RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 PDCL2Q8N4E4 241 aa21.85■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD24Q8TF21 1146 aa21.85■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 LGR6Q9HBX8 967 aa21.85■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 MTMR6Q9Y217 621 aa21.85■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNQ3O43525 872 aa21.84■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.84■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.84■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 CABLES1Q8TDN4 633 aa21.84■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD7Q92527 254 aa21.84■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 SPC24Q8NBT2 197 aa21.83■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 TTC41PQ6P2S7 1318 aa21.83■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.83■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 ST3GAL1Q11201 340 aa21.83■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa21.83■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.83■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 ALS2Q96Q42 1657 aa21.83■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa21.82■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 VPS53Q5VIR6 699 aa21.82■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa21.82■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 DCCP43146 1447 aa21.82■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 ADCY9O60503 1353 aa21.81■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 CTIFO43310 598 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 NECAB1Q8N987 351 aa21.81■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.81■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 ME3Q16798 604 aa21.81■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.81■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa21.81■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.81■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 ECHDC1Q9NTX5 307 aa21.8■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 STRCQ7RTU9 1775 aa21.8■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 RGPD5Q99666 1765 aa21.8■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC192P0DO97 292 aa21.8■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 KIF20AO95235 890 aa21.77■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 NECTIN1Q15223 517 aa21.77■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa21.77■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.77■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.77■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 PXDNQ92626 1479 aa21.77■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 MTX1Q13505 466 aa21.77■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 FERMT3Q86UX7 667 aa21.77■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.77■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC171Q6TFL3 1326 aa21.77■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 NPHP3Q7Z494 1330 aa21.77■■□□□ 1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 PTGS1P23219 599 aa21.76■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM173BQ6P4H8 233 aa21.76■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM227BQ96M60 508 aa21.76■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 HOXB7P09629 217 aa21.76■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 AACSQ86V21 672 aa21.76■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNB2Q92953 911 aa21.76■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 ERBB3P21860 1342 aa21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNJ4P48050 445 aa21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 CDC37L1Q7L3B6 337 aa21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 TTC6Q86TZ1 520 aa21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM200AQ8TCP9 573 aa21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 NCAPD2Q15021 1401 aa21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 BTBD11A6QL63 1104 aa21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 CHRNA2Q15822 529 aa21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 GPATCH3Q96I76 525 aa21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 TEFQ10587 303 aa21.74■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 PROSER3Q2NL68 480 aa21.74■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 BRINP3Q76B58 766 aa21.74■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 EVI5LQ96CN4 794 aa21.74■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 TCEANC2Q96MN5 208 aa21.74■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 PODXL2Q9NZ53 605 aa21.74■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.74■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 CAMK4Q16566 473 aa21.74■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.74■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.73■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 MAP3K11Q16584 847 aa21.73■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 TNS3Q68CZ2 1445 aa21.73■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 TYRO3Q06418 890 aa21.72■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 FEZ1Q99689 392 aa21.72■■□□□ 1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms