RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484266.5

CHKB-210, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-210ENST00000484266 ERFEQ4G0M1 354 aa41.98■■■■■ 4.31
CHKB-210ENST00000484266 CHRNA5P30532 468 aa41.97■■■■■ 4.31
CHKB-210ENST00000484266 SMC4Q9NTJ3 1288 aa41.97■■■■■ 4.31
CHKB-210ENST00000484266 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
CHKB-210ENST00000484266 KCNA3P22001 575 aa41.96■■■■■ 4.31
CHKB-210ENST00000484266 PDE6BP35913 854 aa41.96■■■■■ 4.31
CHKB-210ENST00000484266 RNF123Q5XPI4 1314 aa41.96■■■■■ 4.31
CHKB-210ENST00000484266 RARSP54136 660 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
CHKB-210ENST00000484266 DNAAF4Q8WXU2 420 aa41.95■■■■■ 4.31
CHKB-210ENST00000484266 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
CHKB-210ENST00000484266 RIC1Q4ADV7 1423 aa41.93■■■■■ 4.3
CHKB-210ENST00000484266 F6X3S4 739 aa41.93■■■■■ 4.3
CHKB-210ENST00000484266 IGKV5-2P06315 115 aa41.93■■■■■ 4.3
CHKB-210ENST00000484266 NEXNQ0ZGT2 675 aa41.93■■■■■ 4.3
CHKB-210ENST00000484266 C2CD5Q86YS7 1000 aa41.93■■■■■ 4.3
CHKB-210ENST00000484266 CCDC191Q8NCU4 936 aa41.92■■■■■ 4.3
CHKB-210ENST00000484266 PTPRCP08575 1304 aa41.9■■■■■ 4.3
CHKB-210ENST00000484266 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP41.9■■■■■ 4.3
CHKB-210ENST00000484266 WWC3Q9ULE0 1092 aa41.9■■■■■ 4.3
CHKB-210ENST00000484266 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa41.9■■■■■ 4.3
CHKB-210ENST00000484266 SH3TC1Q8TE82 1336 aa41.9■■■■■ 4.3
CHKB-210ENST00000484266 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP41.89■■■■■ 4.3
CHKB-210ENST00000484266 H0YIN7 160 aa41.89■■■■■ 4.3
CHKB-210ENST00000484266 SYNE4Q8N205 404 aa41.89■■■■■ 4.3
CHKB-210ENST00000484266 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
CHKB-210ENST00000484266 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP41.88■■■■■ 4.3
CHKB-210ENST00000484266 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.29
CHKB-210ENST00000484266 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP41.87■■■■■ 4.29
CHKB-210ENST00000484266 SLC10A5Q5PT55 438 aa41.87■■■■■ 4.29
CHKB-210ENST00000484266 NEURL1BA8MQ27 555 aa41.86■■■■■ 4.29
CHKB-210ENST00000484266 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP41.86■■■■■ 4.29
CHKB-210ENST00000484266 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP41.86■■■■■ 4.29
CHKB-210ENST00000484266 FAM89AQ96GI7 184 aa41.86■■■■■ 4.29
CHKB-210ENST00000484266 PIM2Q9P1W9 311 aa41.86■■■■■ 4.29
CHKB-210ENST00000484266 LAMB2P55268 1798 aa41.85■■■■■ 4.29
CHKB-210ENST00000484266 SRGNP10124 158 aa41.85■■■■■ 4.29
CHKB-210ENST00000484266 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP41.85■■■■■ 4.29
CHKB-210ENST00000484266 LINS1Q8NG48 757 aa41.85■■■■■ 4.29
CHKB-210ENST00000484266 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP41.84■■■■■ 4.29
CHKB-210ENST00000484266 GPR162Q16538 588 aa41.83■■■■■ 4.29
CHKB-210ENST00000484266 BEND3Q5T5X7 828 aa41.82■■■■■ 4.29
CHKB-210ENST00000484266 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa41.81■■■■■ 4.28
CHKB-210ENST00000484266 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP41.81■■■■■ 4.28
CHKB-210ENST00000484266 CRY2Q49AN0 593 aa41.81■■■■■ 4.28
CHKB-210ENST00000484266 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP41.81■■■■■ 4.28
CHKB-210ENST00000484266 C3orf67Q6ZVT6 689 aa41.81■■■■■ 4.28
CHKB-210ENST00000484266 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP41.81■■■■■ 4.28
CHKB-210ENST00000484266 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
CHKB-210ENST00000484266 CACNA1SQ13698 1873 aa41.8■■■■■ 4.28
