RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 BNIP3LO60238 219 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 GRNP28799 593 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 INPP5BP32019 993 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 ARSDP51689 593 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC27Q2M243 656 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 ALKBH2Q6NS38 261 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 RGL4Q8IZJ4 473 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 EDEM1Q92611 657 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 ABHD17AQ96GS6 310 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 GMCL1Q96IK5 515 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 BRD7Q9NPI1 651 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 HCN2Q9UL51 889 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 PDGFAP04085 211 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM157BP0CG42 384 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 MAPTP10636 758 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 MAPK1P28482 360 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 SV2AQ7L0J3 742 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 STRN4Q9NRL3 753 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 NDFIP2Q9NV92 336 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 POLIQ9UNA4 740 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 EFSO43281 561 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 MARSP56192 900 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 TNP2Q05952 138 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 GRIN2CQ14957 1233 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 DCTN4Q9UJW0 460 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 BRPF3Q9ULD4 1205 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 A6NHS1 94 aa5.78□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 NDUFB5O43674 189 aa5.78□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 CD33P20138 364 aa5.78□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 GSK3AP49840 483 aa5.78□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 PIK3R5Q8WYR1 880 aa5.78□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM13BQ9NYF5 915 aa5.78□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNMB2Q9Y691 235 aa5.78□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 EPB42P16452 691 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 FGFR3P22607 806 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 FOXR1Q6PIV2 292 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 TRERF1Q96PN7 1200 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 GGNBP2Q9H3C7 697 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNH4Q9UQ05 1017 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNQ4P56696 695 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 KRT76Q01546 638 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNMA1Q12791 1236 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 LAMC2Q13753 1193 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 C8orf34Q49A92 452 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 TMC7Q7Z402 723 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 GJD3Q8N144 294 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 TMC1Q8TDI8 760 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 CFHR5Q9BXR6 569 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 RBCK1Q9BYM8 510 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 MARK1Q9P0L2 795 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 PHF24Q9UPV7 400 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 UBAP1LF5GYI3 381 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 XYLBO75191 536 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 PCSK2P16519 638 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 CTBSQ01459 385 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 GAS6Q14393 721 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 KRT25Q7Z3Z0 450 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM129BQ96TA1 746 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC30A3Q99726 388 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 GPR182O15218 404 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 IGHA2P01877 340 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 USP5P45974 858 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 SPEM2Q0P670 501 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 ASB16Q96NS5 453 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 GSX2Q9BZM3 304 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 ANKRD33BA6NCL7 494 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 C2CD2LO14523 706 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 SASH3O75995 380 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 EGFRP00533 1210 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 MX2P20592 715 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 CCINQ13939 588 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 RNFT1Q5M7Z0 435 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM182BQ5T319 152 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 TTC16Q8NEE8 873 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 BHMTQ93088 406 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 CITED4Q96RK1 184 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM63CQ9P1W3 806 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-211ENST00000489450 BMP4P12644 408 aa5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 132 ms