RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487163.5

USP21-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP21, Length 2,514 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-208ENST00000487163 TCHHQ07283 1943 aa20.26■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 MRC1P22897 1456 aa20.26■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 LARGE1O95461 756 aa20.26■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 PKD1L3Q7Z443 1732 aa20.25■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa20.25■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 CCDC171Q6TFL3 1326 aa20.25■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 FSD1Q9BTV5 496 aa20.24■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 A0A087WZG4 1122 aa20.24■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 A0A0D9SFI3 127 aa20.24■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 NECTIN1Q15223 517 aa20.24■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 BRINP3Q76B58 766 aa20.23■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 PRDM11Q9NQV5 511 aa20.23■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa20.23■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 KCNJ4P48050 445 aa20.23■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 CPDO75976 1380 aa20.23■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.22■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 SYCE3A1L190 88 aa20.22■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa20.22■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 RBSNQ9H1K0 784 aa20.22■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 ABCC6O95255 1503 aa20.22■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 TFCP2Q12800 502 aa20.22■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 COPRSQ9NQ92 184 aa20.22■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 PDRG1Q9NUG6 133 aa20.22■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 ERBB4Q15303 1308 aa20.22■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 NBPF26B4DH59 902 aa20.21■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 NBPF14Q5TI25 921 aa20.21■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 NBPF15Q8N660 670 aa20.21■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 CREB3L3Q68CJ9 461 aa20.21■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 CCDC83Q8IWF9 413 aa20.21■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 MAP4K1Q92918 833 aa20.21■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa20.21■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 GLI3P10071 1580 aa20.21■□□□□ 0.83
USP21-208ENST00000487163 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa20.2■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.2■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 HIP1O00291 1037 aa20.19■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 SYT1P21579 422 aa20.19■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 TNNI3KQ59H18 835 aa20.19■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 VPS53Q5VIR6 699 aa20.19■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.19■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 KCNB2Q92953 911 aa20.19■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.19■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 TAF6LQ9Y6J9 622 aa20.19■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa20.19■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 WDR17Q8IZU2 1322 aa20.19■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 MBD3O95983 291 aa20.19■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 CHGBP05060 677 aa20.19■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.19■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 CASP7P55210 303 aa20.18■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 LMBR1LQ6UX01 489 aa20.18■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 USP48Q86UV5 1035 aa20.18■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 TCEANC2Q96MN5 208 aa20.18■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.18■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 ESPNB1AK53 854 aa20.18■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 SLC27A2O14975 620 aa20.18■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 A1BGP04217 495 aa20.18■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 TM6SF1Q9BZW5 370 aa20.18■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 STX6O43752 255 aa20.17■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.17■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 DBNDD2Q9BQY9 259 aa20.17■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa20.17■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa20.17■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 ST3GAL1Q11201 340 aa20.17■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 ME3Q16798 604 aa20.17■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.17■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 NECAB1Q8N987 351 aa20.17■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 LAMB4A4D0S4 1761 aa20.16■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 GJB2P29033 226 aa20.16■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 CNPY2Q9Y2B0 182 aa20.16■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 PPP1R9BQ96SB3 815 aa20.16■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 MED23Q9ULK4 1368 aa20.16■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 CLCN1P35523 988 aa20.15■□□□□ 0.82
USP21-208ENST00000487163 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms