RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527871.5

RPS2-208, Transcript of ribosomal protein S2, human

TSL 1 (best)

Gene RPS2, Length 1,243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS2-208	ENST00000527871	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		31.93	■■■□□ 2.7
RPS2-208	ENST00000527871	NEUROD2	Q15784	382 aa		31.92	■■■□□ 2.7
RPS2-208	ENST00000527871	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		31.92	■■■□□ 2.7
RPS2-208	ENST00000527871	KRT24	Q2M2I5	525 aa		31.91	■■■□□ 2.7
RPS2-208	ENST00000527871	RUNDC1	Q96C34	613 aa		31.91	■■■□□ 2.7
RPS2-208	ENST00000527871	PSMD1	Q99460	953 aa		31.91	■■■□□ 2.7
RPS2-208	ENST00000527871	FZD9	O00144	591 aa		31.9	■■■□□ 2.7
RPS2-208	ENST00000527871	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
RPS2-208	ENST00000527871	PARP10	Q53GL7	1025 aa		31.9	■■■□□ 2.7
RPS2-208	ENST00000527871	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		31.9	■■■□□ 2.7
RPS2-208	ENST00000527871	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		31.9	■■■□□ 2.7
RPS2-208	ENST00000527871	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		31.9	■■■□□ 2.7
RPS2-208	ENST00000527871	CHADL	Q6NUI6	762 aa		31.89	■■■□□ 2.7
RPS2-208	ENST00000527871	SLC51A	Q86UW1	340 aa		31.89	■■■□□ 2.7
RPS2-208	ENST00000527871	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		31.88	■■■□□ 2.69
RPS2-208	ENST00000527871	COPS6	Q7L5N1	327 aa		31.88	■■■□□ 2.69
RPS2-208	ENST00000527871	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		31.88	■■■□□ 2.69
RPS2-208	ENST00000527871	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	31.88	■■■□□ 2.69
RPS2-208	ENST00000527871	NECTIN2	Q92692	538 aa		31.87	■■■□□ 2.69
RPS2-208	ENST00000527871	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
RPS2-208	ENST00000527871	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		31.86	■■■□□ 2.69
RPS2-208	ENST00000527871	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	31.86	■■■□□ 2.69
RPS2-208	ENST00000527871	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		31.85	■■■□□ 2.69
RPS2-208	ENST00000527871	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
RPS2-208	ENST00000527871	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
RPS2-208	ENST00000527871	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	31.85	■■■□□ 2.69
RPS2-208	ENST00000527871	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	31.84	■■■□□ 2.69
RPS2-208	ENST00000527871	SCN4A	P35499	1836 aa		31.84	■■■□□ 2.69
RPS2-208	ENST00000527871	COL4A5	P29400	1685 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RPS2-208	ENST00000527871	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
RPS2-208	ENST00000527871	NLRP10	Q86W26	655 aa		31.82	■■■□□ 2.68
RPS2-208	ENST00000527871	NLRP3	Q96P20	1036 aa		31.82	■■■□□ 2.68
RPS2-208	ENST00000527871	TCIRG1	Q13488	830 aa		31.81	■■■□□ 2.68
RPS2-208	ENST00000527871	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		31.81	■■■□□ 2.68
RPS2-208	ENST00000527871	LDHD	Q86WU2	507 aa		31.81	■■■□□ 2.68
RPS2-208	ENST00000527871	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
RPS2-208	ENST00000527871	PASK	Q96RG2	1323 aa		31.79	■■■□□ 2.68
RPS2-208	ENST00000527871	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	31.79	■■■□□ 2.68
RPS2-208	ENST00000527871	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		31.79	■■■□□ 2.68
RPS2-208	ENST00000527871	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		31.79	■■■□□ 2.68
RPS2-208	ENST00000527871	HACL1	Q9UJ83	578 aa		31.79	■■■□□ 2.68
RPS2-208	ENST00000527871	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		31.78	■■■□□ 2.68
RPS2-208	ENST00000527871	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
RPS2-208	ENST00000527871	GPC2	Q8N158	579 aa		31.78	■■■□□ 2.68
RPS2-208	ENST00000527871	CFAP44	Q96MT7	982 aa		31.78	■■■□□ 2.68
RPS2-208	ENST00000527871	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
RPS2-208	ENST00000527871	HOXB7	P09629	217 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RPS2-208	ENST00000527871	JDP2	Q8WYK2	163 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RPS2-208	ENST00000527871	CREBZF	Q9NS37	354 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RPS2-208	ENST00000527871	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RPS2-208	ENST00000527871	EPHX2	P34913	555 aa		31.76	■■■□□ 2.67
RPS2-208	ENST00000527871	ZNF853	P0CG23	659 aa		31.75	■■■□□ 2.67
RPS2-208	ENST00000527871	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
RPS2-208	ENST00000527871	ABCC4	O15439	1325 aa		31.75	■■■□□ 2.67
RPS2-208	ENST00000527871	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		31.74	■■■□□ 2.67
RPS2-208	ENST00000527871	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67
RPS2-208	ENST00000527871	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		31.72	■■■□□ 2.67
RPS2-208	ENST00000527871	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		31.72	■■■□□ 2.67
RPS2-208	ENST00000527871	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	31.72	■■■□□ 2.67
RPS2-208	ENST00000527871	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	31.72	■■■□□ 2.67
RPS2-208	ENST00000527871	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		31.72	■■■□□ 2.67
RPS2-208	ENST00000527871	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		31.72	■■■□□ 2.67
RPS2-208	ENST00000527871	MBIP	Q9NS73	344 aa		31.72	■■■□□ 2.67
RPS2-208	ENST00000527871	BBOX1	O75936	387 aa		31.71	■■■□□ 2.67
RPS2-208	ENST00000527871	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	31.71	■■■□□ 2.67
RPS2-208	ENST00000527871	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		31.71	■■■□□ 2.67
RPS2-208	ENST00000527871	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		31.71	■■■□□ 2.67
RPS2-208	ENST00000527871	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		31.71	■■■□□ 2.67
RPS2-208	ENST00000527871	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	31.71	■■■□□ 2.67
RPS2-208	ENST00000527871	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	31.71	■■■□□ 2.67
RPS2-208	ENST00000527871	APAF1	O14727	1248 aa		31.7	■■■□□ 2.67
RPS2-208	ENST00000527871	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	31.7	■■■□□ 2.67
RPS2-208	ENST00000527871	SP8	Q8IXZ3	490 aa		31.7	■■■□□ 2.67
RPS2-208	ENST00000527871	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		31.7	■■■□□ 2.66
RPS2-208	ENST00000527871	VPS33B	Q9H267	617 aa		31.69	■■■□□ 2.66
RPS2-208	ENST00000527871	SCNN1D	P51172	638 aa		31.68	■■■□□ 2.66
RPS2-208	ENST00000527871	ZNF428	Q96B54	188 aa		31.68	■■■□□ 2.66
RPS2-208	ENST00000527871	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		31.68	■■■□□ 2.66
RPS2-208	ENST00000527871	LAMB2	P55268	1798 aa		31.67	■■■□□ 2.66
RPS2-208	ENST00000527871	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	31.67	■■■□□ 2.66
RPS2-208	ENST00000527871	LTBP1	Q14766	1721 aa		31.66	■■■□□ 2.66
RPS2-208	ENST00000527871	AOC3	Q16853	763 aa		31.66	■■■□□ 2.66
RPS2-208	ENST00000527871	CNTROB	Q8N137	903 aa		31.66	■■■□□ 2.66
RPS2-208	ENST00000527871	HYPK	Q9NX55	129 aa		31.66	■■■□□ 2.66
RPS2-208	ENST00000527871	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		31.66	■■■□□ 2.66
RPS2-208	ENST00000527871	PPIP5K2	O43314	1243 aa		31.65	■■■□□ 2.66
RPS2-208	ENST00000527871	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	31.65	■■■□□ 2.66
RPS2-208	ENST00000527871	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	31.65	■■■□□ 2.66
RPS2-208	ENST00000527871	EPS15	P42566	896 aa		31.65	■■■□□ 2.66
RPS2-208	ENST00000527871	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	31.65	■■■□□ 2.66
RPS2-208	ENST00000527871	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		31.64	■■■□□ 2.66
RPS2-208	ENST00000527871	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	31.64	■■■□□ 2.66
RPS2-208	ENST00000527871	GRAP	Q13588	217 aa		31.64	■■■□□ 2.66
RPS2-208	ENST00000527871	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	31.64	■■■□□ 2.66
RPS2-208	ENST00000527871	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	31.64	■■■□□ 2.66
RPS2-208	ENST00000527871	IFT57	Q9NWB7	429 aa		31.64	■■■□□ 2.66
RPS2-208	ENST00000527871	NIM1K	Q8IY84	436 aa		31.63	■■■□□ 2.65
RPS2-208	ENST00000527871	FAM89A	Q96GI7	184 aa		31.63	■■■□□ 2.65
RPS2-208	ENST00000527871	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		31.62	■■■□□ 2.65
RPS2-208	ENST00000527871	CNTNAP1	P78357	1384 aa		31.62	■■■□□ 2.65

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