RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
ACTB-207ENST00000462494 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 GCKRQ14397 625 aa20.33■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 FSD1Q9BTV5 496 aa20.33■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 TSPY26PQ9H489 355 aa20.33■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 NECTIN1Q15223 517 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 TCHHQ07283 1943 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 HIP1O00291 1037 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 GJB2P29033 226 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 EPHA10Q5JZY3 1008 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 CREB3L3Q68CJ9 461 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 CABLES1Q8TDN4 633 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 PDLIM2Q96JY6 352 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 USP16Q9Y5T5 823 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 IFNL2Q8IZJ0 200 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 TM6SF1Q9BZW5 370 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 A0A0D9SFI3 127 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 PHF14O94880 888 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 F13A1P00488 732 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 ATF3P18847 181 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 CHRNA2Q15822 529 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 C5P01031 1676 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 KCNB2Q92953 911 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 ADAMTSL3P82987 1691 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 FIBPO43427 364 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 NECAB1Q8N987 351 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 MAP4K1Q92918 833 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 MEGF6O75095 1541 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 KIF1AQ12756 1690 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 ME3Q16798 604 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 SLC27A2O14975 620 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 HS1BP3Q53T59 392 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 TMEM87AQ8NBN3 555 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ACTB-207ENST00000462494 LMTK3Q96Q04 1460 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 PSMA5P28066 241 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 DCAF5Q96JK2 942 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 TCEANC2Q96MN5 208 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 TPCN1Q9ULQ1 816 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 CYP27B1O15528 508 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 FMNL2Q96PY5 1086 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 MTMR6Q9Y217 621 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 ALS2Q96Q42 1657 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 UBE2HP62256 183 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 ST3GAL1Q11201 340 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 CCDC183Q5T5S1 534 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 RNF20Q5VTR2 975 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 CABP4P57796 275 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 TFCP2Q12800 502 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 TAF6LQ9Y6J9 622 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 A0A087WZG4 1122 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 COPRSQ9NQ92 184 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 TNNI3KQ59H18 835 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 MST1RQ04912 1400 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 SNRKQ9NRH2 765 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 TMEM94Q12767 1356 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 MED23Q9ULK4 1368 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-207ENST00000462494 ATP5JP18859 108 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 RPS6KB1P23443 525 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 STK3Q13188 491 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 TAF5LO75529 589 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 ANKRD1Q15327 319 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-207ENST00000462494 FERMT3Q86UX7 667 aa20.19■□□□□ 0.82
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