RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469059.1

EPC1-205, Transcript of enhancer of polycomb homolog 1, humanhuman

TSL 5

Gene EPC1, Length 591 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPC1-205ENST00000469059 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.61■■□□□ 1.05
EPC1-205ENST00000469059 EPHX2P34913 555 aa21.61■■□□□ 1.05
EPC1-205ENST00000469059 PSMD1Q99460 953 aa21.61■■□□□ 1.05
EPC1-205ENST00000469059 GJA3Q9Y6H8 435 aa21.61■■□□□ 1.05
EPC1-205ENST00000469059 PCNTO95613 3336 aa21.61■■□□□ 1.05
EPC1-205ENST00000469059 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.61■■□□□ 1.05
EPC1-205ENST00000469059 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.6■■□□□ 1.05
EPC1-205ENST00000469059 FZD9O00144 591 aa21.6■■□□□ 1.05
EPC1-205ENST00000469059 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.6■■□□□ 1.05
EPC1-205ENST00000469059 RALBP1Q15311 655 aa21.6■■□□□ 1.05
EPC1-205ENST00000469059 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
EPC1-205ENST00000469059 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.6■■□□□ 1.05
EPC1-205ENST00000469059 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
EPC1-205ENST00000469059 NEUROD2Q15784 382 aa21.59■■□□□ 1.05
EPC1-205ENST00000469059 PARP10Q53GL7 1025 aa21.59■■□□□ 1.05
EPC1-205ENST00000469059 GPC2Q8N158 579 aa21.59■■□□□ 1.05
EPC1-205ENST00000469059 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.59■■□□□ 1.05
EPC1-205ENST00000469059 NECTIN2Q92692 538 aa21.59■■□□□ 1.05
EPC1-205ENST00000469059 NLRP3Q96P20 1036 aa21.59■■□□□ 1.05
EPC1-205ENST00000469059 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.59■■□□□ 1.05
EPC1-205ENST00000469059 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
EPC1-205ENST00000469059 NTSR2O95665 410 aa21.58■■□□□ 1.05
EPC1-205ENST00000469059 ANXA1P04083 346 aa21.58■■□□□ 1.05
EPC1-205ENST00000469059 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
EPC1-205ENST00000469059 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
EPC1-205ENST00000469059 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.58■■□□□ 1.05
EPC1-205ENST00000469059 CRAMP1Q96RY5 1269 aa21.58■■□□□ 1.05
EPC1-205ENST00000469059 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
EPC1-205ENST00000469059 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.57■■□□□ 1.04
EPC1-205ENST00000469059 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
EPC1-205ENST00000469059 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
EPC1-205ENST00000469059 NUP98P52948 1817 aa21.57■■□□□ 1.04
EPC1-205ENST00000469059 PASKQ96RG2 1323 aa21.56■■□□□ 1.04
EPC1-205ENST00000469059 CNTROBQ8N137 903 aa21.56■■□□□ 1.04
EPC1-205ENST00000469059 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
EPC1-205ENST00000469059 SCN4AP35499 1836 aa21.56■■□□□ 1.04
EPC1-205ENST00000469059 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
EPC1-205ENST00000469059 NIM1KQ8IY84 436 aa21.55■■□□□ 1.04
EPC1-205ENST00000469059 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.55■■□□□ 1.04
EPC1-205ENST00000469059 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
EPC1-205ENST00000469059 PDIA6Q15084 440 aa21.54■■□□□ 1.04
EPC1-205ENST00000469059 PROSER3Q2NL68 480 aa21.54■■□□□ 1.04
EPC1-205ENST00000469059 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.54■■□□□ 1.04
EPC1-205ENST00000469059 COPS6Q7L5N1 327 aa21.54■■□□□ 1.04
EPC1-205ENST00000469059 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.54■■□□□ 1.04
EPC1-205ENST00000469059 CNTNAP1P78357 1384 aa21.53■■□□□ 1.04
EPC1-205ENST00000469059 PPIP5K2O43314 1243 aa21.53■■□□□ 1.04
EPC1-205ENST00000469059 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
EPC1-205ENST00000469059 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.53■■□□□ 1.04
EPC1-205ENST00000469059 AIDAQ96BJ3 306 aa21.53■■□□□ 1.04
EPC1-205ENST00000469059 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
EPC1-205ENST00000469059 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.52■■□□□ 1.04
EPC1-205ENST00000469059 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.52■■□□□ 1.04
EPC1-205ENST00000469059 VEGFBP49765 207 aa21.51■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 AOC3Q16853 763 aa21.5■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.5■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.5■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 SLC51AQ86UW1 340 aa21.5■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.5■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 EPS15P42566 896 aa21.49■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 SUPT20HQ8NEM7 779 aa21.49■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 SNED1Q8TER0 1413 aa21.48■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 BBOX1O75936 387 aa21.48■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 TCIRG1Q13488 830 aa21.48■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.48■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 NLRP10Q86W26 655 aa21.48■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 ZNF428Q96B54 188 aa21.48■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 ABCC4O15439 1325 aa21.48■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 FOXN1O15353 648 aa21.47■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 KRT24Q2M2I5 525 aa21.47■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 MPNDQ8N594 471 aa21.47■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 RUNDC1Q96C34 613 aa21.47■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 VPS33BQ9H267 617 aa21.47■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 CHL1O00533 1208 aa21.46■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 SCNN1DP51172 638 aa21.46■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.46■■□□□ 1.03
EPC1-205ENST00000469059 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.45■■□□□ 1.02
EPC1-205ENST00000469059 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
EPC1-205ENST00000469059 SP8Q8IXZ3 490 aa21.45■■□□□ 1.02
EPC1-205ENST00000469059 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.45■■□□□ 1.02
EPC1-205ENST00000469059 ZNRF3Q9ULT6 936 aa21.45■■□□□ 1.02
EPC1-205ENST00000469059 COL4A5P29400 1685 aa21.44■■□□□ 1.02
EPC1-205ENST00000469059 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
EPC1-205ENST00000469059 RASSF10A6NK89 507 aa21.43■■□□□ 1.02
EPC1-205ENST00000469059 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.43■■□□□ 1.02
EPC1-205ENST00000469059 CXCL9Q07325 125 aa21.42■■□□□ 1.02
EPC1-205ENST00000469059 GRM1Q13255 1194 aa21.42■■□□□ 1.02
EPC1-205ENST00000469059 GRAPQ13588 217 aa21.42■■□□□ 1.02
EPC1-205ENST00000469059 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.42■■□□□ 1.02
EPC1-205ENST00000469059 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
EPC1-205ENST00000469059 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
EPC1-205ENST00000469059 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 118.5 ms