RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SKIV2L-211ENST00000485349 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.23■■□□□ 1.15
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.23■■□□□ 1.15
SKIV2L-211ENST00000485349 SYNE4Q8N205 404 aa22.23■■□□□ 1.15
SKIV2L-211ENST00000485349 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SKIV2L-211ENST00000485349 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.22■■□□□ 1.15
SKIV2L-211ENST00000485349 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.22■■□□□ 1.15
SKIV2L-211ENST00000485349 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SKIV2L-211ENST00000485349 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.22■■□□□ 1.15
SKIV2L-211ENST00000485349 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SKIV2L-211ENST00000485349 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.22■■□□□ 1.15
SKIV2L-211ENST00000485349 PSMD1Q99460 953 aa22.21■■□□□ 1.15
SKIV2L-211ENST00000485349 NEUROD2Q15784 382 aa22.2■■□□□ 1.14
SKIV2L-211ENST00000485349 NECTIN2Q92692 538 aa22.2■■□□□ 1.14
SKIV2L-211ENST00000485349 FZD9O00144 591 aa22.19■■□□□ 1.14
SKIV2L-211ENST00000485349 PARP10Q53GL7 1025 aa22.19■■□□□ 1.14
SKIV2L-211ENST00000485349 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.19■■□□□ 1.14
SKIV2L-211ENST00000485349 KRT24Q2M2I5 525 aa22.18■■□□□ 1.14
SKIV2L-211ENST00000485349 LDHDQ86WU2 507 aa22.18■■□□□ 1.14
SKIV2L-211ENST00000485349 LTBP1Q14766 1721 aa22.17■■□□□ 1.14
SKIV2L-211ENST00000485349 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.17■■□□□ 1.14
SKIV2L-211ENST00000485349 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SKIV2L-211ENST00000485349 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.17■■□□□ 1.14
SKIV2L-211ENST00000485349 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SKIV2L-211ENST00000485349 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.17■■□□□ 1.14
SKIV2L-211ENST00000485349 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.17■■□□□ 1.14
SKIV2L-211ENST00000485349 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SKIV2L-211ENST00000485349 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
SKIV2L-211ENST00000485349 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SKIV2L-211ENST00000485349 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SKIV2L-211ENST00000485349 CREBZFQ9NS37 354 aa22.16■■□□□ 1.14
SKIV2L-211ENST00000485349 HACL1Q9UJ83 578 aa22.16■■□□□ 1.14
SKIV2L-211ENST00000485349 PASKQ96RG2 1323 aa22.15■■□□□ 1.14
SKIV2L-211ENST00000485349 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SKIV2L-211ENST00000485349 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SKIV2L-211ENST00000485349 COPS6Q7L5N1 327 aa22.15■■□□□ 1.14
SKIV2L-211ENST00000485349 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.15■■□□□ 1.14
SKIV2L-211ENST00000485349 RUNDC1Q96C34 613 aa22.15■■□□□ 1.14
SKIV2L-211ENST00000485349 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SKIV2L-211ENST00000485349 CHL1O00533 1208 aa22.14■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 EPHX2P34913 555 aa22.14■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 GPC2Q8N158 579 aa22.14■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 JDP2Q8WYK2 163 aa22.14■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 NLRP3Q96P20 1036 aa22.14■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 TAF1P21675 1872 aa22.13■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 ABCC4O15439 1325 aa22.13■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 NLRP10Q86W26 655 aa22.13■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.12■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.12■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.12■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.12■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.11■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.11■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.11■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.11■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 CNTNAP1P78357 1384 aa22.1■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.09■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF428Q96B54 188 aa22.09■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.09■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 TCIRG1Q13488 830 aa22.08■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 AOC3Q16853 763 aa22.08■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SKIV2L-211ENST00000485349 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.08■■□□□ 1.12
SKIV2L-211ENST00000485349 PPIP5K2O43314 1243 aa22.07■■□□□ 1.12
SKIV2L-211ENST00000485349 SCNN1DP51172 638 aa22.07■■□□□ 1.12
SKIV2L-211ENST00000485349 NIM1KQ8IY84 436 aa22.07■■□□□ 1.12
SKIV2L-211ENST00000485349 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SKIV2L-211ENST00000485349 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SKIV2L-211ENST00000485349 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.06■■□□□ 1.12
SKIV2L-211ENST00000485349 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.06■■□□□ 1.12
SKIV2L-211ENST00000485349 HOXB7P09629 217 aa22.06■■□□□ 1.12
SKIV2L-211ENST00000485349 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SKIV2L-211ENST00000485349 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.06■■□□□ 1.12
SKIV2L-211ENST00000485349 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SKIV2L-211ENST00000485349 CNTROBQ8N137 903 aa22.05■■□□□ 1.12
SKIV2L-211ENST00000485349 COL4A1P02462 1669 aa22.04■■□□□ 1.12
SKIV2L-211ENST00000485349 EPS15P42566 896 aa22.04■■□□□ 1.12
SKIV2L-211ENST00000485349 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.04■■□□□ 1.12
SKIV2L-211ENST00000485349 CFAP44Q96MT7 982 aa22.04■■□□□ 1.12
SKIV2L-211ENST00000485349 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SKIV2L-211ENST00000485349 MBIPQ9NS73 344 aa22.04■■□□□ 1.12
SKIV2L-211ENST00000485349 BBOX1O75936 387 aa22.03■■□□□ 1.12
SKIV2L-211ENST00000485349 GRAPQ13588 217 aa22.03■■□□□ 1.12
SKIV2L-211ENST00000485349 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SKIV2L-211ENST00000485349 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SKIV2L-211ENST00000485349 TNS4Q8IZW8 715 aa22.03■■□□□ 1.12
SKIV2L-211ENST00000485349 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SKIV2L-211ENST00000485349 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SKIV2L-211ENST00000485349 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.02■■□□□ 1.12
SKIV2L-211ENST00000485349 SP8Q8IXZ3 490 aa22.02■■□□□ 1.12
SKIV2L-211ENST00000485349 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91 ms