CHKB-210ENST00000484266 DCAF8L1A6NGE4 600 aa41.79■■■■■ 4.28
CHKB-210ENST00000484266 BCAR3O75815 825 aa41.79■■■■■ 4.28
CHKB-210ENST00000484266 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP41.79■■■■■ 4.28
CHKB-210ENST00000484266 MASTLQ96GX5 879 aa41.79■■■■■ 4.28
CHKB-210ENST00000484266 BCS1LQ9Y276 419 aa41.79■■■■■ 4.28
CHKB-210ENST00000484266 KIF16BQ96L93 1317 aa41.79■■■■■ 4.28
CHKB-210ENST00000484266 STYK1Q6J9G0 422 aa41.78■■■■■ 4.28
CHKB-210ENST00000484266 SLC4A10Q6U841 1118 aa41.78■■■■■ 4.28
CHKB-210ENST00000484266 NLRP3Q96P20 1036 aa41.78■■■■■ 4.28
CHKB-210ENST00000484266 GCKRQ14397 625 aa41.78■■■■■ 4.28
CHKB-210ENST00000484266 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
CHKB-210ENST00000484266 NPR1P16066 1061 aa41.77■■■■■ 4.28
CHKB-210ENST00000484266 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
CHKB-210ENST00000484266 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.28
CHKB-210ENST00000484266 TTLL6Q8N841 843 aa41.76■■■■■ 4.28
CHKB-210ENST00000484266 SLX4Q8IY92 1834 aa41.73■■■■■ 4.27
CHKB-210ENST00000484266 CDHR2Q9BYE9 1310 aa41.72■■■■■ 4.27
CHKB-210ENST00000484266 CNKSR1Q969H4 720 aa41.72■■■■■ 4.27
CHKB-210ENST00000484266 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa41.72■■■■■ 4.27
CHKB-210ENST00000484266 H7C1W4 665 aa41.71■■■■■ 4.27
CHKB-210ENST00000484266 ALDH1L1O75891 902 aa41.71■■■■■ 4.27
CHKB-210ENST00000484266 ARHGAP45Q92619 1136 aa41.7■■■■■ 4.27
CHKB-210ENST00000484266 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP41.7■■■■■ 4.27
CHKB-210ENST00000484266 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP41.7■■■■■ 4.27
CHKB-210ENST00000484266 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.27
CHKB-210ENST00000484266 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa41.69■■■■■ 4.27
CHKB-210ENST00000484266 UTRNP46939 3433 aa41.68■■■■■ 4.26
CHKB-210ENST00000484266 MYH3P11055 1940 aa41.68■■■■■ 4.26
CHKB-210ENST00000484266 GRIN3BO60391 1043 aa41.68■■■■■ 4.26
CHKB-210ENST00000484266 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
CHKB-210ENST00000484266 CASP7P55210 303 aa41.67■■■■■ 4.26
CHKB-210ENST00000484266 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
CHKB-210ENST00000484266 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
CHKB-210ENST00000484266 PDE8AO60658 829 aa41.65■■■■■ 4.26
CHKB-210ENST00000484266 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
CHKB-210ENST00000484266 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
CHKB-210ENST00000484266 ALDH1B1P30837 517 aa41.64■■■■■ 4.26
CHKB-210ENST00000484266 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
CHKB-210ENST00000484266 CRAMP1Q96RY5 1269 aa41.63■■■■■ 4.26
CHKB-210ENST00000484266 GRM8O00222 908 aa41.62■■■■■ 4.25
CHKB-210ENST00000484266 TAF1P21675 1872 aa41.62■■■■■ 4.25
CHKB-210ENST00000484266 TRIM27P14373 513 aa41.61■■■■■ 4.25
CHKB-210ENST00000484266 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa41.61■■■■■ 4.25
CHKB-210ENST00000484266 ABCC4O15439 1325 aa41.6■■■■■ 4.25
CHKB-210ENST00000484266 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
CHKB-210ENST00000484266 PLA2G12BQ9BX93 195 aa41.59■■■■■ 4.25
CHKB-210ENST00000484266 RCAN3Q9UKA8 241 aa41.59■■■■■ 4.25
CHKB-210ENST00000484266 TNNQ9UQP3 1299 aa41.59■■■■■ 4.25
CHKB-210ENST00000484266 CCT4P50991 539 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
CHKB-210ENST00000484266 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa41.58■■■■■ 4.25
CHKB-210ENST00000484266 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
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