RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443090.1

GCSHP5-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 5, humanhuman

BASIC

Gene GCSHP5, Length 522 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP5-201ENST00000443090 COL4A5P29400 1685 aa26.22■■□□□ 1.79
GCSHP5-201ENST00000443090 NTSR2O95665 410 aa26.22■■□□□ 1.79
GCSHP5-201ENST00000443090 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.22■■□□□ 1.79
GCSHP5-201ENST00000443090 HACL1Q9UJ83 578 aa26.22■■□□□ 1.79
GCSHP5-201ENST00000443090 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
GCSHP5-201ENST00000443090 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
GCSHP5-201ENST00000443090 PDIA6Q15084 440 aa26.2■■□□□ 1.78
GCSHP5-201ENST00000443090 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
GCSHP5-201ENST00000443090 CNTNAP1P78357 1384 aa26.2■■□□□ 1.78
GCSHP5-201ENST00000443090 EPHX2P34913 555 aa26.19■■□□□ 1.78
GCSHP5-201ENST00000443090 GPC2Q8N158 579 aa26.19■■□□□ 1.78
GCSHP5-201ENST00000443090 CRAMP1Q96RY5 1269 aa26.19■■□□□ 1.78
GCSHP5-201ENST00000443090 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.19■■□□□ 1.78
GCSHP5-201ENST00000443090 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.18■■□□□ 1.78
GCSHP5-201ENST00000443090 RIPK4P57078 832 aa26.18■■□□□ 1.78
GCSHP5-201ENST00000443090 GRIPAP1Q4V328 841 aa26.18■■□□□ 1.78
GCSHP5-201ENST00000443090 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
GCSHP5-201ENST00000443090 C3orf67Q6ZVT6 689 aa26.18■■□□□ 1.78
GCSHP5-201ENST00000443090 TNS4Q8IZW8 715 aa26.18■■□□□ 1.78
GCSHP5-201ENST00000443090 RALBP1Q15311 655 aa26.17■■□□□ 1.78
GCSHP5-201ENST00000443090 PARP10Q53GL7 1025 aa26.17■■□□□ 1.78
GCSHP5-201ENST00000443090 JDP2Q8WYK2 163 aa26.17■■□□□ 1.78
GCSHP5-201ENST00000443090 PROSER3Q2NL68 480 aa26.16■■□□□ 1.78
GCSHP5-201ENST00000443090 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.16■■□□□ 1.78
GCSHP5-201ENST00000443090 SLC51AQ86UW1 340 aa26.16■■□□□ 1.78
GCSHP5-201ENST00000443090 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
GCSHP5-201ENST00000443090 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
GCSHP5-201ENST00000443090 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26.15■■□□□ 1.78
GCSHP5-201ENST00000443090 LTBP1Q14766 1721 aa26.14■■□□□ 1.78
GCSHP5-201ENST00000443090 TMEM88BA6NKF7 163 aa26.14■■□□□ 1.78
GCSHP5-201ENST00000443090 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
GCSHP5-201ENST00000443090 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
GCSHP5-201ENST00000443090 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
GCSHP5-201ENST00000443090 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.13■■□□□ 1.77
GCSHP5-201ENST00000443090 SLC10A5Q5PT55 438 aa26.13■■□□□ 1.77
GCSHP5-201ENST00000443090 CLEC11AQ9Y240 323 aa26.13■■□□□ 1.77
GCSHP5-201ENST00000443090 ANXA1P04083 346 aa26.12■■□□□ 1.77
GCSHP5-201ENST00000443090 EIF6P56537 245 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
GCSHP5-201ENST00000443090 NLRP3Q96P20 1036 aa26.12■■□□□ 1.77
GCSHP5-201ENST00000443090 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
GCSHP5-201ENST00000443090 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.11■■□□□ 1.77
GCSHP5-201ENST00000443090 LAMB2P55268 1798 aa26.1■■□□□ 1.77
GCSHP5-201ENST00000443090 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
GCSHP5-201ENST00000443090 CNTROBQ8N137 903 aa26.1■■□□□ 1.77
GCSHP5-201ENST00000443090 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.1■■□□□ 1.77
GCSHP5-201ENST00000443090 SCNN1DP51172 638 aa26.09■■□□□ 1.77
