RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518564.1

PPP2CB-204, Transcript of protein phosphatase 2 catalytic subunit beta, human

TSL 3 BASIC

Gene PPP2CB, Length 691 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP2CB-204	ENST00000518564	TCIRG1	Q13488	830 aa		40.76	■■■■■ 4.12
PPP2CB-204	ENST00000518564	CRY2	Q49AN0	593 aa		40.76	■■■■■ 4.12
PPP2CB-204	ENST00000518564	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		40.76	■■■■■ 4.12
PPP2CB-204	ENST00000518564	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	40.76	■■■■■ 4.12
PPP2CB-204	ENST00000518564	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		40.76	■■■■■ 4.12
PPP2CB-204	ENST00000518564	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		40.75	■■■■■ 4.11
PPP2CB-204	ENST00000518564	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		40.75	■■■■■ 4.11
PPP2CB-204	ENST00000518564	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	40.75	■■■■■ 4.11
PPP2CB-204	ENST00000518564	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		40.74	■■■■■ 4.11
PPP2CB-204	ENST00000518564	IL16	Q14005	1332 aa		40.73	■■■■■ 4.11
PPP2CB-204	ENST00000518564	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		40.73	■■■■■ 4.11
PPP2CB-204	ENST00000518564	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		40.73	■■■■■ 4.11
PPP2CB-204	ENST00000518564	CCDC93	Q567U6	631 aa		40.73	■■■■■ 4.11
PPP2CB-204	ENST00000518564	PRELP	P51888	382 aa		40.72	■■■■■ 4.11
PPP2CB-204	ENST00000518564	NLRP10	Q86W26	655 aa		40.72	■■■■■ 4.11
PPP2CB-204	ENST00000518564	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	40.7	■■■■■ 4.11
PPP2CB-204	ENST00000518564	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		40.7	■■■■■ 4.11
PPP2CB-204	ENST00000518564	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	40.7	■■■■■ 4.11
PPP2CB-204	ENST00000518564	GOLGA2	Q08379	1002 aa		40.69	■■■■■ 4.1
PPP2CB-204	ENST00000518564	KIF3C	O14782	793 aa		40.68	■■■■■ 4.1
PPP2CB-204	ENST00000518564	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		40.68	■■■■■ 4.1
PPP2CB-204	ENST00000518564	NLRP3	Q96P20	1036 aa		40.68	■■■■■ 4.1
PPP2CB-204	ENST00000518564	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	40.67	■■■■■ 4.1
PPP2CB-204	ENST00000518564	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		40.67	■■■■■ 4.1
PPP2CB-204	ENST00000518564	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	40.67	■■■■■ 4.1
PPP2CB-204	ENST00000518564	TSPYL6	Q8N831	410 aa		40.66	■■■■■ 4.1
PPP2CB-204	ENST00000518564	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		40.65	■■■■■ 4.1
PPP2CB-204	ENST00000518564	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	40.64	■■■■■ 4.1
PPP2CB-204	ENST00000518564	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		40.64	■■■■■ 4.1
PPP2CB-204	ENST00000518564	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		40.64	■■■■■ 4.1
PPP2CB-204	ENST00000518564	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	40.64	■■■■■ 4.1
PPP2CB-204	ENST00000518564	WDR63	Q8IWG1	891 aa		40.63	■■■■■ 4.09
PPP2CB-204	ENST00000518564	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		40.63	■■■■■ 4.09
PPP2CB-204	ENST00000518564	LAMB2	P55268	1798 aa		40.63	■■■■■ 4.09
PPP2CB-204	ENST00000518564	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		40.62	■■■■■ 4.09
PPP2CB-204	ENST00000518564	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	40.61	■■■■■ 4.09
PPP2CB-204	ENST00000518564	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		40.61	■■■■■ 4.09
PPP2CB-204	ENST00000518564	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		40.61	■■■■■ 4.09
PPP2CB-204	ENST00000518564	STK31	Q9BXU1	1019 aa		40.61	■■■■■ 4.09
PPP2CB-204	ENST00000518564	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		40.6	■■■■■ 4.09
PPP2CB-204	ENST00000518564	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	40.6	■■■■■ 4.09
PPP2CB-204	ENST00000518564	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		40.6	■■■■■ 4.09
PPP2CB-204	ENST00000518564	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	40.59	■■■■■ 4.09
PPP2CB-204	ENST00000518564	OLFM4	Q6UX06	510 aa		40.59	■■■■■ 4.09
PPP2CB-204	ENST00000518564	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	40.58	■■■■■ 4.09
PPP2CB-204	ENST00000518564	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	40.58	■■■■■ 4.09
PPP2CB-204	ENST00000518564	GLTPD2	A6NH11	291 aa		40.57	■■■■■ 4.09
PPP2CB-204	ENST00000518564	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		40.57	■■■■■ 4.09
