RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495879.1

PTPRG-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRG, Length 3,011 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-207ENST00000495879 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.153e-6■■■□□ 16.2
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PTPRG-207ENST00000495879 KCNB2Q92953 911 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRG-207ENST00000495879 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRG-207ENST00000495879 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PTPRG-207ENST00000495879 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRG-207ENST00000495879 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 H3BQV1 296 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRG-207ENST00000495879 IFFO2Q5TF58 517 aa22.07■■□□□ 1.12
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