RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404125.5

PSME4-202, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PSME4, Length 7,099 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-202ENST00000404125 PSMD1Q99460 953 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 TSPY3P0CV98 308 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 TSPY8P0CW00 308 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 MFSD6Q6ZSS7 791 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 CFAP100Q494V2 611 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 CDKL5O76039 1030 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 EIF5P55010 431 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 ALDH1L2Q3SY69 923 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 CATIPQ7Z7H3 387 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 PODXL2Q9NZ53 605 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 KIAA0556O60303 1618 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 A0A1W2PP64 1363 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 MCM2P49736 904 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 KAT14Q9H8E8 782 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 SDSP20132 328 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 TIMM10P62072 90 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 SMARCE1Q969G3 411 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 GRM8O00222 908 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 STIM1Q13586 685 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 NLRP3Q96P20 1036 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 CCDC39Q9UFE4 941 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 NEFHP12036 1026 aa15.92■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 PARP3Q9Y6F1 533 aa15.92■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 JMYQ8N9B5 988 aa15.92■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.92■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 SORBS3O60504 671 aa15.92■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 USP8P40818 1118 aa15.92■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 TCP10Q12799 353 aa15.92■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 AFMP43652 599 aa15.91■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 RHPN1Q8TCX5 695 aa15.91■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 DUOX2Q9NRD8 1548 aa15.91■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 ECHDC1Q9NTX5 307 aa15.91■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.147e-6■□□□□ 8.3
PSME4-202ENST00000404125 MAP3K19Q56UN5 1328 aa15.91■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 PIK3R4Q99570 1358 aa15.91■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 ATP2B3Q16720 1220 aa15.9■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 AKAP4Q5JQC9 854 aa15.9■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP15.9■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 DPH6Q7L8W6 267 aa15.9■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 EVI5LQ96CN4 794 aa15.9■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 IDEP14735 1019 aa15.9■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 PTPRCP08575 1304 aa15.9■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 C19orf44Q9H6X5 657 aa15.9■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 RAB3GAP1Q15042 981 aa15.9■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 TBC1D2Q9BYX2 928 aa15.9■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 CUL5Q93034 780 aa15.89■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 GRPEL1Q9HAV7 217 aa15.89■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.14
PSME4-202ENST00000404125 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa15.89■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 MACROD2A1Z1Q3 448 aa15.89■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 KIAA1328Q86T90 577 aa15.89■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 CFAP45Q9UL16 551 aa15.89■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 KCNQ3O43525 872 aa15.89■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 MRE11P49959 708 aa15.89■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 GPIHBP1Q8IV16 184 aa15.89■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 USP21Q9UK80 565 aa15.89■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 KRT32Q14532 448 aa15.89■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 CCDC181Q5TID7 509 aa15.89■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 APBA3O96018 575 aa15.89■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 Q6ZUG5 572 aa15.89■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa15.88■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 FAM212AQ96EL1 285 aa15.88■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 BRF1Q92994 677 aa15.88■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 NEK1Q96PY6 1258 aa15.88■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa15.88■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 RNMTO43148 476 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 TAX1BP1Q86VP1 789 aa15.88■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa15.88■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 CALM1P0DP23 149 aa15.88■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 CALM2P0DP24 149 aa15.88■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 CALM3P0DP25 149 aa15.88■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 GPS2Q13227 327 aa15.88■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 TCERG1LQ5VWI1 586 aa15.88■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 MYO1BO43795 1136 aa15.87■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 FSIP1Q8NA03 581 aa15.87■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 CNNM3Q8NE01 707 aa15.87■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 TTC22Q5TAA0 569 aa15.87■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 TRAPPC3LQ5T215 181 aa15.87■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 MCM9Q9NXL9 1143 aa15.87■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 MBD3O95983 291 aa15.86■□□□□ 0.13
PSME4-202ENST00000404125 MCM4P33991 863 aa15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms