GNPTG-208	ENST00000529957	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		28.78	■■■□□ 2.2
GNPTG-208	ENST00000529957	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		28.78	■■■□□ 2.2
GNPTG-208	ENST00000529957	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
GNPTG-208	ENST00000529957	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		28.77	■■■□□ 2.2
GNPTG-208	ENST00000529957	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		28.77	■■■□□ 2.2
GNPTG-208	ENST00000529957	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
GNPTG-208	ENST00000529957	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
GNPTG-208	ENST00000529957	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		28.76	■■■□□ 2.19
GNPTG-208	ENST00000529957	SCNN1D	P51172	638 aa		28.75	■■■□□ 2.19
GNPTG-208	ENST00000529957	AOC3	Q16853	763 aa		28.75	■■■□□ 2.19
GNPTG-208	ENST00000529957	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
GNPTG-208	ENST00000529957	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
GNPTG-208	ENST00000529957	CNTNAP1	P78357	1384 aa		28.74	■■■□□ 2.19
GNPTG-208	ENST00000529957	PPIP5K2	O43314	1243 aa		28.73	■■■□□ 2.19
GNPTG-208	ENST00000529957	EPS15	P42566	896 aa		28.73	■■■□□ 2.19
GNPTG-208	ENST00000529957	CNTROB	Q8N137	903 aa		28.73	■■■□□ 2.19
GNPTG-208	ENST00000529957	CFAP44	Q96MT7	982 aa		28.73	■■■□□ 2.19
GNPTG-208	ENST00000529957	MBIP	Q9NS73	344 aa		28.73	■■■□□ 2.19
GNPTG-208	ENST00000529957	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		28.72	■■■□□ 2.19
GNPTG-208	ENST00000529957	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		28.72	■■■□□ 2.19
GNPTG-208	ENST00000529957	COL4A1	P02462	1669 aa		28.71	■■■□□ 2.19
GNPTG-208	ENST00000529957	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		28.71	■■■□□ 2.19
GNPTG-208	ENST00000529957	HOXB7	P09629	217 aa		28.71	■■■□□ 2.19
GNPTG-208	ENST00000529957	NIM1K	Q8IY84	436 aa		28.71	■■■□□ 2.19
GNPTG-208	ENST00000529957	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		28.71	■■■□□ 2.19
GNPTG-208	ENST00000529957	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
GNPTG-208	ENST00000529957	BBOX1	O75936	387 aa		28.7	■■■□□ 2.18
GNPTG-208	ENST00000529957	ZNF853	P0CG23	659 aa		28.7	■■■□□ 2.18
GNPTG-208	ENST00000529957	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		28.7	■■■□□ 2.18
GNPTG-208	ENST00000529957	SP8	Q8IXZ3	490 aa		28.7	■■■□□ 2.18
GNPTG-208	ENST00000529957	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		28.7	■■■□□ 2.18
GNPTG-208	ENST00000529957	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		28.69	■■■□□ 2.18
GNPTG-208	ENST00000529957	APAF1	O14727	1248 aa		28.69	■■■□□ 2.18
GNPTG-208	ENST00000529957	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
GNPTG-208	ENST00000529957	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	28.68	■■■□□ 2.18
GNPTG-208	ENST00000529957	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GNPTG-208	ENST00000529957	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GNPTG-208	ENST00000529957	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
GNPTG-208	ENST00000529957	VEGFB	P49765	207 aa		28.67	■■■□□ 2.18

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