GCSHP5-201ENST00000443090 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.09■■□□□ 1.77
GCSHP5-201ENST00000443090 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
GCSHP5-201ENST00000443090 VEGFBP49765 207 aa26.08■■□□□ 1.77
GCSHP5-201ENST00000443090 ABCC4O15439 1325 aa26.08■■□□□ 1.77
GCSHP5-201ENST00000443090 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.07■■□□□ 1.76
GCSHP5-201ENST00000443090 COPS6Q7L5N1 327 aa26.07■■□□□ 1.76
GCSHP5-201ENST00000443090 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.07■■□□□ 1.76
GCSHP5-201ENST00000443090 CHL1O00533 1208 aa26.06■■□□□ 1.76
GCSHP5-201ENST00000443090 CAPN15O75808 1086 aa26.06■■□□□ 1.76
GCSHP5-201ENST00000443090 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
GCSHP5-201ENST00000443090 NLRP10Q86W26 655 aa26.06■■□□□ 1.76
GCSHP5-201ENST00000443090 NIM1KQ8IY84 436 aa26.06■■□□□ 1.76
GCSHP5-201ENST00000443090 VPS33BQ9H267 617 aa26.06■■□□□ 1.76
GCSHP5-201ENST00000443090 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
GCSHP5-201ENST00000443090 RASSF10A6NK89 507 aa26.05■■□□□ 1.76
GCSHP5-201ENST00000443090 FOXN1O15353 648 aa26.05■■□□□ 1.76
GCSHP5-201ENST00000443090 PPIP5K2O43314 1243 aa26.05■■□□□ 1.76
GCSHP5-201ENST00000443090 EPS15P42566 896 aa26.05■■□□□ 1.76
GCSHP5-201ENST00000443090 NECTIN2Q92692 538 aa26.05■■□□□ 1.76
GCSHP5-201ENST00000443090 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
GCSHP5-201ENST00000443090 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.05■■□□□ 1.76
GCSHP5-201ENST00000443090 KRT24Q2M2I5 525 aa26.04■■□□□ 1.76
GCSHP5-201ENST00000443090 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.04■■□□□ 1.76
GCSHP5-201ENST00000443090 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
GCSHP5-201ENST00000443090 TCIRG1Q13488 830 aa26.03■■□□□ 1.76
GCSHP5-201ENST00000443090 AOC3Q16853 763 aa26.03■■□□□ 1.76
GCSHP5-201ENST00000443090 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.03■■□□□ 1.76
GCSHP5-201ENST00000443090 BBOX1O75936 387 aa26.02■■□□□ 1.76
GCSHP5-201ENST00000443090 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
GCSHP5-201ENST00000443090 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
GCSHP5-201ENST00000443090 NEUROD2Q15784 382 aa26.01■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 SUPT20HQ8NEM7 779 aa26.01■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 RUNDC1Q96C34 613 aa26.01■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 SH3TC1Q8TE82 1336 aa26■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 DEFB115Q30KQ5 88 aa26■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 SP8Q8IXZ3 490 aa26■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 PRDM10Q9NQV6 1147 aa26■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 WBP1LQ9NX94 342 aa26■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 CHPF2Q9P2E5 772 aa25.99■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 ZNRF3Q9ULT6 936 aa25.99■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 TAF1P21675 1872 aa25.98■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 LRRC37AA6NMS7 1700 aa25.98■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 HOXB7P09629 217 aa25.98■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 CXCL9Q07325 125 aa25.98■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 AIDAQ96BJ3 306 aa25.98■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 GPRC5DQ9NZD1 345 aa25.98■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.98■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 THSD7BQ9C0I4 1608 aa25.97■■□□□ 1.75
GCSHP5-201ENST00000443090 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 169.9 ms