PPP2CB-204	ENST00000518564	ZNF428	Q96B54	188 aa		40.57	■■■■■ 4.09
PPP2CB-204	ENST00000518564	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	40.56	■■■■■ 4.08
PPP2CB-204	ENST00000518564	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	40.56	■■■■■ 4.08
PPP2CB-204	ENST00000518564	SYNE4	Q8N205	404 aa		40.55	■■■■■ 4.08
PPP2CB-204	ENST00000518564	TOMM70	O94826	608 aa		40.54	■■■■■ 4.08
PPP2CB-204	ENST00000518564	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		40.54	■■■■■ 4.08
PPP2CB-204	ENST00000518564	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	40.53	■■■■■ 4.08
PPP2CB-204	ENST00000518564	RRAGC	Q9HB90	399 aa		40.53	■■■■■ 4.08
PPP2CB-204	ENST00000518564	ABCC4	O15439	1325 aa		40.52	■■■■■ 4.08
PPP2CB-204	ENST00000518564	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	40.52	■■■■■ 4.08
PPP2CB-204	ENST00000518564	MYD88	Q99836	296 aa		40.52	■■■■■ 4.08
PPP2CB-204	ENST00000518564	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	40.52	■■■■■ 4.08
PPP2CB-204	ENST00000518564	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		40.51	■■■■■ 4.08
PPP2CB-204	ENST00000518564	FAM89A	Q96GI7	184 aa		40.51	■■■■■ 4.08
PPP2CB-204	ENST00000518564	SNED1	Q8TER0	1413 aa		40.5	■■■■■ 4.07
PPP2CB-204	ENST00000518564	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	40.5	■■■■■ 4.07
PPP2CB-204	ENST00000518564	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	40.49	■■■■■ 4.07
PPP2CB-204	ENST00000518564	PSMD1	Q99460	953 aa		40.49	■■■■■ 4.07
PPP2CB-204	ENST00000518564	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		40.48	■■■■■ 4.07
PPP2CB-204	ENST00000518564	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	40.47	■■■■■ 4.07
PPP2CB-204	ENST00000518564	WDR90	Q96KV7	1748 aa		40.47	■■■■■ 4.07
PPP2CB-204	ENST00000518564	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	40.46	■■■■■ 4.07
PPP2CB-204	ENST00000518564	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	40.46	■■■■■ 4.07
PPP2CB-204	ENST00000518564	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		40.46	■■■■■ 4.07
PPP2CB-204	ENST00000518564	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		40.45	■■■■■ 4.07
PPP2CB-204	ENST00000518564	CACNA1F	O60840	1977 aa		40.44	■■■■■ 4.07
PPP2CB-204	ENST00000518564	SLC4A2	P04920	1241 aa		40.44	■■■■■ 4.06
PPP2CB-204	ENST00000518564	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	40.44	■■■■■ 4.06
PPP2CB-204	ENST00000518564	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	40.44	■■■■■ 4.06
PPP2CB-204	ENST00000518564	KSR2	Q6VAB6	950 aa		40.44	■■■■■ 4.06
PPP2CB-204	ENST00000518564	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	40.44	■■■■■ 4.06
PPP2CB-204	ENST00000518564	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		40.44	■■■■■ 4.06
PPP2CB-204	ENST00000518564	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	40.43	■■■■■ 4.06
PPP2CB-204	ENST00000518564	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	40.43	■■■■■ 4.06
PPP2CB-204	ENST00000518564	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	40.43	■■■■■ 4.06
PPP2CB-204	ENST00000518564	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	40.43	■■■■■ 4.06
PPP2CB-204	ENST00000518564	BBOX1	O75936	387 aa		40.42	■■■■■ 4.06
PPP2CB-204	ENST00000518564	GRAP	Q13588	217 aa		40.42	■■■■■ 4.06
PPP2CB-204	ENST00000518564	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	40.42	■■■■■ 4.06
PPP2CB-204	ENST00000518564	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		40.41	■■■■■ 4.06
PPP2CB-204	ENST00000518564	HSPA6	P17066	643 aa		40.41	■■■■■ 4.06
PPP2CB-204	ENST00000518564	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		40.41	■■■■■ 4.06
PPP2CB-204	ENST00000518564	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	40.41	■■■■■ 4.06
PPP2CB-204	ENST00000518564	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		40.4	■■■■■ 4.06
PPP2CB-204	ENST00000518564	VAMP4	O75379	141 aa		40.38	■■■■■ 4.05
PPP2CB-204	ENST00000518564	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	40.38	■■■■■ 4.05
PPP2CB-204	ENST00000518564	SLC51A	Q86UW1	340 aa		40.38	■■■■■ 4.05
PPP2CB-204	ENST00000518564	JDP2	Q8WYK2	163 aa		40.38	■■■■■ 4.05
PPP2CB-204	ENST00000518564	TAF1	P21675	1872 aa		40.38	■■■■■ 4.05
PPP2CB-204	ENST00000518564	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	40.37	■■■■■ 4.05
PPP2CB-204	ENST00000518564	FLII	Q13045	1269 aa		40.37	■■■■■ 4.05
PPP2CB-204	ENST00000518564	G2E3	Q7L622	706 aa		40.37	■■■■■ 4.05

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